2024/04/11 更新
博士（工学） （ 早稲田大学 ）
修士（工学） （ 早稲田大学 ）
早稲田大学 先進理工学研究科 生命医科学専攻 博士 修了
早稲田大学 先進理工学研究科 生命医科学専攻 修士 修了
早稲田大学 理工学部 応用化学科 卒業
2020年4月 - 現在
中央大学 理工学部 助教
2019年1月 - 現在
早稲田大学 ナノ・ライフ創新研究機構 未来イノベーション研究所 招聘研究員
2019年1月 - 2020年3月
国立研究開発法人 産業技術総合研究所 バイオメディカル研究部門 特別研究員
2018年4月 - 2018年12月
早稲田大学 ナノ・ライフ創新研究機構 ライフサポートイノベーション研究所 次席研究員（研究院講師）
2018年1月 - 2018年12月
デンマーク工科大学 環境工学部 客員研究員
2016年4月 - 2018年3月
早稲田大学 ナノ・ライフ創新研究機構 ライフサポートイノベーション研究所 次席研究員
2013年4月 - 2016年3月
早稲田大学 先進理工学部生命医科学科 助手
環境バイオテクノロジー学会
国際微生物生態学会
日本水環境学会
日本微生物生態学会
日本ゲノム微生物学会
亜硝酸酸化
排水
培養
硝化
硝化菌
生理生態
微生物生態
環境微生物
微生物間相互作用
土壌
分離
窒素循環
ゲノム
アンモニア酸化
従属栄養
独立栄養
ものづくり技術（機械・電気電子・化学工学） / バイオ機能応用、バイオプロセス工学 / 生物機能・バイオプロセス
ライフサイエンス / 生態学、環境学
ライフサイエンス / 応用微生物学
ライフサイエンス / 多様性生物学、分類学
Variation in growth rates between cultures hinders the cultivation of ammonia-oxidizing bacteria 査読
Rino Isshiki, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda
FEMS Microbiology Letters 371 2024年1月
Characterisation of bacteria representing a novel Nitrosomonas clade: Physiology, genomics and distribution of missing ammonia oxidizer. 査読 国際誌
Shuta Kikuchi, Hirotsugu Fujitani, Kento Ishii, Rino Isshiki, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda
Environmental Microbiology Reports 15 ( 5 ) 404 - 416 2023年4月
Hiroto Ide, Kento Ishii, Yu Takahashi, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda
Microbes and Environments 38 ( 4 ) n/a - n/a 2023年
未培養硝化菌の分離戦略と特徴づけ 招待 査読
藤谷拓嗣
環境バイオテクノロジー学会誌 21 ( 1 ) 53 - 58 2021年8月
Microdroplet-based system for culturing of environmental microorganisms using FNAP-sort 査読
Kanako Saito, Yuri Ota, Dieter M. Tourlousse, Satoko Matsukura, Hirotsugu Fujitani, Masamune Morita, Satoshi Tsuneda, Naohiro Noda
Scientific Reports 11 ( 1 ) 9506 2021年5月
Nitrogen and oxygen isotope signatures of nitrogen compounds during anammox in the laboratory and a wastewater treatment plant 査読
Shotoku Kotajima, Keisuke Koba, Daisuke Ikeda, Akihiko Terada, Kazuichi Isaka, Kazuya Nishina, Yuuya Kimura, Akiko Makabe, Midori Yano, Hirotsugu Fujitani, Norisuke Ushiki, Satoshi Tsuneda, Muneoki Yoh
Microbes and Environments 35 ( 4 ) ME20031 2020年11月
Enrichment of comammox and nitrite-oxidizing Nitrospira from acidic soil 査読
Yu Takahashi, Hirotsugu Fujitani, Yuhei Hirano, Kanako Tago, Yong Wang, Masahito Hayatsu, Satoshi Tsuneda
Frontiers in Microbiology 11 ( 1737 ) 2020年7月
MazF endoribonucleolytic toxin conserved in Nitrospira specifically cleaves the AACU, AACG, and AAUU motifs 査読
Rie Aoi, Tatsuki Miyamoto, Akiko Yokota, Yuri Ota, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda, Naohiro Noda
Toxins 12 ( 5 ) 287 2020年4月
Physiological and genomic characterization of a new “Candidatus Nitrotoga” isolate 査読
Kento Ishii, Hirotsugu Fujitani, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda
Environmental Microbiology 22 ( 6 ) 2365 - 2382 2020年4月
Transcriptome analysis of the ammonia-oxidizing bacterium Nitrosomonas mobilis Ms1 reveals division of labor between aggregates and free-living cells 査読
Rino Isshiki, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda
Microbes and Environments 35 ( 2 ) 2020年2月
Successful enrichment of low-abundant comammox Nitrospira from nitrifying granules under ammonia-limited conditions 査読
Hirotsugu Fujitani†, Manami Nomachi†, Yu Takahashi†, Yoshiaki Hasebe, Masahiro Eguchi, Satoshi Tsuneda
FEMS Microbiology Letters 367 ( 1 ) fna025 2020年2月
Draft genome sequence of Acidovorax sp. strain NB1 isolated from a nitrite-oxidizing enrichment culture 査読
Hiroto Ide, Kento Ishii, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda
Microbiology Resource Announcements 8 ( 33 ) e00547-19 2019年8月
Seabird-affected taluses are denitrification hotspots and potential N2O emitters in the High Arctic 査読
Hayashi, Kentaro, Tanabe, Yukiko, Ono, Keisuke, Loonen, Maarten J. J. E., Asano, Maki, Fujitani, Hirotsugu, Tokida, Takeshi, Uchida, Masaki, Hayatsu, Masahito
Scientific Reports 8 ( 17261 ) 2018年11月
Genomic analysis of two phylogenetically distinct Nitrospira species reveals their genomic plasticity and functional diversity 査読
Norisuke Ushiki, Hirotsugu Fujitani, Yu Shimada, Tomohiro Morohoshi, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda
Frontiers in Microbiology 8 ( 2637 ) 2018年1月
Enrichment and Physiological Characterization of a Cold-Adapted Nitrite-Oxidizing Nitrotoga sp from an Eelgrass Sediment 査読
Kento Ishii, Hirotsugu Fujitani, Kentaro Soh, Tatsunori Nakagawa, Reiji Takahashi, Satoshi Tsuneda
Applied and Environmental Microbiology 83 ( 14 ) e00549-17 2017年7月
Nitrite oxidation kinetics of two Nitrospira strains: The quest for competition and ecological niche differentiation 査読
Norisuke Ushiki, Masaru Jinno, Hirotsugu Fujitani, Toshikazu Suenaga, Akihiko Terada, Satoshi Tsuneda
Journal of Bioscience and Bioengineering 123 ( 5 ) 581 - 589 2017年5月
Detection and Diversity of the Nitrite Oxidoreductase Alpha Subunit (nxrA) Gene of Nitrospina in Marine Sediments 査読
Sundas Rani, Hyeon-Woo Koh, Sung-Keun Rhee, Hirotsugu Fujitani, Soo-Je Park
Microbial Ecology 73 ( 1 ) 111 - 122 2017年1月
A rapid collection of yet unknown ammonia oxidizers in pure culture from activated sludge 査読
Takuma Abe, Norisuke Ushiki, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda
Water Research 108 169 - 178 2017年1月
Ecophysiology and Comparative Genomics of Nitrosomonas mobilis Ms1 Isolated from Autotrophic Nitrifying Granules of Wastewater Treatment Bioreactor 査読
Soe Myat Thandar, Norisuke Ushiki, Hirotsugu Fujitani, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda
Frontiers in Microbiology 7 ( 1869 ) 2016年11月
Physical enrichment of uncultured Accumulibacter and Nitrospira from activated sludge by unlabeled cell sorting technique 査読
Kana Irie, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda
Journal of Bioscience and Bioengineering 122 ( 4 ) 475 - 481 2016年10月
Selective isolation of ammonia-oxidizing bacteria from autotrophic nitrifying granules by applying cell-sorting and sub-culturing of microcolonies 査読
Hirotsugu Fujitani, Asami Kumagai, Norisuke Ushiki, Kengo Momiuchi, Satoshi Tsuneda
Frontiers in Microbiology 6 ( 1159 ) 2015年10月
難培養性亜硝酸酸化細菌Nitrospiraを標的とした新規な分離培養戦略 招待 査読
藤谷拓嗣, 常田 聡
環境バイオテクノロジー学会誌 14 ( 2 ) 99 - 103 2015年3月
Isolation of sublineage I Nitrospira by a novel cultivation strategy 査読
Hirotsugu Fujitani, Norisuke Ushiki, Satoshi Tsuneda, Yoshiteru Aoi
Environmental Microbiology 16 ( 10 ) 3030 - 3040 2014年10月
Isolation of Nitrospira belonging to Sublineage II from a Wastewater Treatment Plant 査読
Norisuke Ushiki, Hirotsugu Fujitani, Yoshiteru Aoi, Satoshi Tsuneda
Microbes and Environments 28 ( 3 ) 346 - 353 2013年9月
Selective enrichment of two different types of Nitrospira-like nitrite-oxidizing bacteria from a wastewater treatment plant 査読
Hirotsugu Fujitani, Yoshiteru Aoi, Satoshi Tsuneda
Microbes and Environments 28 ( 2 ) 236 - 243 2013年6月
亜硝酸酸化細菌Nitrobacterの新株が持つ固有の窒素代謝経路と亜酸化窒素還元機能の発見
高橋悠, 石井拳人, 藤谷拓嗣, 関口勇地, 末永俊和, 寺田昭彦, 廣野祐平, 多胡香奈子, 早津雅仁, 常田聡
日本ゲノム微生物学会年会要旨集 15th (Web) 2021年
独立栄養性亜硝酸酸化細菌のプロテオームに対する有機物の影響
石井拳人, 藤谷拓嗣, SMETS Barth F., 常田聡
日本ゲノム微生物学会年会要旨集 15th (Web) 2021年
網羅的遺伝子発現解析によって見えてきたアンモニア酸化細菌の凝集体と非凝集体の分業形態
一色理乃, 藤谷拓嗣, 常田聡
日本ゲノム微生物学会年会要旨集 14th 2020年
網羅的遺伝子発現解析による硝化菌の形態変化がもたらす生存戦略の解明
一色理乃, 藤谷拓嗣, 藤谷拓嗣, 田中大器, 関口哲志, 常田聡, 常田聡
日本ゲノム微生物学会年会要旨集 13th 2019年
細胞ごとに増殖速度のばらつきが大きいアンモニア酸化細菌のしなやかな生存戦略
一色理乃, 藤谷拓嗣, 田中大器, 関口哲志, 常田聡, 常田聡
日本微生物生態学会大会(Web) 33rd 2019年
見過ごされたアンモニア酸化細菌:Nitrosomonas属の新規な生理学,ゲノミクス,環境分布
藤谷拓嗣, 藤谷拓嗣, 菊池脩太, 石井拳人, 関口勇地, 常田聡, 常田聡
日本ゲノム微生物学会年会要旨集 13th 2019年
MEWE and BIOFILMS IWA Specialist Conference 2016 Report 招待
藤谷 拓嗣
水環境学会誌 40 ( 5 ) 173 2017年2月
なぜ,難培養性微生物の増殖は不均一なのか?-シングルセル観察から見えたクローナル集団の実態-
一色理乃, 藤谷拓嗣, 藤谷拓嗣, 田中大器, 関口哲志, 常田聡, 常田聡
日本細菌学雑誌(Web) 72 ( 1 ) 2017年
硝化菌単一菌株集団でみられる形態と増殖能の不均一性
一色理乃, 藤谷拓嗣, 藤谷拓嗣, 田中大器, 関口哲志, 常田聡, 常田聡
日本微生物生態学会大会(Web) 2017 2017年
新規な分離培養技術が照らす未来～硝化菌の獲得から学んだこと～ 招待
藤谷 拓嗣
日本微生物生態学会誌 31 ( 2 ) 68 - 70 2016年9月
クローナルな硝化菌集団における細胞増殖活性の不均一性の評価と機構解明
一色理乃, 藤谷拓嗣, 藤谷拓嗣, 田中大器, 関口哲志, 常田聡, 常田聡
日本微生物生態学会大会(Web) 31st 2016年
P17-10 nxrBを標的としたin situ RCA-FISH法による亜硝酸酸化細菌の探索(ポスター発表)
牛木 章友, 藤谷 拓嗣, 星野 辰彦, 常田 聡
日本微生物生態学会講演要旨集 2014 180 - 180 2014年
P13-13 比較解析から迫る亜硝酸酸化細菌Nitrospiraの生態学的ニッチ(ポスター発表)
神野 大, 牛木 章友, 藤谷 拓嗣, 末永 俊和, 寺田 昭彦, 常田 聡
日本微生物生態学会講演要旨集 2014 144 - 144 2014年
P14-10 難培養性アンモニア酸化細菌Nitrosomonas mobilisの分離培養と生理学的性質の解明(ポスター発表)
熊谷 麻美, 籾内 研吾, 藤谷 拓嗣, 常田 聡
日本微生物生態学会講演要旨集 2014 152 - 152 2014年
コッホから140年，新たな分離培養技術へのパラダイムシフト 招待
藤谷 拓嗣
日本微生物生態学会誌 28 ( 1 ) 5 - 5 2013年3月
PE-015 「個」と「集団」で生きる微生物たちを分ける : 生育形態と難培養性との関係に迫る(微生物群集構造,ポスター発表)
入江 香菜, 藤谷 拓嗣, 常田 聡
日本微生物生態学会講演要旨集 ( 29 ) 120 - 120 2013年
PH-010 機能遺伝子nxrBに基づく新規な亜硝酸酸化細菌の探索(分類・系統解析,ポスター発表)
牛木 章友, 藤谷 拓嗣, 常田 聡
日本微生物生態学会講演要旨集 ( 29 ) 132 - 132 2013年
OI-003 亜硝酸酸化細菌Nitrospiraを標的とした新規分離培養手法と他の難培養性微生物への適用(方法論,口頭発表)
藤谷 拓嗣, 籾内 研吾, 牛木 章友, 入江 香菜, 熊谷 麻美, 安部 拓磨, 神野 大, 青井 議輝, 常田 聡
日本微生物生態学会講演要旨集 ( 29 ) 92 - 92 2013年
PC-010 低濃度アンモニアの連続供給による難培養性硝化微生物の選択的集積培養(廃水処理生態系,ポスター発表)
籾内 研吾, 藤谷 拓嗣, 常田 聡
日本微生物生態学会講演要旨集 ( 29 ) 112 - 112 2013年
S19-1 培養できない微生物を培養するための新規技術開発(S19 微生物工学,シンポジウムセッション)
青井 議輝, 藤谷 拓嗣, 常田 聡
日本微生物生態学会講演要旨集 ( 28 ) 127 - 127 2012年
PC-03 難培養性Nitrospiraの単離が排水処理プロセスでの亜硝酸酸化細菌の生理学的性質を明らかにする(PC 廃水処理生態系,ポスター発表)
藤谷 拓嗣, 牛木 章友, 常田 聡, 青井 議輝
日本微生物生態学会講演要旨集 ( 28 ) 146 - 146 2012年
PB-023 亜硝酸酸化細菌Nitrospiraの新規分離培養手法とその実証(PB 方法論,ポスター発表)
藤谷 拓嗣, 牛木 章友, 常田 聡, 青井 議輝
日本微生物生態学会講演要旨集 ( 27 ) 90 - 90 2011年
PB-022 浄水処理プロセス由来の新規硝化細菌の分離培養(PB 方法論,ポスター発表)
籾内 研吾, 藤谷 拓嗣, 常田 聡
日本微生物生態学会講演要旨集 ( 27 ) 89 - 89 2011年
分離培養技術が切り拓く未来－Nitrospiraの分離培養を通して－ 招待
藤谷 拓嗣
日本微生物生態学会誌 25 8 - 11 2010年3月
P-105 難培養性亜硝酸酸化細菌Nitrospiraの増殖特性(G.生理/代謝/増殖,ポスター発表)
藤谷 拓嗣, 青井 議輝, 常田 聡
日本微生物生態学会講演要旨集 ( 26 ) 147 - 147 2010年
P-122 難培養性亜硝酸酸化細菌Nitrospiraの分離培養(ポスター発表)
藤谷 拓嗣, 青井 議輝, 常田 聡
日本微生物生態学会講演要旨集 ( 25 ) 106 - 106 2009年
亜硝酸酸化細菌Nitrobacter sp. CN101株の高温と低温による遺伝子発現の違い
白石 夕貴, 諏訪 裕一, 藤谷 拓嗣
日本微生物生態学会第36回大会，第13回アジア微生物生態シンポジウム 2023年11月
Comammox集積培養で共存する耐酸性アンモニア酸化細菌Nitrosospiraの系統と生理学
宮田 莉加子, 三星 峻, 角野 立夫, 諏訪 裕一, 藤谷 拓嗣
日本微生物生態学会第36回大会，第13回アジア微生物生態シンポジウム 2023年11月
部分硝化リアクターから単離したクラスター7アンモニア酸化細菌の亜酸化窒素生成ダイナミクス：ゲノムおよび生理学的特性からの考察
大石 彬人, 大野 哲, 末永 俊和, 藤谷 拓嗣, 諏訪 裕一, 黒岩 恵, 寺田 昭彦
日本微生物生態学会第36回大会，第13回アジア微生物生態シンポジウム 2023年11月
A novel nitrite-oxidizing Nitrobacter sp. strain A67 isolated from agricultural soil adapts to moderately acidic pH
Ayano Kaneko, Yuta Endo, Takuya Ninomiya, Megumi Kuroiwa, Hirotsugu Fujitani, Yuichi Suwa
36th Japanese Society Microbial Ecology Annual Meeting and 13th Asian Symposium on Microbial Ecology 2023年11月
Individual-level phenotypic heterogeneity in ammonia-oxidizing bacteria revealed by single-cell observation
Shuto Ikeda, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda
36th Japanese Society Microbial Ecology Annual Meeting and 13th Asian Symposium on Microbial Ecology 2023年11月
アンモニア酸化菌の増殖が細胞ごとにばらつく影響と意義
一色 理乃, 藤谷 拓嗣, 常田 聡
日本微生物生態学会第36回大会，第13回アジア微生物生態シンポジウム 2023年11月
農耕地土壌からの耐酸性comammox細菌の実験室培養の獲得
古屋 日向乃, 藤谷 拓嗣, 諏訪 裕一
日本微生物生態学会第36回大会，第13回アジア微生物生態シンポジウム 2023年11月
酸性土壌からの耐酸性亜硝酸酸化細菌の集積培養
村田 璃奈, 菊地 麻友, 藤谷 拓嗣, 諏訪 裕一
日本微生物生態学会第36回大会，第13回アジア微生物生態シンポジウム 2023年11月
15N標識N2Oを使用した土壌からのN2Oのgross生成速度の測定の試み
清水 千尋, 大友 優里, 黒岩 恵, 藤谷 拓嗣, 徳田 進一, 早津 雅仁, 多胡 香奈子, 諏訪 裕一
日本微生物生態学会第36回大会，第13回アジア微生物生態シンポジウム 2023年11月
培養時間が農耕地土壌のグロス硝化速度に与える影響
大友 優里, 黒岩 恵, 藤谷 拓嗣, 徳田 進一, 早津 雅仁, 多胡 香奈子, 諏訪 裕一
日本微生物生態学会第36回大会，第13回アジア微生物生態シンポジウム 2023年11月
耐/好酸性comammoxの分離戦略 〜2. 無機培地での回分培養〜
中村 颯太, 三星 峻, 角野 立夫, 諏訪 裕一, 藤谷 拓嗣
日本微生物生態学会第36回大会，第13回アジア微生物生態シンポジウム 2023年11月
Genomic and physiological insights into N2O emissions by cluster 7 ammonia-oxidizing bacteria isolated from partial nitrifying bioreactors
Akito Oishi, Toshikazu Suenaga, Hirotsugu Fujitani, Yuichi Suwa, Megumi Kuroiwa, Akihiko Terada
8th International Conference on Nitrification 2023年7月
Growth heterogeneity of divided cells affects the culturability of ammonia-oxidizing bacteria
Shuto Ikeda, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda
8th International Conference on Nitrification 2023年7月
Temperature dependence in nitrite oxidation and gene expression by a Nitrobacter sp.
Yuki Shiraishi, Yuichi Suwa, Hirotsugu Fujitani
8th International Conference on Nitrification 2023年7月
Isolation and physiological characterization of a novel nitrite-oxidizing bacterium, Nitrobacter sp. A67 which accommodates to moderately acidic pH from agricultural soil
Ayano Kaneko, Yuta Endo, Takuya Ninomiya, Megumi Kuroiwa, Hirotsugu Fujitani, Yuichi Suwa
8th International Conference on Nitrification 2023年7月
シングルセル観察で解き明かすアンモニア酸化細菌の分裂速度不均一性
池田 秀斗, 藤谷 拓嗣, 常田 聡
第11回日本生物工学会東日本支部コロキウム 2023年3月
アンモニア酸化細菌Nitrosomonasにおける個体レベルの表現型不均一性の解析
池田 秀斗, 一色 理乃, 藤谷 拓嗣, 常田 聡
日本微生物生態学会第35回大会 2022年11月
シングルドロップレット分取技術を用いた環境微生物の培養
野田 尚宏, 大田 悠里, 斉藤 加奈子, Dieter M Tourlousse, 高木 妙子, 松倉 智子, 森田 雅宗, 藤谷 拓嗣, 常田 聡
日本微生物生態学会第35回大会 2022年11月
アンモニア酸化細菌3株における難培養性と増殖速度のばらつきの比較
一色 理乃, 藤谷 拓嗣, 常田 聡
日本微生物生態学会第35回大会 2022年11月
耐酸性comammoxの分離戦略
三星 峻, 角野 立夫, 諏訪 裕一, 藤谷 拓嗣
日本微生物生態学会第35回大会 2022年11月
Bacterial growth heterogeneity causes persistent infection and unculturability in environment
Rino Isshiki, Naoki Yamamoto, Yuto Kawai, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda
The 15th Korea-Japan Symposium on Microbiology 2022年10月
Combination of droplet based cultivation and single droplet sorting paves the way for isolating slow growers in soil
Yuri Ota, Kanako Saito, Dieter Tourlousse, Taeko Takagi, Satoko Matsukura, Masamune Morita, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda, Naohiro Noda
18th International society for microbial ecology 2022年8月
Genomics of acid adapted comammox and nitrite-oxidizing Nitrospira: are they specialists on low pH or generalists surviving a broad range of pH?
Yu Takahashi, Hirotsugu Fujitani, Itsuki Tanguchi, Tetsuya Hayashi, Kanako Tago, Masahito Hayatsu, Satoshi Tsuneda
18th International society for microbial ecology 2022年8月
Comparison of three strains of ammonia-oxidizing bacteria to reveal the relationship between culturability and growth heterogeneity
Rino Isshiki, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda
18th International society for microbial ecology 2022年8月
活性化エネルギーから見る亜硝酸酸化細菌の温度依存性の比較
白石 夕貴, 諏訪 裕一, 藤谷 拓嗣
日本微生物生態学会第34回大会 2021年10月
亜硝酸に対して親和性の高い土壌亜硝酸酸化細菌Nitrobacter sp. CN101の生理学とゲノム科学
小林 陽一郎, 二宮 拓也, 藤谷 拓嗣, 黒岩 恵, 諏訪 裕一
日本微生物生態学会第34回大会 2021年10月
好酸性亜硝酸酸化細菌Nitrobacter sp. A67株の分離と生理学的特徴づけー硝化コミュニティーの唯一のエネルギー源として尿素を用いた硝化菌の分離戦略―
遠藤 優太, 藤谷 拓嗣, 二宮 拓也, 小林 陽一郎, 黒岩 恵, 諏訪 裕一
日本微生物生態学会第34回大会 2021年10月
酸性条件下における硝化の担い手は誰か
三星 峻, 角野 立夫, 遠藤 優太, 諏訪 裕一, 藤谷 拓嗣
日本微生物生態学会第34回大会 2021年10月
土壌抽出液培地による新規な硝化菌培養の可能性２〜酸性森林土壌の場合〜
菊地 麻友, 高山 祐子, 三星 峻, 梅澤 千尋, 高橋 昌平, 古屋 日向乃, 黒岩 恵, 磯部 一夫, 藤谷 拓嗣, 諏訪 裕一
日本微生物生態学会第34回大会 2021年10月
好酸性NOB Nitrobacter sp. A67と共存するアンモニア酸化アーキアの集積培養
高山 祐子, 遠藤 優太, 二宮 拓也, 黒岩 恵, 藤谷 拓嗣, 諏訪 裕一
日本微生物生態学会第34回大会 2021年10月
弱酸性硝化リアクターで集積培養された新規なcomammox Nitrospiraのコンプリートゲノムの構築
髙橋 悠, 藤谷 拓嗣, 谷口 愛樹, 林 哲也, 多胡 香奈子, 早津 雅仁, 常田 聡
日本微生物生態学会第34回大会 2021年10月
亜硝酸酸化細菌Nitrospiraにおける2種類のMazEF機構の機能解析
葵 理恵, 宮本 龍樹, 岡部 拓真, 横田 亜紀子, 大田 悠里, 藤谷 拓嗣, 常田 聡, 野田 尚宏
日本微生物生態学会第34回大会 2021年10月
環境微生物獲得のためのwater-in-oilドロップレット培養手法の構築
大田 悠里, 斉藤 加奈子, Dieter M Tourlousse, 松倉 智子, 高木 妙子, 藤谷 拓嗣, 森田 雅宗, 常田 聡, 野田 尚宏
環境バイオテクノロジー学会2021年度大会 2021年9月
茶園の酸性土壌に生息する硝化菌Nitrospiraの集積培養
髙橋 悠, 藤谷 拓嗣, 廣野 祐平, 多胡 香奈子, 早津 雅仁, 常田 聡
環境バイオテクノロジー学会2021年度大会 2021年9月
未培養硝化菌の分離戦略と生理生態 招待
藤谷拓嗣
環境バイオテクノロジー学会2021年度大会 2021年9月
NitrospiraにおけるToxin-Antitoxin機構の生理学的意義の解明
葵 理恵, 宮本 龍樹, 岡部 拓真, 横田 亜紀子, 大田 悠里, 藤谷 拓嗣, 常田 聡, 野田 尚宏
第15回細菌学若手コロッセウム 2021年8月
Water-in-oilドロップレットを用いた環境中の微生物獲得手法の構築
大田 悠里, 斉藤 加奈子, Dieter M Tourlousse, 松倉 智子, 高木 妙子, 藤谷 拓嗣, 森田 雅宗, 常田 聡, 野田 尚宏
第15回細菌学若手コロッセウム 2021年8月
地球の窒素循環を駆動する未培養微生物の実態に迫る 招待
藤谷拓嗣
第15回細菌学若手コロッセウム 2021年8月
Genomics and physiology of novel Nitrobacter strain adapted to an acidic soil environment of heavily fertilized tea field
Yu Takahashi, Kento Ishii, Hirotsugu Fujitani, Toshikazu Suenaga, Akihiko Terada, Yuji Sekiguchi, Kanako Tago, Masahito Hayatsu, Yuhei Hirono, Satoshi Tsuneda
7th International Conference on Nitrification 2021年7月
Characterization of Nitrobacter sp. CN101 with highly affinity to nitrite isolated from mixed culture with urea from Japanese forest soil
Yoichiro Kobayashi, Takuya Ninomiya, Hirotsugu Fujitani, Yuichi Suwa
7th International Conference on Nitrification 2021年7月
Isolation of an aciophilic nitrite-oxidizing bacterium, Nitrobacter sp. strain A67, using culture medium containing urea as a sole source of energy for nitrifying community
Yuta Endo, Takuya Ninomiya, Hirotsugu Fujitani, Yuichi Suwa
7th International Conference on Nitrification 2021年7月
Comparative physiology and genome of ammonia-oxidizing Nitrosospira isolated from terrestrial and freshwater environments 国際会議
Emi Nissato, Hirotsugu Fujitani, Keisuke Sakai, Hiroshi Ishikawa, Yuichi Suwa
7th International Conference on Nitrification 2021年7月
亜硝酸酸化細菌Nitrobacterの新株が持つ固有の窒素代謝経路と亜酸化窒素還元機能の発見
髙橋 悠, 石井 拳人, 藤谷 拓嗣, 関口 勇地, 末永 俊和, 寺田 昭彦, 廣野 祐平, 多胡 香奈子, 早津 雅仁, 常田 聡
第15回日本ゲノム微生物学会年会 2021年3月
独立栄養性亜硝酸酸化細菌のプロテオームに対する有機物の影響
石井 拳人, 藤谷 拓嗣, Barth F. Smets, 常田 聡
第15回日本ゲノム微生物学会年会 2021年3月
網羅的遺伝子発現解析によって見えてきたアンモニア酸化細菌の凝集体と非凝集体の分業形態
一色 理乃, 藤谷 拓嗣, 常田 聡
第14回日本ゲノム微生物学会年会 2020年3月
新規な分離培養技術が紐解く未知微生物：硝化菌の生き様とは？
藤谷拓嗣
SATテクノロジーショーケース2020 2020年1月
Genomic and physiological characteristics of novel nitrite-oxidizing Nitrospira strain isolated from a drinking water treatment plant 国際会議
Hirotsugu Fujitani, Kengo Momiuchi, Kento Ishii, Masaru Jinno, Norisuke Ushiki, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda
7th International Conference Microbial Ecology and Water Engineering 2019年11月
Enrichment of comammox Nitrospira from nitrifying granules by using fixed-bed continuous feeding bioreactors 国際会議
Hirotsugu Fujitani, Manami Nomachi, Yu Takahashi, Yoshiaki Hasebe, Masahiro Eguchi, Satoshi Tsuneda
7th International Conference Microbial Ecology and Water Engineering 2019年11月
A flexible survival strategy of ammonia-oxidizing bacteria by growth heterogeneity at a single cell level
Rino Isshiki, Hirotsugu Fujitani, Daiki Tanaka, Tetsushi Sekiguchi, Satoshi Tsuneda
6th International Conference on Nitrification 2019年10月
Enrichment of comammox and canonical Nitrospira from acidic soil: Insights into niche differentiation and adaptation to low pH
Yu Takahashi, Hirotsugu Fujitani, Yuhei Hirono, Kanako Tago, Yong Wang, Masahito Hayatsu, Satoshi Tsuneda
6th International Conference on Nitrification 2019年10月
Physiological and Genomic Characteristics of a New “Candidatus Nitrotoga” Isolate
Kento Ishii, Hirotsugu Fujitani, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda
6th International Conference on Nitrification 2019年10月
Sequence-specific endoribonucleolytic toxin, MazF, conserved in nitrifying bacteria
Rie Aoi, Tatsuki Miyamoto, Akiko Yokota, Yuri Ota, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda, Naohiro Noda
6th International Conference on Nitrification 2019年10月
Enrichment of comammox Nitrospira from nitrifying granules by using fixed-bed continuous feeding bioreactors 国際会議
Hirotsugu Fujitani, Manami Nomachi, Yu Takahashi, Yoshiaki Hasebe, Masahiro Eguchi, Satoshi Tsuneda
6th International Conference on Nitrification 2019年10月
Characterization of a bacterium representing a previously unrecognized clade of the Nitrosomonas group; physiology, genomics, and distribution of a missing ammonia-oxidizer 国際会議
Hirotsugu Fujitani, Shuta Kikuchi, Kento Ishii, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda
6th International Conference on Nitrification 2019年10月
Metabolic Lifestyles of Nitrite Oxidizer Nitrotoga under Mixotrophic and Heterotrophic Conditions
Kento Ishii, Hirotsugu Fujitani, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda
2019 Nordic Meeting in Molecular Microbial Ecology 2019年9月
従属栄養細菌との相互作用を介した硝化菌の増殖促進機構
井出 寛人, 石井 拳人, 藤谷 拓嗣, 常田 聡
日本微生物生態学会第33回大会 2019年9月
亜酸化窒素還元能を持つ硝化細菌Nitrobacterの発見
髙橋 悠, 藤谷 拓嗣, 末永 俊和, 寺田 昭彦, 廣野 祐平, 多胡 香奈子, 早津 雅仁, 常田 聡
日本微生物生態学会第33回大会 2019年9月
培養技術とゲノム解析で紐解く硝化菌の生理生態 招待
藤谷 拓嗣
第22回日本水環境学会シンポジウム 2019年9月
Mixotrophic Lifestyle of Nitrite Oxidizer Nitrotoga in the Presence of Pyruvate
Kento Ishii, Hirotsugu Fujitani, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda
8th Congress of European Microbiologists 2019年7月
Cultivation of a bacterium representing a previously unrecognized clade of the Nitrosomonas group; physiology, genomics, and distribution of a missing ammonia-oxidizer 国際会議
Hirotsugu Fujitani, Shuta Kikuchi, Kento Ishii, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda
8th Congress of European Microbiologists 2019年7月
未培養硝化菌を対象とした新規分離培養技術の開発
藤谷拓嗣, 常田聡
環境バイオテクノロジー学会2019年度大会 2019年6月
Enrichment of Complete Ammonia Oxidizer and Nitrite Oxidizer of genus Nitrospira from Acidic Soil
Yu Takahashi, Hirotsugu Fujitani, Kanako Tago, Yong Wang, Yuhei Hirono, Masahito Hayatsu, Satoshi Tsuneda
11th Asian Symposium on Microbial Ecology 2019年5月
ピルビン酸存在下での亜硝酸酸化細菌Nitrotogaの混合栄養的な増殖様式
石井 拳人, 藤谷 拓嗣, 関口勇地, 常田 聡
第13回日本ゲノム微生物学会年会 2019年3月
網羅的遺伝子発現解析による硝化菌の形態変化がもたらす生存戦略の解明
一色 理乃, 藤谷 拓嗣, 田中 大器, 関口 哲志, 常田 聡
第13回日本ゲノム微生物学会年会 2019年3月
見過ごされたアンモニア酸化細菌：Nitrosomonas属の新規な生理学，ゲノミクス，環境分布
藤谷拓嗣, 菊池脩太, 石井拳人, 関口勇地, 常田聡
第13回日本ゲノム微生物学会年会 2019年3月
Culture-dependent analysis of isolated Nitrotoga sp. provide deeper insight into the physiology
Kento Ishii, Hirotsugu Fujitani, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda
17th International society for microbial ecology 2018年8月
Growth variability at the single-cell level affects culturability of environmental microorganisms
Rino Isshiki, Hirotsugu Fujitani, Daiki Tanaka, Tetsushi Sekiguchi, Satoshi Tsuneda
17th International society for microbial ecology 2018年8月
Genomic and physiological characteristics of novel nitrite-oxidizing Nitrospira isolated from a drinking water treatment plant 国際会議
Hirotsugu Fujitani, Kengo Momiuchi, Kento Ishii, Masaru Jinno, Norisuke Ushiki, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda
17th International society for microbial ecology 2018年8月
Cultivation of novel nitrite oxidizer Nitrospira from acidic soil
Yu Takahashi, Hirotsugu Fujitani, Yuhei Hirono, Masahito Hayatsu, Satoshi Tsuneda
32th Japanese Society Microbial Ecology Annual Meeting and 10th Asian Symposium on Microbial Ecology 2018年7月
Growth heterogeneity in pure cultures affects the culturability
Rino Isshiki, Hirotsugu Fujitani, Daiki Tanaka, Tetsushi Sekiguchi, Satoshi Tsuneda
32th Japanese Society Microbial Ecology Annual Meeting and 10th Asian Symposium on Microbial Ecology 2018年7月
Isolation process and genomic analysis of nitrite oxidizer Nitrotoga sp. provide insights on physiological characteristics and clues to promote the growth
Kento Ishii, Hirotsugu Fujitani, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda
32th Japanese Society Microbial Ecology Annual Meeting and 10th Asian Symposium on Microbial Ecology 2018年7月
N2Oを固定するシアノバクテリアの探索とポテンシャル評価
須田和美, 松崎壮一郎, 末永俊和, 利谷翔平, 藤谷拓嗣, 常田聡, 細見正明, 寺田昭彦
第52回日本水環境学会年会 2018年3月
High denitrification potentials of soils under seabird cliffs: Case studies in Ny-Ålesund, Svalbard
Kentaro Hayashi, Yukiko Tanabe, Keisuke Ono, Maarten J, J. E. Loonen, Maki Asano, Hirotsugu Fujitani, Masaki Uchiba, Masahito Hayatsu
8th Symposium on Polar Science: Polar Biology 2017年12月
完全アンモニア酸化能を保持するComammox細菌の分離培養と生理生態
野町 真名実, 藤谷 拓嗣, 長谷部 吉昭, 江口 正浩, 常田 聡
環境微生物系学会合同大会2017 2017年8月
ゲノムから推定する遅増殖性Nitrotogaの活性促進因子
石井 拳人, 藤谷 拓嗣, 常田 聡
環境微生物系学会合同大会2017 2017年8月
硝化菌単一菌株集団でみられる形態と増殖能の不均一性
一色 理乃, 藤谷 拓嗣, 田中 大器, 関口 哲志, 常田 聡
環境微生物系学会合同大会2017 2017年8月
Genome-informed isolation of nitrite oxidizer Nitrotoga sp
Kento Ishii, Hirotsugu Fujitani, Tatsunori Nakagawa, Reiji Takahashi, Satoshi Tsuneda
5th International Conference on Nitrification 2017年7月
Growth heterogeneity in pure cultures of nitrifiers
Rino Isshiki, Hirotsugu Fujitani, Daiki Tanaka, Tetsushi Sekiguchi, Satoshi Tsuneda
5th International Conference on Nitrification 2017年7月
Comparative genomics of phylogenetically distinct two Nitrospira strains isolated from activated sludge 国際会議
Norisuke Ushiki, Hirotsugu Fujitani, Yu Shimada, Tomohiro Morohoshi, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda
5th International Conference on Nitrification 2017年7月
革新的分離培養技術による新規なcomammox細菌の獲得と生存戦略の解明
野町真名実, 藤谷拓嗣, 長谷部吉昭, 江口正浩, 常田 聡
第19回化学工学会学生発表会 2017年3月
セルソーターによって分取された凝集体内の微生物間相互作用の解明
石井拳人, 藤谷拓嗣, 常田 聡
第11回日本ゲノム微生物学会年会 2017年3月
Nitrospiraの亜硝酸酸化活性を制御するQuorum-sensing機構の発見
牛木章友, 藤谷拓嗣, 諸星知広, 常田 聡
第11回日本ゲノム微生物学会年会 2017年3月
亜酸化窒素の削減に寄与する淡水性シアノバクテリアの探索
松崎壮一郎, 末永俊和, 利谷翔平, 堀知行, 牛木章友, 藤谷拓嗣, 常田聡, 細見正明, 寺田昭彦
第5回日本生物工学会東日本支部コロキウム 2017年3月
微生物凝集体ソーティングによる未培養な亜硝酸酸化細菌Nitrotogaの獲得と生存戦略
石井拳人, 藤谷拓嗣, 中川達功, 高橋令二, 常田 聡
日本微生物生態学会第31回大会 2016年10月
Quorum-sensing機構による亜硝酸酸化細菌Nitrospira japonicaの活性制御メカニズム
牛木章友, 島田 侑, 藤谷拓嗣, 諸星知広, 常田 聡
日本微生物生態学会第31回大会 2016年10月
クローナルな硝化菌集団における細胞増殖活性の不均一性の評価と機構解明
一色理乃, 藤谷拓嗣, 田中大器, 関口 哲志, 常田 聡
日本微生物生態学会第31回大会 2016年10月
Ammonia concentration determines ecological niche differentiation of Nitrospira as nitrite-oxidizers in activated sludge 国際会議
Hirotsugu Fujitani, Masaru Jinno, Norisuke Ushiki, Toshikazu Suenaga, Akihiko Terada, Satoshi Tsuneda
6th International Conference Microbial Ecology and Water Engineering 2016年9月
Physiological and genetic properties of Nitrosomonas mobilis Ms1 isolated from autotrophic nitrifying granule of wastewater treatment plant
Soe Myat Thandar, Norisuke Ushiki, Hirotsugu Fujitani, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda
16th International society for microbial ecology 2016年8月
Comparative genomic analysis of phylogenetically distinct two Nitrospira strains isolated from a wastewater treatment plant
Norisuke Ushiki, Hirotsugu Fujitani, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda
16th International society for microbial ecology 2016年8月
Direct isolation of microcolonies from activated sludge opens the window of unrecognized genus Nitrosomonas as ammonia oxidizers 国際会議
Hirotsugu Fujitani, Takuma Abe, Norisuke Ushiki, Satoshi Tsuneda
16th International society for microbial ecology 2016年8月
新規な分離培養技術によって獲得された硝化細菌の生理・ゲノム特性
藤谷拓嗣, 牛木章友, 神野 大, 安部拓磨, 常田 聡
環境バイオテクノロジー学会2016年度大会 2016年6月
新規な分離培養戦略が切り拓く難培養性硝化細菌の獲得と生理・ゲノム特性 招待
藤谷拓嗣, 牛木章友, 常田 聡
日本農芸化学会2016年度大会 2016年3月
淡水域に棲息する N2O 同化を行う Cyanobacteria の探索
松崎壮一郎, 末永俊和, 堀知行, 牛木章友, 藤谷拓嗣, 常田聡, 利谷翔平, 細見正明, 寺田昭彦
第50回日本水環境学会年会 2016年3月
Physiological characterization of Nitrotoga-like bacteria enriched from coastal sand
Kento Ishii, Hirotsugu Fujitani, Tatsunori Takahashi, Reiji Takahashi, Satoshi Tsuneda
16th International society for microbial ecology 2016年3月
比較ゲノム解析が明らかにする亜硝酸酸化細菌Nitrospira の生態学的ニッチ
牛木章友, 藤谷拓嗣, 関口勇地, 常田 聡
31th Japanese Society Microbial Ecology Annual Meeting and 7th Japan-Taiwan-Korea Symposium on Microbial Ecology 2015年10月
Physiological characterization of Nitrosomonas mobilis-like strain isolated from autotrophic nitrifying granule
Soe Myat Thandar, Norisuke Ushiki, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda
31th Japanese Society Microbial Ecology Annual Meeting and 7th Japan-Taiwan-Korea Symposium on Microbial Ecology 2015年10月
活性汚泥中に潜在する未培養アンモニア酸化細菌の分離培養
安部拓磨, 牛木章友, 藤谷拓嗣, 常田 聡
31th Japanese Society Microbial Ecology Annual Meeting and 7th Japan-Taiwan-Korea Symposium on Microbial Ecology 2015年10月
Isolation, physiology, and genomics of novel nitrifiers 招待 国際会議
Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda
31th Japanese Society Microbial Ecology Annual Meeting and 7th Japan-Taiwan-Korea Symposium on Microbial Ecology 2015年10月
Selective enrichment of uncultured ammonia-oxidizing bacteria and archaea and Nitrospira from freshwater by continuous feeding bioreactors
Kengo Momiuchi, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda
4th International Conference on Nitrification 2015年6月
Comparative genomic analysis of phylogenetically distant two Nitrospira strains isolated from a wastewater treatment plant
Norisuke Ushiki, Hirotsugu Fujitani, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda
4th International Conference on Nitrification 2015年6月
新規分離培養手法を用いたハイスループットなアンモニア酸化細菌の獲得
安部拓磨, 牛木章友, 藤谷拓嗣, 常田 聡
2015年度環境バイオテクノロジー学会 2015年6月
Isolation and successful subculture of Nitrosomonas mobilis lineage: Recovery of nature's lost treasure since 1970's 国際会議
Hirotsugu Fujitani, Asami Kumagai, Norisuke Ushiki, Kengo Momiuchi, Satoshi Tsuneda
4th International Conference on Nitrification 2015年6月
難培養性アンモニア酸化細菌Nitrosomonas mobilisの分離培養と生理学的性質の解明
熊谷麻美, 籾内研吾, 藤谷拓嗣, 常田 聡
環境微生物系合同大会2014 2014年10月
比較解析から迫る亜硝酸酸化細菌Nitrospiraの生態学的ニッチ
神野 大, 牛木章友, 藤谷拓嗣, 常田 聡
環境微生物系合同大会2014 2014年10月
nxrBを標的としたin situ RCA-FISH法による亜硝酸酸化細菌の探索
牛木章友, 藤谷拓嗣, 星野辰彦, 常田 聡
環境微生物系合同大会2014 2014年10月
Selective enrichment of uncultured ammonia-oxidizing bacteria and archaea and nitrite oxidizing bacteria from freshwater
Kengo Momiuchi, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda
15th International society for microbial ecology 2014年8月
Detection of nxrB genes by in situ RCA-FISH to identify unrecognized nitrite-oxidizing microorganisms in environments
Norisuke Ushiki, Hirotsugu Fujitani, Tatsuhiko Hoshino, Satoshi Tsuneda
15th International society for microbial ecology 2014年8月
Selective enrichment of ammonia-oxidizing archaea and bacteria from freshwater
Kengo Momiuchi, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda
Water and Environment Technology Conference 2014 2014年6月
排水処理槽内から単離された2種類のNitrospiraの比較解析
牛木章友, 藤谷拓嗣, 常田 聡
第48回日本水環境学会年会 2014年3月
機能遺伝子nxrBに基づく新規な亜硝酸酸化細菌の探索
牛木章友, 藤谷拓嗣, 常田 聡
日本微生物生態学会第29回大会 2013年11月
低濃度アンモニアの連続供給による難培養性硝化微生物の選択的集積培養
籾内研吾,藤谷拓嗣,常田 聡
日本微生物生態学会第29回大会 2013年11月
亜硝酸酸化細菌Nitrospiraを標的とした新規分離培養手法と他の難培養性微生物への適用
藤谷拓嗣, 籾内研吾, 牛木章友, 入江香菜, 熊谷麻美, 安部拓磨, 神野 大, 青井議輝, 常田 聡
日本微生物生態学会第29回大会 2013年11月
難培養性亜硝酸酸化細菌Nitrospiraを標的とした革新的分離培養戦略
藤谷拓嗣, 牛木章友, 籾内研吾, 青井議輝, 常田 聡
第16回日本水環境学会シンポジウム 2013年11月
Selective inoculation of microcolonies materializes cultivation and isolation of previously uncultured nitrifying bacteria 国際会議
Hirotsugu Fujitani, Norisuke Ushiki, Kengo momiuchi, Asami Kumagai, Takuma Abe, Satoshi Tsuneda
The 5th Taiwan-Korea-Japan International Symposium on Microbial Ecology 2013年10月
Comparative physiological analysis of previously uncultured Nitrospira strains isolated from wastewater treatment plants
Norisuke Ushiki, Hirotsugu Fujitani, Yoshiteru Aoi, Satoshi Tsuneda
3rd International conference on nitrification 2013年9月
An innovative cultivation and isolation strategy for uncultured nitrifying bacteria 国際会議
Hirotsugu Fujitani, Norisuke Ushiki, Kengo Momiuchi, Yoshiteru Aoi, Satoshi Tsuneda
3rd International conference on nitrification 2013年9月
An innovative cultivation and isolation strategy for uncultured nitrifying bacteria 国際会議
Hirotsugu Fujitani, Norisuke Ushiki, Kengo Momiuchi, Yoshiteru Aoi, Satoshi Tsuneda
Early career scientist workshop ICoN3 2013年9月
An innovative cultivation and isolation strategy for uncultured nitrite-oxidizing bacteria of the genus Nitrospira 国際会議
Hirotsugu Fujitani, Norisuke Ushiki, Kengo Momiuchi, Yoshiteru Aoi, Satoshi Tsuneda
5th International Conference Microbial Ecology and Water Engineering 2013年7月
An innovative cultivation and isolation strategy for uncultured nitrifying bacteria 国際会議
Hirotsugu Fujitani, Norisuke Ushiki, Kengo momiuchi, Yoshiteru Aoi, Satoshi Tsuneda
CER International workshop on Biogeochemical cycling and Microbial Ecology for Young Scientists 2013年3月
淡水環境に生息する難培養性硝化細菌の新規分離培養手法の開発
籾内研吾, 藤谷拓嗣, 青井議輝, 常田 聡
第47回日本水環境学会 2013年3月
出芽酵母と共凝集する乳酸菌の細胞表面特性に関する研究
平山 悟, 臼井有美, 土屋典子, 阿部 侑, 籾内研吾, 藤谷拓嗣, 常田 聡, 古川壮一, 荻原博和, 森永 康
第64回生物工学会大会 2012年10月
培養できない微生物を培養するための新規技術開発 招待
青井議輝, 藤谷拓嗣, 常田 聡
日本微生物生態学会第28回大会，第4回日韓微生物生態シンポジウム 2012年9月
難培養性Nitrospiraの単離が排水処理プロセスでの亜硝酸酸化細菌の生理学的性質を明らかにする
藤谷拓嗣, 牛木章友, 常田 聡, 青井議輝
日本微生物生態学会第28回大会，第4回日韓微生物生態シンポジウム 2012年9月
Selective cultivation of nitrifying bacteria present in drinking water treatment plants
Kengo Momiuchi, Hirotsugu Fujitani, Norisuke Ushiki, Yoshiteru Aoi, Satoshi Tsuneda
14th International society for microbial ecology 2012年8月
Comparative physiological analysis of previously uncultured Nitrospira strains isolated from wastewater treatment plants
Norisuke Ushiki, Hirotsugu Fujitani, Yoshiteru Aoi, Satoshi Tsuneda
14th International society for microbial ecology 2012年8月
Novel method for uncultured nitrifying bacteria 招待 国際会議
Hirotsugu Fujitani, Norisuke Ushiki, Satoshi Tsuneda, Yoshiteru Aoi
14th International society for microbial ecology 2012年8月
排水処理槽内に生息する難培養性亜硝酸酸化細菌Nitrospiraの分離培養
牛木章友, 藤谷拓嗣, 常田 聡, 青井議輝
第14回化学工学会学生発表会 2012年3月
浄水処理プロセス由来の新規硝化細菌の分離培養
籾内研吾, 藤谷拓嗣, 常田 聡
日本微生物生態学会第27回大会 2011年10月
亜硝酸酸化細菌Nitrospiraの新規分離培養手法とその実証
藤谷拓嗣, 牛木章友, 常田 聡, 青井議輝
日本微生物生態学会第27回大会 2011年10月
Selective and highly enrichment of nitrite-oxidizing bacteria Nitrospira 国際会議
Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda, Yoshiteru Aoi
2nd International conference on nitrification 2011年7月
Selective and highly enrichment of nitrite-oxidizing bacteria Nitrospira 招待 国際会議
Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda, Yoshiteru Aoi
Early career scientist workshop ICoN2 2011年7月
難培養性亜硝酸酸化細菌Nitrospiraの増殖特性
藤谷拓嗣, 青井議輝, 常田 聡
日本微生物生態学会第26回大会 2010年11月
Selective and highly efficient enrichment of uncultured Nitrospira 国際会議
Hirotsugu Fujitani, Yoshiteru Aoi, Satoshi Tsuneda
13th International society for microbial ecology 2010年8月
難培養性亜硝酸酸化細菌Nitrospiraの分離培養
藤谷拓嗣, 青井議輝, 常田 聡
日本微生物生態学会第25回大会 2009年11月
Cultivation of uncultured nitrite-oxidizing bacteria 国際会議
Hirotsugu Fujitani, Yoshiteru Aoi, Satoshi Tsuneda
1st International Conference on Nitrification 2009年7月
難培養性亜硝酸酸化細菌Nitrospiraの新規分離培養法
藤谷拓嗣, 青井議輝, 常田 聡
第43回日本水環境学会年会 2009年3月
Cultivation of uncultured nitrite oxidizing bacteria 国際会議
Hirotsugu Fujitani, Yoshiteru Aoi, Satoshi Tsuneda
12th International society for microbial ecology 2008年8月
多摩川河口干潟の窒素循環に寄与する微生物群の解析
藤谷拓嗣, 石川大祐, 田嶋良行, 小関祥子, 陶 景倫, 小島茂明, 浦川秀敏, 常田 聡
第41回日本水環境学会年会 2007年3月
ポスター賞（金賞）
2023年3月 第11回日本生物工学会東日本支部コロキウム シングルセル観察で解き明かすアンモニア酸化細菌の分裂速度不均一性
池田秀斗
2020年度環境バイオテクノロジー学会奨励賞
2020年6月 環境バイオテクノロジー学会
藤谷拓嗣
最優秀発表賞（ポスター）
2019年10月 第6回国際硝化会議 A flexible survival strategy of ammonia-oxidizing bacteria by growth heterogeneity at a single cell level
一色理乃
優秀発表賞（ポスター）
2019年10月 第6回国際硝化会議 Enrichment of comammox and canonical Nitrospira from acidic soil: Insights into niche differentia-tion and adaptation to low pH
髙橋 悠
優秀発表賞（ポスター）
2019年9月 第33回日本微生物生態学会 細胞ごとに増殖速度のばらつきが大きいアンモニア酸化細菌のしなやかな生存戦略
一色理乃
優秀発表賞（ポスター）
2017年8月 環境微生物系学会合同大会2017 ゲノムから推定する遅増殖性Nitrotogaの活性促進因子
石井拳人
最優秀発表賞（ポスター）
2015年7月 第4回国際硝化会議 Isolation and successful subculture of Nitrosomonas mobilis lineage: Recovery of nature's lost treasure since 1970's
藤谷 拓嗣
博士研究奨励賞（オルガノ賞）
2013年11月 第16回日本水環境学会シンポジウム 難培養性亜硝酸酸化細菌Nitrospiraを標的とした革新的分離培養戦略
藤谷 拓嗣
最優秀発表賞（ポスター）
2013年7月 第5回国際水協会微生物生態学と水工学に関する特別会議 An innovative cultivation and isolation strategy for uncultured nitrite-oxidizing bacteria of the genus Nitrospira
藤谷 拓嗣
優秀発表賞（ポスター）
2012年9月 第28回日本微生物生態学会，第4回日韓微生物生態シンポジウム 難培養性Nitrospiraの単離が排水処理プロセスでの亜硝酸酸化細菌の生理学的性質を明らかにする
藤谷 拓嗣
最優秀発表賞（ポスター）
2009年11月 第25回日本微生物生態学会 難培養性亜硝酸酸化細菌Nitrospiraの分離培養
藤谷 拓嗣
優秀発表賞（クリタ賞）
2009年3月 第43回日本水環境学会 難培養性亜硝酸酸化細菌Nitrospiraの新規分離培養法
藤谷 拓嗣
好酸性comammox菌の生理学・ゲノム科学に基づく酸性硝化プロセスの実態解明
研究課題/領域番号：23H03570 2023年4月 - 2027年3月
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B) 中央大学
藤谷 拓嗣, 諏訪 裕一
配分額：18850000円 （ 直接経費：14500000円 、 間接経費：4350000円 ）
好酸性亜硝酸酸化細菌Nitrobacter sp. A67株で解き明かす酸性環境での硝化菌のすがた
研究課題/領域番号：23K05923 2023年4月 - 2026年3月
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C) 中央大学
諏訪 裕一, 藤谷 拓嗣
配分額：4680000円 （ 直接経費：3600000円 、 間接経費：1080000円 ）
陸域窒素循環のミッシングリンクを解く―酸性土壌の硝化の正体
研究課題/領域番号：19H01156 2019年4月 - 2023年3月
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(A) 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
多胡 香奈子, 早津 雅仁, 諏訪 裕一, 藤谷 拓嗣
資金種別：競争的資金
配分額：44980000円 （ 直接経費：34600000円 、 間接経費：10380000円 ）
昨年度、申請者らが分離した「新規耐酸性アンモニア酸化細菌－亜硝酸酸化細菌コミュニティー」における鍵となる新規な酸性適応型アンモニア酸化菌（GAO100株）を分離し、ドラフトゲノム解析を実施した。本年度は、このGAO100株のゲノム配列を決定しコードされる遺伝情報を解析した。さらに、申請者らが国内土壌から分離したγ-プロテオバクテリアに属す耐酸性アンモニア酸化細菌（Nitrosoglobus terrae）と既知の塩湖や海洋に生息する特にアンモニア酸化細菌（Nitrosococcus）とGAO100株の比較ゲノム解析を行い、機能の推定や進化的な類縁性を調査した。その結果、GAO100はNitrosococcusが保持している浸透圧耐性関係の遺伝子を維持していた。しかしNitrosoglobus terraeはこれらの遺伝子を失っていることからGAO100株はNitrosococcusが陸域に進出してNitrosoglobusと分岐する前の種である可能性が推察された。またNitrosoglobus terraeが失っている脱窒系の遺伝子を一部保持していた。この他、系統分類遺伝子の比較からGAO100株は、Nitrosoglobus terraeと好塩性アンモニア酸化細菌（Nitrosococcus）の中間に位置付けられた。一方、GAO100株は亜硝酸化菌を含む複数の細菌と安定的な凝集体を形成しており、純化過程で不安定になることから当初計画で予定したPVA（ポリビニルアルコール polyvinyl alcohol）多孔質体を用いた微生物コミュニティーとしての単離を試みた。しかしPVA多孔質体に微生物コミュニティーを形成させることは困難であった。GAO100株が生産する細胞外多糖と推定される物質がコミュニティーの安定化に寄与していると推定された。
培養技術とゲノム解析で紐解く硝化界のダークマター「完全アンモニア酸化細菌」
2019年4月 - 2022年3月
日本学術振興会科学研究費助成事業 令和元年度若手研究
藤谷 拓嗣
新学術領域研究令和2年度「先進ゲノム支援」
2020年4月 - 2021年3月
日本学術振興会 科学研究費助成事業
藤谷拓嗣
資金種別：競争的資金
2020年度国際学術誌投稿助成
2021年2月
中央大学
藤谷拓嗣
選択培地と集積培養に依存しない硝化菌の純粋分離
2018年6月 - 2020年3月
日本学術振興会科学研究費助成事業 平成30年度挑戦的研究（萌芽）
諏訪 裕一 藤谷 拓嗣
革新的分離培養技術で解明する硝化細菌の生理生態と多様性
2016年4月 - 2019年3月
日本学術振興会科学研究費助成事業 平成28年度若手研究B
藤谷 拓嗣
高緯度北極氷河後退域における硝化特性の遷移とその気候変動応答の解明
研究課題/領域番号：26304018 2014年4月 - 2019年3月
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B)
林 健太郎, 内田 雅己, 早津 雅仁, 田邊 優貴子, 小野 圭介, 藤嶽 暢英, 浅野 眞希, 藤谷 拓嗣, 服部 祥平, 白水 貴
配分額：17160000円 （ 直接経費：13200000円 、 間接経費：3960000円 ）
高緯度北極に位置するスバールバル諸島ニーオルスン近郊において，氷河後退域土壌の硝化特性（アンモニア酸化ポテンシャルおよび硝化微生物フロラ）の実態解明および環境操作応答について調査を行った．高緯度北極の未熟な土壌でも硝化が起きていることを明らかにしつつ，融雪・融水のかく乱やデブリの影響を受けやすい氷河後退域におけるクロノシーケンス法の適用の困難さ，オープントップチャンバーにより0.5℃前後の加温効果が得られることなどの今後の調査に資する情報が得られた．また，海鳥営巣崖下の崖錐土壌がきわめて高く正の温度応答を示す硝化能と脱窒能を有し，現場において一酸化二窒素の放出が起こりうることを明らかにした．
メタゲノム解析から発見された新規なComammox細菌の分離培養と性状解析
2017年12月 - 2018年11月
公益財団法人発酵研究所 平成29年度（2017年度）研究者招聘・留学助成
藤谷 拓嗣
部分硝化の制御・安定化を志向した多様な硝化細菌の生理学的解析
2017年10月 - 2018年9月
公益財団法人クリタ水・環境科学振興財団 2017年度国内研究助成
藤谷 拓嗣
新学術領域研究平成29年度「先進ゲノム支援」
2017年9月 - 2018年3月
日本学術振興会 科学研究費助成事業
藤谷 拓嗣
資金種別：競争的資金
土壌微生物の細胞形態変化による低濃度基質利用機構の解明
研究課題/領域番号：16K14874 2016年4月 - 2018年3月
日本学術振興会 科学研究費助成事業 挑戦的萌芽研究 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
早津 雅仁, 藤谷 拓嗣
配分額：3770000円 （ 直接経費：2900000円 、 間接経費：870000円 ）
本課題では、硝化菌細胞凝集体は生育に不利な環境で生存能力が優れていることを示すことを目的とし、次の結果を得た。安定的に増殖するNitrosoglobus属のアンモニア酸化細菌凝集体には10％程度の従属栄養細菌が共存していた。Nitrosoglobus属新種の存在を明らかにし、それらが亜硝酸酸化菌・従属栄養細菌と細胞凝集体を形成し共存することを示した。酸性環境に適応したCOMAMMOX菌の存在を明らかにし、この菌は複数種の従属栄養菌と凝集体を形成していることを示した。これらの結果から硝化菌とある種の従属栄養菌は凝集体中で共存し劣悪な環境に適応していると考えられた。
窒素循環の制御とN2O生成の抑制を志向した硝化・脱窒菌の網羅的獲得
2017年1月 - 2017年12月
公益財団法人前川報恩会 平成28年度学術研究助成
藤谷 拓嗣
部分硝化の制御・安定化を志向した多様な硝化細菌の生理学的解析
2016年10月 - 2017年9月
公益財団法人クリタ水・環境科学振興財団 2016年度国内研究助成
藤谷 拓嗣
新学術領域研究平成28年度「先進ゲノム支援」
2016年9月 - 2017年3月
日本学術振興会 科学研究費助成事業
藤谷 拓嗣
資金種別：競争的資金
N2O生成に関与する硝化・脱窒細菌の網羅的遺伝子解析と分離培養
2016年2月 - 2016年12月
一般財団法人前川報恩会 平成27年度学術研究助成
藤谷 拓嗣
環境中に潜在する硝化細菌の網羅的・高速ハンティング
2015年7月 - 2016年3月
早稲田大学 2015年度特定課題研究助成費（特定課題B）
藤谷 拓嗣
硝化細菌のマイクロコロニー形成機構の解明
2015年4月 - 2016年3月
早稲田大学 2015年度特定課題研究助成費（基礎助成）
藤谷 拓嗣
窒素循環に寄与する新規なアンモニア酸化細菌・古細菌の分離培養と機能解明
2014年7月 - 2015年3月
早稲田大学 2014年度特定課題研究助成費（特定課題B）
藤谷 拓嗣
nxrB遺伝子に基づく新規な亜硝酸酸化細菌の探索
2014年4月 - 2015年3月
早稲田大学 2014年度特定課題研究助成費（基礎助成）
藤谷 拓嗣
NxrB遺伝子に基づく新規な亜硝酸酸化細菌の探索・分離培養
2014年4月 - 2015年2月
公益財団法人日本科学協会 平成26年度笹川科学研究助成（学術研究部門，生物系）
藤谷 拓嗣
未培養性アンモニア酸化細菌・古細菌を標的としたハイスループット新規分離培養手法の開発
2013年6月 - 2014年3月
早稲田大学 2013年度特定課題研究助成費（新任の教員等）
藤谷 拓嗣
窒素循環に寄与する難培養性亜硝酸酸化細菌Nitrospiraの分離培養
2011年4月 - 2012年2月
公益財団法人日本科学協会 平成23年度笹川科学研究助成（学術研究部門，生物系）
藤谷 拓嗣
中学校・高等学校教諭専修免許状（理科）
2009年3月
中学校・高等学校教諭1種免許状（理科）
2007年3月
理工学基礎実験IB
機関名：早稲田大学基幹理工学部・創造理工学部・先進理工学部
理工学基礎実験IA
機関名：早稲田大学基幹理工学部・創造理工学部・先進理工学部
生命医科学実験I
機関名：早稲田大学先進理工学部生命医科学科
環境生物学実験
機関名：中央大学理工学部生命科学科
環境応用微生物学
機関名：中央大学理工学部生命科学科
私たちの生活に身近な微生物の世界
役割：講師
公益財団法人文京アカデミー 文京アカデミア講座 2022年6月 - 2022年7月
Local organizing committee members
役割：運営参加・支援
国際水協会（IWA） Microbial Ecology and Water Engineering 2019 2019年11月
かくれているものは，なぁに？
役割：運営参加・支援, 実演
国立研究開発法人産業技術総合研究所 2019年産総研一般公開 2019年7月
身のまわりの光を見てみよう！
役割：講師, 実演
国立研究開発法人科学技術振興機構（JST） 新宿SPP（Science Partnership Project）新宿区立西早稲田中学校2年生対象 2017年11月
Local organizing committee members
役割：運営参加・支援
公益社団法人日本生物工学会 第69回日本生物工学会大会 2017年9月
光る生物の解明をしよう！
役割：講師, 実演
国立研究開発法人科学技術振興機構（JST） 新宿SPP（Science Partnership Project）新宿区立牛込第一中学校2年生対象 2014年11月
Local organizing committee members
役割：運営参加・支援
公益社団法人日本水環境学会 Water and Environment Technology Conference 2014 2014年6月
夢を叶えるために，今必要なこと
役割：講師
東京都青梅市立第二中学校 平成25年度第3学年進路講演会 2014年3月
Local organizing committee members
役割：運営参加・支援
Nitrification Network 3rd International conference on nitrification 2013年9月
目には見えないミクロの世界をのぞいてみよう！―未知なる世界への挑戦―
役割：司会, 講師, 運営参加・支援, 実演
早稲田大学理工学術院 第23回ユニラブ（小中学生のための科学実験教室） 2010年8月
