2024/07/17 更新

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フジタニ　ヒロツグ
藤谷　拓嗣
FUJITANI Hirotsugu
所属
理工学部 助教C
連絡先
メールによる問い合わせは《こちら》から
プロフィール
大学院生の頃から，地球の窒素循環を駆動させる微生物（硝化菌）を対象に研究しています。培養が難しい硝化菌を獲得するための技術を開発したり，獲得した硝化菌の性状（生理学的な性質やゲノム）を調べてきました。これまでの経験から，個々の微生物が持つ増殖様式や増殖メカニズムは，私たちの予想を超えて多岐に渡っており，神秘的な生命活動が営まれていることが分かってきました。また，同種・異種微生物間相互作用によって生命活動が維持されているケースもあり，微生物といえど一人では生きられない生き物のようです。培養が困難な未培養微生物を獲得することで，科学的にも社会的にも重要かつ面白い発見が可能になります。このフィロソフィを大切にしながら，生命が持つ神秘を追求していきたいです。
外部リンク

学位

  • 博士（工学） （ 早稲田大学 ）

  • 修士（工学） （ 早稲田大学 ）

学歴

  • 2013年3月
     

    早稲田大学   先進理工学研究科   生命医科学専攻   博士   修了

  • 2009年3月
     

    早稲田大学   先進理工学研究科   生命医科学専攻   修士   修了

  • 2007年3月
     

    早稲田大学   理工学部   応用化学科   卒業

経歴

  • 2020年4月 - 現在

    中央大学   理工学部   助教

  • 2019年1月 - 現在

    早稲田大学   ナノ・ライフ創新研究機構 未来イノベーション研究所   招聘研究員

  • 2019年1月 - 2020年3月

    国立研究開発法人 産業技術総合研究所   バイオメディカル研究部門   特別研究員

  • 2018年4月 - 2018年12月

    早稲田大学   ナノ・ライフ創新研究機構 ライフサポートイノベーション研究所   次席研究員（研究院講師）

  • 2018年1月 - 2018年12月

    デンマーク工科大学   環境工学部   客員研究員

  • 2016年4月 - 2018年3月

    早稲田大学   ナノ・ライフ創新研究機構 ライフサポートイノベーション研究所   次席研究員

  • 2013年4月 - 2016年3月

    早稲田大学   先進理工学部生命医科学科   助手

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所属学協会

  • 環境バイオテクノロジー学会

  • 国際微生物生態学会

  • 日本水環境学会

  • 日本微生物生態学会

  • 日本ゲノム微生物学会

研究キーワード

  • 亜硝酸酸化

  • 排水

  • 培養

  • 硝化

  • 硝化菌

  • 生理生態

  • 微生物生態

  • 環境微生物

  • 微生物間相互作用

  • 土壌

  • 分離

  • 窒素循環

  • ゲノム

  • アンモニア酸化

  • 従属栄養

  • 独立栄養

研究分野

  • ものづくり技術（機械・電気電子・化学工学） / バイオ機能応用、バイオプロセス工学  / 生物機能・バイオプロセス

  • ライフサイエンス / 生態学、環境学

  • ライフサイエンス / 応用微生物学

  • ライフサイエンス / 多様性生物学、分類学

論文

  • Variation in growth rates between cultures hinders the cultivation of ammonia-oxidizing bacteria 査読

    Rino Isshiki, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda

    FEMS Microbiology Letters   371   2024年1月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Oxford University Press (OUP)  

    Abstract

    Ammonia-oxidizing bacteria, key players in the nitrogen cycle, have been the focus of extensive research. Numerous novel species have been isolated and their growth dynamics were studied. Despite these efforts, controlling their growth to obtain diverse physiological findings remains a challenge. These bacteria often fail to grow, even under optimal conditions. This unpredictable growth pattern could be viewed as a survival strategy. Understanding this heterogeneous behavior could enhance our ability to culture these bacteria. In this study, the variation in the growth rate was quantified for the ammonia-oxidizing bacterium Nitrosomonas mobilis Ms1. Our findings revealed significant growth rate variation under low inoculum conditions. Interestingly, higher cell densities resulted in more stable cultures. A comparative analysis of three Nitrosomonas species showed a correlation between growth rate variation and culture failure. The greater the variation in growth rate, the higher the likelihood of culture failure.

    DOI： 10.1093/femsle/fnae013

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    その他リンク： https://academic.oup.com/femsle/article-pdf/doi/10.1093/femsle/fnae013/56963691/fnae013.pdf

  • Characterisation of bacteria representing a novel Nitrosomonas clade: Physiology, genomics and distribution of missing ammonia oxidizer. 査読 国際誌

    Shuta Kikuchi, Hirotsugu Fujitani, Kento Ishii, Rino Isshiki, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda

    Environmental Microbiology Reports   15 ( 5 )   404 - 416   2023年4月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Members of the genus Nitrosomonas are major ammonia oxidizers that catalyse the first step of nitrification in various ecosystems. To date, six subgenus-level clades have been identified. We have previously isolated novel ammonia oxidizers from an additional clade (unclassified cluster 1) of the genus Nitrosomonas. In this study, we report unique physiological and genomic properties of the strain PY1, compared with representative ammonia-oxidising bacteria (AOB). The apparent half-saturation constant for total ammonia nitrogen and maximum velocity of strain PY1 were 57.9 ± 4.8 μM NH3  + NH4 + and 18.5 ± 1.8 μmol N (mg protein)-1  h-1 , respectively. Phylogenetic analysis based on genomic information revealed that strain PY1 belongs to a novel clade of the Nitrosomonas genus. Although PY1 contained genes to withstand oxidative stress, cell growth of PY1 required catalase to scavenge hydrogen peroxide. Environmental distribution analysis revealed that the novel clade containing PY1-like sequences is predominant in oligotrophic freshwater. Taken together, the strain PY1 had a longer generation time, higher yield and required reactive oxygen species (ROS) scavengers to oxidize ammonia, compared with known AOB. These findings expand our knowledge of the ecophysiology and genomic diversity of ammonia-oxidising Nitrosomonas.

    DOI： 10.1111/1758-2229.13158

    PubMed

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  • Effects of Co-existing Heterotrophs on Physiology of and Nitrogen Metabolism in Autotrophic Nitrite-oxidizing <i>Candidatus</i> Nitrotoga

    Hiroto Ide, Kento Ishii, Yu Takahashi, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda

    Microbes and Environments   38 ( 4 )   n/a - n/a   2023年

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Japanese Society of Microbial Ecology  

    DOI： 10.1264/jsme2.me23076

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  • 未培養硝化菌の分離戦略と特徴づけ 招待 査読

    藤谷拓嗣

    環境バイオテクノロジー学会誌   21 ( 1 )   53 - 58   2021年8月

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    担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

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  • Microdroplet-based system for culturing of environmental microorganisms using FNAP-sort 査読

    Kanako Saito, Yuri Ota, Dieter M. Tourlousse, Satoko Matsukura, Hirotsugu Fujitani, Masamune Morita, Satoshi Tsuneda, Naohiro Noda

    Scientific Reports   11 ( 1 )   9506   2021年5月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Nature Research  

    DOI： 10.1038/s41598-021-88974-2

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    その他リンク： http://www.nature.com/articles/s41598-021-88974-2

  • Nitrogen and oxygen isotope signatures of nitrogen compounds during anammox in the laboratory and a wastewater treatment plant 査読

    Shotoku Kotajima, Keisuke Koba, Daisuke Ikeda, Akihiko Terada, Kazuichi Isaka, Kazuya Nishina, Yuuya Kimura, Akiko Makabe, Midori Yano, Hirotsugu Fujitani, Norisuke Ushiki, Satoshi Tsuneda, Muneoki Yoh

    Microbes and Environments   35 ( 4 )   ME20031   2020年11月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1264/jsme2.ME20031

    PubMed

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  • Genomic and Physiological Characteristics of a Novel Nitrite-Oxidizing Nitrospira Strain Isolated From a Drinking Water Treatment Plant

    Hirotsugu Fujitani, Kengo Momiuchi, Kento Ishii, Manami Nomachi, Shuta Kikuchi, Norisuke Ushiki, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda

    Frontiers in Microbiology   11   2020年9月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Frontiers Media S.A.  

    Nitrite-oxidizing bacteria (NOB) catalyze the second step of nitrification, which is an important process of the biogeochemical nitrogen cycle and is exploited extensively as a biological nitrogen removal process. Members of the genus Nitrospira are often identified as the dominant NOB in a diverse range of natural and artificial environments. Additionally, a number of studies examining the distribution, abundance, and characterization of complete ammonia oxidation (comammox) Nitrospira support the ecological importance of the genus Nitrospira. However, niche differentiation between nitrite-oxidizing Nitrospira and comammox Nitrospira remains unknown due to a lack of pure cultures. In this study, we report the isolation, physiology, and genome of a novel nitrite-oxidizing Nitrospira strain isolated from a fixed-bed column at a drinking water treatment plant. Continuous feeding of ammonia led to the enrichment of Nitrospira-like cells, as well as members of ammonia-oxidizing genus Nitrosomonas. Subsequently, a microcolony sorting technique was used to isolate a novel nitrite-oxidizing Nitrospira strain. Sequences of strains showing the growth of microcolonies in microtiter plates were checked. Consequently, the most abundant operational taxonomic unit (OTU) exhibited high sequence similarity with Nitrospira japonica (98%) at the 16S rRNA gene level. The two other Nitrospira OTUs shared over 99% sequence similarities with N. japonica and Nitrospira sp. strain GC86. Only one strain identified as Nitrospira was successfully subcultivated and designated as Nitrospira sp. strain KM1 with high sequence similarity with N. japonica (98%). The half saturation constant for nitrite and the maximum nitrite oxidation rate of strain KM1 were orders of magnitude lower than the published data of other known Nitrospira strains
    moreover, strain KM1 was more sensitive to free ammonia compared with previously isolated Nitrospira strains. Therefore, the new Nitrospira strain appears to be better adapted to oligotrophic environments compared with other known non-marine nitrite oxidizers. The complete genome of strain KM1 was 4,509,223 bp in length and contained 4,318 predicted coding sequences. Average nucleotide identities between strain KM1 and known cultured Nitrospira genome sequences are 76.7–78.4%, suggesting at least species-level novelty of the strain in the Nitrospira lineage II. These findings broaden knowledge of the ecophysiological diversity of nitrite-oxidizing Nitrospira.

    DOI： 10.3389/fmicb.2020.545190

    Scopus

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  • Enrichment of comammox and nitrite-oxidizing Nitrospira from acidic soil 査読

    Yu Takahashi, Hirotsugu Fujitani, Yuhei Hirano, Kanako Tago, Yong Wang, Masahito Hayatsu, Satoshi Tsuneda

    Frontiers in Microbiology   11 ( 1737 )   2020年7月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Frontiers  

    DOI： 10.3389/fmicb.2020.01737

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  • MazF endoribonucleolytic toxin conserved in Nitrospira specifically cleaves the AACU, AACG, and AAUU motifs 査読

    Rie Aoi, Tatsuki Miyamoto, Akiko Yokota, Yuri Ota, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda, Naohiro Noda

    Toxins   12 ( 5 )   287   2020年4月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：MDPI  

    DOI： 10.3390/toxins12050287

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  • Physiological and genomic characterization of a new “Candidatus Nitrotoga” isolate 査読

    Kento Ishii, Hirotsugu Fujitani, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda

    Environmental Microbiology   22 ( 6 )   2365 - 2382   2020年4月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Wiley-Blackwell  

    DOI： 10.1111/1462-2920.15015

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  • Transcriptome analysis of the ammonia-oxidizing bacterium Nitrosomonas mobilis Ms1 reveals division of labor between aggregates and free-living cells 査読

    Rino Isshiki, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda

    Microbes and Environments   35 ( 2 )   2020年2月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Japanese Society of Microbial Ecology  

    DOI： 10.1264/jsme2.ME19148

    PubMed

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  • Successful enrichment of low-abundant comammox Nitrospira from nitrifying granules under ammonia-limited conditions 査読

    Hirotsugu Fujitani†, Manami Nomachi†, Yu Takahashi†, Yoshiaki Hasebe, Masahiro Eguchi, Satoshi Tsuneda

    FEMS Microbiology Letters   367 ( 1 )   fna025   2020年2月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Oxford Academic  

    DOI： 10.1093/femsle/fnaa025

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  • Draft genome sequence of Acidovorax sp. strain NB1 isolated from a nitrite-oxidizing enrichment culture 査読

    Hiroto Ide, Kento Ishii, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda

    Microbiology Resource Announcements   8 ( 33 )   e00547-19   2019年8月

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    担当区分：責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

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  • Seabird-affected taluses are denitrification hotspots and potential N2O emitters in the High Arctic 査読

    Hayashi, Kentaro, Tanabe, Yukiko, Ono, Keisuke, Loonen, Maarten J. J. E., Asano, Maki, Fujitani, Hirotsugu, Tokida, Takeshi, Uchida, Masaki, Hayatsu, Masahito

    Scientific Reports   8 ( 17261 )   2018年11月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1038/s41598-018-35669-w

    Web of Science

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  • Genomic analysis of two phylogenetically distinct Nitrospira species reveals their genomic plasticity and functional diversity 査読

    Norisuke Ushiki, Hirotsugu Fujitani, Yu Shimada, Tomohiro Morohoshi, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda

    Frontiers in Microbiology   8 ( 2637 )   2018年1月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Frontiers Media S.A.  

    The genus Nitrospira represents a dominant group of nitrite-oxidizing bacteria in natural and engineered ecosystems. This genus is phylogenetically divided into six lineages, for which vast phylogenetic and functional diversity has been revealed by recent molecular ecophysiological analyses. However, the genetic basis underlying these phenotypic differences remains largely unknown because of the lack of genome sequences representing their diversity. To gain a more comprehensive understanding of Nitrospira, we performed genomic comparisons between two Nitrospira strains (ND1 and NJ1 belonging to lineages I and II, respectively) previously isolated from activated sludge. In addition, the genomes of these strains were systematically compared with previously reported six Nitrospira genomes to reveal their similarity and presence/absence of several functional genes/operons. Comparisons of Nitrospira genomes indicated that their genomic diversity reflects phenotypic differences and versatile nitrogen metabolisms. Although most genes involved in key metabolic pathways were conserved between strains ND1 and NJ1, assimilatory nitrite reduction pathways of the two Nitrospira strains were different. In addition, the genomes of both strains contain a phylogenetically different urease locus and we confirmed their ureolytic activity. During gene annotation of strain NJ1, we found a gene cluster encoding a quorum-sensing system. From the enriched supernatant of strain NJ1, we successfully identified seven types of acyl-homoserine lactones with a range of C10-C14. In addition, the genome of strain NJ1 lacks genes relevant to flagella and the clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR)-Cas (CRISPR-associated genes) systems, whereas most nitrifying bacteria including strain ND1 possess these genomic elements. These findings enhance our understanding of genomic plasticity and functional diversity among members of the genus Nitrospira.

    DOI： 10.3389/fmicb.2017.02637

    Scopus

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  • Enrichment and Physiological Characterization of a Cold-Adapted Nitrite-Oxidizing Nitrotoga sp from an Eelgrass Sediment 査読

    Kento Ishii, Hirotsugu Fujitani, Kentaro Soh, Tatsunori Nakagawa, Reiji Takahashi, Satoshi Tsuneda

    Applied and Environmental Microbiology   83 ( 14 )   e00549-17   2017年7月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1128/AEM.00549-17

    Web of Science

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  • Nitrite oxidation kinetics of two Nitrospira strains: The quest for competition and ecological niche differentiation 査読

    Norisuke Ushiki, Masaru Jinno, Hirotsugu Fujitani, Toshikazu Suenaga, Akihiko Terada, Satoshi Tsuneda

    Journal of Bioscience and Bioengineering   123 ( 5 )   581 - 589   2017年5月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1016/j.jbiosc.2016.12.016

    Web of Science

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  • Detection and Diversity of the Nitrite Oxidoreductase Alpha Subunit (nxrA) Gene of Nitrospina in Marine Sediments 査読

    Sundas Rani, Hyeon-Woo Koh, Sung-Keun Rhee, Hirotsugu Fujitani, Soo-Je Park

    Microbial Ecology   73 ( 1 )   111 - 122   2017年1月

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    担当区分：責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1007/s00248-016-0897-3

    Web of Science

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  • A rapid collection of yet unknown ammonia oxidizers in pure culture from activated sludge 査読

    Takuma Abe, Norisuke Ushiki, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda

    Water Research   108   169 - 178   2017年1月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1016/j.watres.2016.10.070

    Web of Science

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  • Ecophysiology and Comparative Genomics of Nitrosomonas mobilis Ms1 Isolated from Autotrophic Nitrifying Granules of Wastewater Treatment Bioreactor 査読

    Soe Myat Thandar, Norisuke Ushiki, Hirotsugu Fujitani, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda

    Frontiers in Microbiology   7 ( 1869 )   2016年11月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.3389/fmicb.2016.01869

    Web of Science

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  • Physical enrichment of uncultured Accumulibacter and Nitrospira from activated sludge by unlabeled cell sorting technique 査読

    Kana Irie, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda

    Journal of Bioscience and Bioengineering   122 ( 4 )   475 - 481   2016年10月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1016/j.jbiosc.2016.03.020

    Web of Science

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  • Selective isolation of ammonia-oxidizing bacteria from autotrophic nitrifying granules by applying cell-sorting and sub-culturing of microcolonies 査読

    Hirotsugu Fujitani, Asami Kumagai, Norisuke Ushiki, Kengo Momiuchi, Satoshi Tsuneda

    Frontiers in Microbiology   6 ( 1159 )   2015年10月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.3389/fmicb.2015.01159

    Web of Science

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  • 難培養性亜硝酸酸化細菌Nitrospiraを標的とした新規な分離培養戦略 招待 査読

    藤谷拓嗣, 常田 聡

    環境バイオテクノロジー学会誌   14 ( 2 )   99 - 103   2015年3月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：環境バイオテクノロジー学会  

    CiNii Books

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  • Isolation of sublineage I Nitrospira by a novel cultivation strategy 査読

    Hirotsugu Fujitani, Norisuke Ushiki, Satoshi Tsuneda, Yoshiteru Aoi

    Environmental Microbiology   16 ( 10 )   3030 - 3040   2014年10月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1111/1462-2920.12248

    Web of Science

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  • Isolation of Nitrospira belonging to Sublineage II from a Wastewater Treatment Plant 査読

    Norisuke Ushiki, Hirotsugu Fujitani, Yoshiteru Aoi, Satoshi Tsuneda

    Microbes and Environments   28 ( 3 )   346 - 353   2013年9月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1264/jsme2.ME13042

    Web of Science

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  • Selective enrichment of two different types of Nitrospira-like nitrite-oxidizing bacteria from a wastewater treatment plant 査読

    Hirotsugu Fujitani, Yoshiteru Aoi, Satoshi Tsuneda

    Microbes and Environments   28 ( 2 )   236 - 243   2013年6月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1264/jsme2.ME12209

    Scopus

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MISC

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講演・口頭発表等

  • 亜硝酸酸化細菌Nitrobacter sp. CN101株の高温と低温による遺伝子発現の違い

    白石 夕貴, 諏訪 裕一, 藤谷 拓嗣

    日本微生物生態学会第36回大会，第13回アジア微生物生態シンポジウム  2023年11月 

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    開催年月日： 2023年11月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • Comammox集積培養で共存する耐酸性アンモニア酸化細菌Nitrosospiraの系統と生理学

    宮田 莉加子, 三星 峻, 角野 立夫, 諏訪 裕一, 藤谷 拓嗣

    日本微生物生態学会第36回大会，第13回アジア微生物生態シンポジウム  2023年11月 

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    開催年月日： 2023年11月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 部分硝化リアクターから単離したクラスター7アンモニア酸化細菌の亜酸化窒素生成ダイナミクス：ゲノムおよび生理学的特性からの考察

    大石 彬人, 大野 哲, 末永 俊和, 藤谷 拓嗣, 諏訪 裕一, 黒岩 恵, 寺田 昭彦

    日本微生物生態学会第36回大会，第13回アジア微生物生態シンポジウム  2023年11月 

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    開催年月日： 2023年11月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • A novel nitrite-oxidizing Nitrobacter sp. strain A67 isolated from agricultural soil adapts to moderately acidic pH

    Ayano Kaneko, Yuta Endo, Takuya Ninomiya, Megumi Kuroiwa, Hirotsugu Fujitani, Yuichi Suwa

    36th Japanese Society Microbial Ecology Annual Meeting and 13th Asian Symposium on Microbial Ecology  2023年11月 

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    開催年月日： 2023年11月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Individual-level phenotypic heterogeneity in ammonia-oxidizing bacteria revealed by single-cell observation

    Shuto Ikeda, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda

    36th Japanese Society Microbial Ecology Annual Meeting and 13th Asian Symposium on Microbial Ecology  2023年11月 

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    開催年月日： 2023年11月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • アンモニア酸化菌の増殖が細胞ごとにばらつく影響と意義

    一色 理乃, 藤谷 拓嗣, 常田 聡

    日本微生物生態学会第36回大会，第13回アジア微生物生態シンポジウム  2023年11月 

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    開催年月日： 2023年11月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 農耕地土壌からの耐酸性comammox細菌の実験室培養の獲得

    古屋 日向乃, 藤谷 拓嗣, 諏訪 裕一

    日本微生物生態学会第36回大会，第13回アジア微生物生態シンポジウム  2023年11月 

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    開催年月日： 2023年11月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 酸性土壌からの耐酸性亜硝酸酸化細菌の集積培養

    村田 璃奈, 菊地 麻友, 藤谷 拓嗣, 諏訪 裕一

    日本微生物生態学会第36回大会，第13回アジア微生物生態シンポジウム  2023年11月 

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    開催年月日： 2023年11月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 15N標識N2Oを使用した土壌からのN2Oのgross生成速度の測定の試み

    清水 千尋, 大友 優里, 黒岩 恵, 藤谷 拓嗣, 徳田 進一, 早津 雅仁, 多胡 香奈子, 諏訪 裕一

    日本微生物生態学会第36回大会，第13回アジア微生物生態シンポジウム  2023年11月 

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    開催年月日： 2023年11月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 培養時間が農耕地土壌のグロス硝化速度に与える影響

    大友 優里, 黒岩 恵, 藤谷 拓嗣, 徳田 進一, 早津 雅仁, 多胡 香奈子, 諏訪 裕一

    日本微生物生態学会第36回大会，第13回アジア微生物生態シンポジウム  2023年11月 

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    開催年月日： 2023年11月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 耐/好酸性comammoxの分離戦略 〜2. 無機培地での回分培養〜

    中村 颯太, 三星 峻, 角野 立夫, 諏訪 裕一, 藤谷 拓嗣

    日本微生物生態学会第36回大会，第13回アジア微生物生態シンポジウム  2023年11月 

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    開催年月日： 2023年11月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • Genomic and physiological insights into N2O emissions by cluster 7 ammonia-oxidizing bacteria isolated from partial nitrifying bioreactors

    Akito Oishi, Toshikazu Suenaga, Hirotsugu Fujitani, Yuichi Suwa, Megumi Kuroiwa, Akihiko Terada

    8th International Conference on Nitrification  2023年7月 

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    開催年月日： 2023年7月 - 2023年8月

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Growth heterogeneity of divided cells affects the culturability of ammonia-oxidizing bacteria

    Shuto Ikeda, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda

    8th International Conference on Nitrification  2023年7月 

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    開催年月日： 2023年7月 - 2023年8月

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Temperature dependence in nitrite oxidation and gene expression by a Nitrobacter sp.

    Yuki Shiraishi, Yuichi Suwa, Hirotsugu Fujitani

    8th International Conference on Nitrification  2023年7月 

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    開催年月日： 2023年7月 - 2023年8月

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Isolation and physiological characterization of a novel nitrite-oxidizing bacterium, Nitrobacter sp. A67 which accommodates to moderately acidic pH from agricultural soil

    Ayano Kaneko, Yuta Endo, Takuya Ninomiya, Megumi Kuroiwa, Hirotsugu Fujitani, Yuichi Suwa

    8th International Conference on Nitrification  2023年7月 

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    開催年月日： 2023年7月 - 2023年8月

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • シングルセル観察で解き明かすアンモニア酸化細菌の分裂速度不均一性

    池田 秀斗, 藤谷 拓嗣, 常田 聡

    第11回日本生物工学会東日本支部コロキウム  2023年3月 

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    開催年月日： 2023年3月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • アンモニア酸化細菌Nitrosomonasにおける個体レベルの表現型不均一性の解析

    池田 秀斗, 一色 理乃, 藤谷 拓嗣, 常田 聡

    日本微生物生態学会第35回大会  2022年11月 

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    開催年月日： 2022年10月 - 2022年11月

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • シングルドロップレット分取技術を用いた環境微生物の培養

    野田 尚宏, 大田 悠里, 斉藤 加奈子, Dieter M Tourlousse, 高木 妙子, 松倉 智子, 森田 雅宗, 藤谷 拓嗣, 常田 聡

    日本微生物生態学会第35回大会  2022年11月 

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    開催年月日： 2022年10月 - 2022年11月

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • アンモニア酸化細菌3株における難培養性と増殖速度のばらつきの比較

    一色 理乃, 藤谷 拓嗣, 常田 聡

    日本微生物生態学会第35回大会  2022年11月 

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    開催年月日： 2022年10月 - 2022年11月

    記述言語：日本語  

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  • 耐酸性comammoxの分離戦略

    三星 峻, 角野 立夫, 諏訪 裕一, 藤谷 拓嗣

    日本微生物生態学会第35回大会  2022年11月 

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    開催年月日： 2022年10月 - 2022年11月

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • Bacterial growth heterogeneity causes persistent infection and unculturability in environment

    Rino Isshiki, Naoki Yamamoto, Yuto Kawai, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda

    The 15th Korea-Japan Symposium on Microbiology  2022年10月 

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    開催年月日： 2022年10月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • Combination of droplet based cultivation and single droplet sorting paves the way for isolating slow growers in soil

    Yuri Ota, Kanako Saito, Dieter Tourlousse, Taeko Takagi, Satoko Matsukura, Masamune Morita, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda, Naohiro Noda

    18th International society for microbial ecology  2022年8月 

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    開催年月日： 2022年8月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Genomics of acid adapted comammox and nitrite-oxidizing Nitrospira: are they specialists on low pH or generalists surviving a broad range of pH?

    Yu Takahashi, Hirotsugu Fujitani, Itsuki Tanguchi, Tetsuya Hayashi, Kanako Tago, Masahito Hayatsu, Satoshi Tsuneda

    18th International society for microbial ecology  2022年8月 

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    開催年月日： 2022年8月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Comparison of three strains of ammonia-oxidizing bacteria to reveal the relationship between culturability and growth heterogeneity

    Rino Isshiki, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda

    18th International society for microbial ecology  2022年8月 

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    開催年月日： 2022年8月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • 活性化エネルギーから見る亜硝酸酸化細菌の温度依存性の比較

    白石 夕貴, 諏訪 裕一, 藤谷 拓嗣

    日本微生物生態学会第34回大会  2021年10月 

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    開催年月日： 2021年10月 - 2021年11月

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 亜硝酸に対して親和性の高い土壌亜硝酸酸化細菌Nitrobacter sp. CN101の生理学とゲノム科学

    小林 陽一郎, 二宮 拓也, 藤谷 拓嗣, 黒岩 恵, 諏訪 裕一

    日本微生物生態学会第34回大会  2021年10月 

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    開催年月日： 2021年10月 - 2021年11月

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 好酸性亜硝酸酸化細菌Nitrobacter sp. A67株の分離と生理学的特徴づけー硝化コミュニティーの唯一のエネルギー源として尿素を用いた硝化菌の分離戦略―

    遠藤 優太, 藤谷 拓嗣, 二宮 拓也, 小林 陽一郎, 黒岩 恵, 諏訪 裕一

    日本微生物生態学会第34回大会  2021年10月 

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    開催年月日： 2021年10月 - 2021年11月

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 酸性条件下における硝化の担い手は誰か

    三星 峻, 角野 立夫, 遠藤 優太, 諏訪 裕一, 藤谷 拓嗣

    日本微生物生態学会第34回大会  2021年10月 

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    開催年月日： 2021年10月 - 2021年11月

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 土壌抽出液培地による新規な硝化菌培養の可能性２〜酸性森林土壌の場合〜

    菊地 麻友, 高山 祐子, 三星 峻, 梅澤 千尋, 高橋 昌平, 古屋 日向乃, 黒岩 恵, 磯部 一夫, 藤谷 拓嗣, 諏訪 裕一

    日本微生物生態学会第34回大会  2021年10月 

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    開催年月日： 2021年10月 - 2021年11月

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 好酸性NOB Nitrobacter sp. A67と共存するアンモニア酸化アーキアの集積培養

    高山 祐子, 遠藤 優太, 二宮 拓也, 黒岩 恵, 藤谷 拓嗣, 諏訪 裕一

    日本微生物生態学会第34回大会  2021年10月 

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    開催年月日： 2021年10月 - 2021年11月

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 弱酸性硝化リアクターで集積培養された新規なcomammox Nitrospiraのコンプリートゲノムの構築

    髙橋 悠, 藤谷 拓嗣, 谷口 愛樹, 林 哲也, 多胡 香奈子, 早津 雅仁, 常田 聡

    日本微生物生態学会第34回大会  2021年10月 

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    開催年月日： 2021年10月 - 2021年11月

    記述言語：日本語  

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  • 亜硝酸酸化細菌Nitrospiraにおける2種類のMazEF機構の機能解析

    葵 理恵, 宮本 龍樹, 岡部 拓真, 横田 亜紀子, 大田 悠里, 藤谷 拓嗣, 常田 聡, 野田 尚宏

    日本微生物生態学会第34回大会  2021年10月 

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    開催年月日： 2021年10月 - 2021年11月

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 環境微生物獲得のためのwater-in-oilドロップレット培養手法の構築

    大田 悠里, 斉藤 加奈子, Dieter M Tourlousse, 松倉 智子, 高木 妙子, 藤谷 拓嗣, 森田 雅宗, 常田 聡, 野田 尚宏

    環境バイオテクノロジー学会2021年度大会  2021年9月 

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    開催年月日： 2021年9月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • 茶園の酸性土壌に生息する硝化菌Nitrospiraの集積培養

    髙橋 悠, 藤谷 拓嗣, 廣野 祐平, 多胡 香奈子, 早津 雅仁, 常田 聡

    環境バイオテクノロジー学会2021年度大会  2021年9月 

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    開催年月日： 2021年9月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • 未培養硝化菌の分離戦略と生理生態 招待

    藤谷拓嗣

    環境バイオテクノロジー学会2021年度大会  2021年9月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（招待・特別）  

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  • NitrospiraにおけるToxin-Antitoxin機構の生理学的意義の解明

    葵 理恵, 宮本 龍樹, 岡部 拓真, 横田 亜紀子, 大田 悠里, 藤谷 拓嗣, 常田 聡, 野田 尚宏

    第15回細菌学若手コロッセウム  2021年8月 

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    開催年月日： 2021年8月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • Water-in-oilドロップレットを用いた環境中の微生物獲得手法の構築

    大田 悠里, 斉藤 加奈子, Dieter M Tourlousse, 松倉 智子, 高木 妙子, 藤谷 拓嗣, 森田 雅宗, 常田 聡, 野田 尚宏

    第15回細菌学若手コロッセウム  2021年8月 

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    開催年月日： 2021年8月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 地球の窒素循環を駆動する未培養微生物の実態に迫る 招待

    藤谷拓嗣

    第15回細菌学若手コロッセウム  2021年8月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（招待・特別）  

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  • Genomics and physiology of novel Nitrobacter strain adapted to an acidic soil environment of heavily fertilized tea field

    Yu Takahashi, Kento Ishii, Hirotsugu Fujitani, Toshikazu Suenaga, Akihiko Terada, Yuji Sekiguchi, Kanako Tago, Masahito Hayatsu, Yuhei Hirono, Satoshi Tsuneda

    7th International Conference on Nitrification  2021年7月 

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    開催年月日： 2021年7月 　 　

    記述言語：英語  

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  • Characterization of Nitrobacter sp. CN101 with highly affinity to nitrite isolated from mixed culture with urea from Japanese forest soil

    Yoichiro Kobayashi, Takuya Ninomiya, Hirotsugu Fujitani, Yuichi Suwa

    7th International Conference on Nitrification  2021年7月 

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    開催年月日： 2021年7月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Isolation of an aciophilic nitrite-oxidizing bacterium, Nitrobacter sp. strain A67, using culture medium containing urea as a sole source of energy for nitrifying community

    Yuta Endo, Takuya Ninomiya, Hirotsugu Fujitani, Yuichi Suwa

    7th International Conference on Nitrification  2021年7月 

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    開催年月日： 2021年7月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Comparative physiology and genome of ammonia-oxidizing Nitrosospira isolated from terrestrial and freshwater environments 国際会議

    Emi Nissato, Hirotsugu Fujitani, Keisuke Sakai, Hiroshi Ishikawa, Yuichi Suwa

    7th International Conference on Nitrification  2021年7月 

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    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • 亜硝酸酸化細菌Nitrobacterの新株が持つ固有の窒素代謝経路と亜酸化窒素還元機能の発見

    髙橋 悠, 石井 拳人, 藤谷 拓嗣, 関口 勇地, 末永 俊和, 寺田 昭彦, 廣野 祐平, 多胡 香奈子, 早津 雅仁, 常田 聡

    第15回日本ゲノム微生物学会年会  2021年3月 

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    開催年月日： 2021年3月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 独立栄養性亜硝酸酸化細菌のプロテオームに対する有機物の影響

    石井 拳人, 藤谷 拓嗣, Barth F. Smets, 常田 聡

    第15回日本ゲノム微生物学会年会  2021年3月 

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    開催年月日： 2021年3月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 網羅的遺伝子発現解析によって見えてきたアンモニア酸化細菌の凝集体と非凝集体の分業形態

    一色 理乃, 藤谷 拓嗣, 常田 聡

    第14回日本ゲノム微生物学会年会  2020年3月 

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    開催年月日： 2020年3月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 新規な分離培養技術が紐解く未知微生物：硝化菌の生き様とは？

    藤谷拓嗣

    SATテクノロジーショーケース2020  2020年1月 

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    開催年月日： 2020年1月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • Genomic and physiological characteristics of novel nitrite-oxidizing Nitrospira strain isolated from a drinking water treatment plant 国際会議

    Hirotsugu Fujitani, Kengo Momiuchi, Kento Ishii, Masaru Jinno, Norisuke Ushiki, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda

    7th International Conference Microbial Ecology and Water Engineering  2019年11月 

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    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Enrichment of comammox Nitrospira from nitrifying granules by using fixed-bed continuous feeding bioreactors 国際会議

    Hirotsugu Fujitani, Manami Nomachi, Yu Takahashi, Yoshiaki Hasebe, Masahiro Eguchi, Satoshi Tsuneda

    7th International Conference Microbial Ecology and Water Engineering  2019年11月 

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    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • A flexible survival strategy of ammonia-oxidizing bacteria by growth heterogeneity at a single cell level

    Rino Isshiki, Hirotsugu Fujitani, Daiki Tanaka, Tetsushi Sekiguchi, Satoshi Tsuneda

    6th International Conference on Nitrification  2019年10月 

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    開催年月日： 2019年10月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • Enrichment of comammox and canonical Nitrospira from acidic soil: Insights into niche differentiation and adaptation to low pH

    Yu Takahashi, Hirotsugu Fujitani, Yuhei Hirono, Kanako Tago, Yong Wang, Masahito Hayatsu, Satoshi Tsuneda

    6th International Conference on Nitrification  2019年10月 

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    開催年月日： 2019年10月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Physiological and Genomic Characteristics of a New “Candidatus Nitrotoga” Isolate

    Kento Ishii, Hirotsugu Fujitani, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda

    6th International Conference on Nitrification  2019年10月 

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    開催年月日： 2019年10月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • Sequence-specific endoribonucleolytic toxin, MazF, conserved in nitrifying bacteria

    Rie Aoi, Tatsuki Miyamoto, Akiko Yokota, Yuri Ota, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda, Naohiro Noda

    6th International Conference on Nitrification  2019年10月 

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    開催年月日： 2019年10月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • Enrichment of comammox Nitrospira from nitrifying granules by using fixed-bed continuous feeding bioreactors 国際会議

    Hirotsugu Fujitani, Manami Nomachi, Yu Takahashi, Yoshiaki Hasebe, Masahiro Eguchi, Satoshi Tsuneda

    6th International Conference on Nitrification  2019年10月 

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    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Characterization of a bacterium representing a previously unrecognized clade of the Nitrosomonas group; physiology, genomics, and distribution of a missing ammonia-oxidizer 国際会議

    Hirotsugu Fujitani, Shuta Kikuchi, Kento Ishii, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda

    6th International Conference on Nitrification  2019年10月 

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    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Metabolic Lifestyles of Nitrite Oxidizer Nitrotoga under Mixotrophic and Heterotrophic Conditions

    Kento Ishii, Hirotsugu Fujitani, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda

    2019 Nordic Meeting in Molecular Microbial Ecology  2019年9月 

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    開催年月日： 2019年9月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • 従属栄養細菌との相互作用を介した硝化菌の増殖促進機構

    井出 寛人, 石井 拳人, 藤谷 拓嗣, 常田 聡

    日本微生物生態学会第33回大会  2019年9月 

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    開催年月日： 2019年9月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 亜酸化窒素還元能を持つ硝化細菌Nitrobacterの発見

    髙橋 悠, 藤谷 拓嗣, 末永 俊和, 寺田 昭彦, 廣野 祐平, 多胡 香奈子, 早津 雅仁, 常田 聡

    日本微生物生態学会第33回大会  2019年9月 

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    開催年月日： 2019年9月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 培養技術とゲノム解析で紐解く硝化菌の生理生態 招待

    藤谷 拓嗣

    第22回日本水環境学会シンポジウム  2019年9月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（招待・特別）  

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  • Mixotrophic Lifestyle of Nitrite Oxidizer Nitrotoga in the Presence of Pyruvate

    Kento Ishii, Hirotsugu Fujitani, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda

    8th Congress of European Microbiologists  2019年7月 

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    開催年月日： 2019年7月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Cultivation of a bacterium representing a previously unrecognized clade of the Nitrosomonas group; physiology, genomics, and distribution of a missing ammonia-oxidizer 国際会議

    Hirotsugu Fujitani, Shuta Kikuchi, Kento Ishii, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda

    8th Congress of European Microbiologists  2019年7月 

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    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • 未培養硝化菌を対象とした新規分離培養技術の開発

    藤谷拓嗣, 常田聡

    環境バイオテクノロジー学会2019年度大会  2019年6月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • Enrichment of Complete Ammonia Oxidizer and Nitrite Oxidizer of genus Nitrospira from Acidic Soil

    Yu Takahashi, Hirotsugu Fujitani, Kanako Tago, Yong Wang, Yuhei Hirono, Masahito Hayatsu, Satoshi Tsuneda

    11th Asian Symposium on Microbial Ecology  2019年5月 

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    開催年月日： 2019年5月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • ピルビン酸存在下での亜硝酸酸化細菌Nitrotogaの混合栄養的な増殖様式

    石井 拳人, 藤谷 拓嗣, 関口勇地, 常田 聡

    第13回日本ゲノム微生物学会年会  2019年3月 

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    開催年月日： 2019年3月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 網羅的遺伝子発現解析による硝化菌の形態変化がもたらす生存戦略の解明

    一色 理乃, 藤谷 拓嗣, 田中 大器, 関口 哲志, 常田 聡

    第13回日本ゲノム微生物学会年会  2019年3月 

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    開催年月日： 2019年3月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 見過ごされたアンモニア酸化細菌：Nitrosomonas属の新規な生理学，ゲノミクス，環境分布

    藤谷拓嗣, 菊池脩太, 石井拳人, 関口勇地, 常田聡

    第13回日本ゲノム微生物学会年会  2019年3月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • Culture-dependent analysis of isolated Nitrotoga sp. provide deeper insight into the physiology

    Kento Ishii, Hirotsugu Fujitani, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda

    17th International society for microbial ecology  2018年8月 

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    開催年月日： 2018年8月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Growth variability at the single-cell level affects culturability of environmental microorganisms

    Rino Isshiki, Hirotsugu Fujitani, Daiki Tanaka, Tetsushi Sekiguchi, Satoshi Tsuneda

    17th International society for microbial ecology  2018年8月 

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    開催年月日： 2018年8月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Genomic and physiological characteristics of novel nitrite-oxidizing Nitrospira isolated from a drinking water treatment plant 国際会議

    Hirotsugu Fujitani, Kengo Momiuchi, Kento Ishii, Masaru Jinno, Norisuke Ushiki, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda

    17th International society for microbial ecology  2018年8月 

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    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Cultivation of novel nitrite oxidizer Nitrospira from acidic soil

    Yu Takahashi, Hirotsugu Fujitani, Yuhei Hirono, Masahito Hayatsu, Satoshi Tsuneda

    32th Japanese Society Microbial Ecology Annual Meeting and 10th Asian Symposium on Microbial Ecology  2018年7月 

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    開催年月日： 2018年7月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • Growth heterogeneity in pure cultures affects the culturability

    Rino Isshiki, Hirotsugu Fujitani, Daiki Tanaka, Tetsushi Sekiguchi, Satoshi Tsuneda

    32th Japanese Society Microbial Ecology Annual Meeting and 10th Asian Symposium on Microbial Ecology  2018年7月 

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    開催年月日： 2018年7月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • Isolation process and genomic analysis of nitrite oxidizer Nitrotoga sp. provide insights on physiological characteristics and clues to promote the growth

    Kento Ishii, Hirotsugu Fujitani, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda

    32th Japanese Society Microbial Ecology Annual Meeting and 10th Asian Symposium on Microbial Ecology  2018年7月 

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    開催年月日： 2018年7月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • N2Oを固定するシアノバクテリアの探索とポテンシャル評価

    須田和美, 松崎壮一郎, 末永俊和, 利谷翔平, 藤谷拓嗣, 常田聡, 細見正明, 寺田昭彦

    第52回日本水環境学会年会  2018年3月 

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    開催年月日： 2018年3月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • High denitrification potentials of soils under seabird cliffs: Case studies in Ny-Ålesund, Svalbard

    Kentaro Hayashi, Yukiko Tanabe, Keisuke Ono, Maarten J, J. E. Loonen, Maki Asano, Hirotsugu Fujitani, Masaki Uchiba, Masahito Hayatsu

    8th Symposium on Polar Science: Polar Biology  2017年12月 

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    開催年月日： 2017年12月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • 完全アンモニア酸化能を保持するComammox細菌の分離培養と生理生態

    野町 真名実, 藤谷 拓嗣, 長谷部 吉昭, 江口 正浩, 常田 聡

    環境微生物系学会合同大会2017  2017年8月 

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    開催年月日： 2017年8月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • ゲノムから推定する遅増殖性Nitrotogaの活性促進因子

    石井 拳人, 藤谷 拓嗣, 常田 聡

    環境微生物系学会合同大会2017  2017年8月 

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    開催年月日： 2017年8月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 硝化菌単一菌株集団でみられる形態と増殖能の不均一性

    一色 理乃, 藤谷 拓嗣, 田中 大器, 関口 哲志, 常田 聡

    環境微生物系学会合同大会2017  2017年8月 

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    開催年月日： 2017年8月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • Genome-informed isolation of nitrite oxidizer Nitrotoga sp

    Kento Ishii, Hirotsugu Fujitani, Tatsunori Nakagawa, Reiji Takahashi, Satoshi Tsuneda

    5th International Conference on Nitrification  2017年7月 

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    開催年月日： 2017年7月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Growth heterogeneity in pure cultures of nitrifiers

    Rino Isshiki, Hirotsugu Fujitani, Daiki Tanaka, Tetsushi Sekiguchi, Satoshi Tsuneda

    5th International Conference on Nitrification  2017年7月 

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    開催年月日： 2017年7月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Comparative genomics of phylogenetically distinct two Nitrospira strains isolated from activated sludge 国際会議

    Norisuke Ushiki, Hirotsugu Fujitani, Yu Shimada, Tomohiro Morohoshi, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda

    5th International Conference on Nitrification  2017年7月 

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    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • 革新的分離培養技術による新規なcomammox細菌の獲得と生存戦略の解明

    野町真名実, 藤谷拓嗣, 長谷部吉昭, 江口正浩, 常田 聡

    第19回化学工学会学生発表会  2017年3月 

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    開催年月日： 2017年3月 　 　

    記述言語：日本語  

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  • セルソーターによって分取された凝集体内の微生物間相互作用の解明

    石井拳人, 藤谷拓嗣, 常田 聡

    第11回日本ゲノム微生物学会年会  2017年3月 

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    開催年月日： 2017年3月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • Nitrospiraの亜硝酸酸化活性を制御するQuorum-sensing機構の発見

    牛木章友, 藤谷拓嗣, 諸星知広, 常田 聡

    第11回日本ゲノム微生物学会年会  2017年3月 

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    開催年月日： 2017年3月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • 亜酸化窒素の削減に寄与する淡水性シアノバクテリアの探索

    松崎壮一郎, 末永俊和, 利谷翔平, 堀知行, 牛木章友, 藤谷拓嗣, 常田聡, 細見正明, 寺田昭彦

    第5回日本生物工学会東日本支部コロキウム  2017年3月 

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    開催年月日： 2017年3月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 微生物凝集体ソーティングによる未培養な亜硝酸酸化細菌Nitrotogaの獲得と生存戦略

    石井拳人, 藤谷拓嗣, 中川達功, 高橋令二, 常田 聡

    日本微生物生態学会第31回大会  2016年10月 

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    開催年月日： 2016年10月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • Quorum-sensing機構による亜硝酸酸化細菌Nitrospira japonicaの活性制御メカニズム

    牛木章友, 島田 侑, 藤谷拓嗣, 諸星知広, 常田 聡

    日本微生物生態学会第31回大会  2016年10月 

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    開催年月日： 2016年10月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • クローナルな硝化菌集団における細胞増殖活性の不均一性の評価と機構解明

    一色理乃, 藤谷拓嗣, 田中大器, 関口 哲志, 常田 聡

    日本微生物生態学会第31回大会  2016年10月 

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    開催年月日： 2016年10月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • Ammonia concentration determines ecological niche differentiation of Nitrospira as nitrite-oxidizers in activated sludge 国際会議

    Hirotsugu Fujitani, Masaru Jinno, Norisuke Ushiki, Toshikazu Suenaga, Akihiko Terada, Satoshi Tsuneda

    6th International Conference Microbial Ecology and Water Engineering  2016年9月 

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    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Physiological and genetic properties of Nitrosomonas mobilis Ms1 isolated from autotrophic nitrifying granule of wastewater treatment plant

    Soe Myat Thandar, Norisuke Ushiki, Hirotsugu Fujitani, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda

    16th International society for microbial ecology  2016年8月 

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    開催年月日： 2016年8月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Comparative genomic analysis of phylogenetically distinct two Nitrospira strains isolated from a wastewater treatment plant

    Norisuke Ushiki, Hirotsugu Fujitani, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda

    16th International society for microbial ecology  2016年8月 

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    開催年月日： 2016年8月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • Direct isolation of microcolonies from activated sludge opens the window of unrecognized genus Nitrosomonas as ammonia oxidizers 国際会議

    Hirotsugu Fujitani, Takuma Abe, Norisuke Ushiki, Satoshi Tsuneda

    16th International society for microbial ecology  2016年8月 

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    記述言語：英語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • 新規な分離培養技術によって獲得された硝化細菌の生理・ゲノム特性

    藤谷拓嗣, 牛木章友, 神野 大, 安部拓磨, 常田 聡

    環境バイオテクノロジー学会2016年度大会  2016年6月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • 新規な分離培養戦略が切り拓く難培養性硝化細菌の獲得と生理・ゲノム特性 招待

    藤谷拓嗣, 牛木章友, 常田 聡

    日本農芸化学会2016年度大会  2016年3月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（招待・特別）  

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  • 淡水域に棲息する N2O 同化を行う Cyanobacteria の探索

    松崎壮一郎, 末永俊和, 堀知行, 牛木章友, 藤谷拓嗣, 常田聡, 利谷翔平, 細見正明, 寺田昭彦

    第50回日本水環境学会年会  2016年3月 

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    開催年月日： 2016年3月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • Physiological characterization of Nitrotoga-like bacteria enriched from coastal sand

    Kento Ishii, Hirotsugu Fujitani, Tatsunori Takahashi, Reiji Takahashi, Satoshi Tsuneda

    16th International society for microbial ecology  2016年3月 

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    開催年月日： 2016年3月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • 比較ゲノム解析が明らかにする亜硝酸酸化細菌Nitrospira の生態学的ニッチ

    牛木章友, 藤谷拓嗣, 関口勇地, 常田 聡

    31th Japanese Society Microbial Ecology Annual Meeting and 7th Japan-Taiwan-Korea Symposium on Microbial Ecology  2015年10月 

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    開催年月日： 2015年10月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • Physiological characterization of Nitrosomonas mobilis-like strain isolated from autotrophic nitrifying granule

    Soe Myat Thandar, Norisuke Ushiki, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda

    31th Japanese Society Microbial Ecology Annual Meeting and 7th Japan-Taiwan-Korea Symposium on Microbial Ecology  2015年10月 

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    開催年月日： 2015年10月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • 活性汚泥中に潜在する未培養アンモニア酸化細菌の分離培養

    安部拓磨, 牛木章友, 藤谷拓嗣, 常田 聡

    31th Japanese Society Microbial Ecology Annual Meeting and 7th Japan-Taiwan-Korea Symposium on Microbial Ecology  2015年10月 

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    開催年月日： 2015年10月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • Isolation, physiology, and genomics of novel nitrifiers 招待 国際会議

    Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda

    31th Japanese Society Microbial Ecology Annual Meeting and 7th Japan-Taiwan-Korea Symposium on Microbial Ecology  2015年10月 

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    記述言語：英語   会議種別：口頭発表（招待・特別）  

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  • Selective enrichment of uncultured ammonia-oxidizing bacteria and archaea and Nitrospira from freshwater by continuous feeding bioreactors

    Kengo Momiuchi, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda

    4th International Conference on Nitrification  2015年6月 

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    開催年月日： 2015年6月 - 2015年7月

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Comparative genomic analysis of phylogenetically distant two Nitrospira strains isolated from a wastewater treatment plant

    Norisuke Ushiki, Hirotsugu Fujitani, Yuji Sekiguchi, Satoshi Tsuneda

    4th International Conference on Nitrification  2015年6月 

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    開催年月日： 2015年6月 - 2015年7月

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • 新規分離培養手法を用いたハイスループットなアンモニア酸化細菌の獲得

    安部拓磨, 牛木章友, 藤谷拓嗣, 常田 聡

    2015年度環境バイオテクノロジー学会  2015年6月 

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    開催年月日： 2015年6月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • Isolation and successful subculture of Nitrosomonas mobilis lineage: Recovery of nature's lost treasure since 1970's 国際会議

    Hirotsugu Fujitani, Asami Kumagai, Norisuke Ushiki, Kengo Momiuchi, Satoshi Tsuneda

    4th International Conference on Nitrification  2015年6月 

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    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • 難培養性アンモニア酸化細菌Nitrosomonas mobilisの分離培養と生理学的性質の解明

    熊谷麻美, 籾内研吾, 藤谷拓嗣, 常田 聡

    環境微生物系合同大会2014  2014年10月 

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    開催年月日： 2014年10月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 比較解析から迫る亜硝酸酸化細菌Nitrospiraの生態学的ニッチ

    神野 大, 牛木章友, 藤谷拓嗣, 常田 聡

    環境微生物系合同大会2014  2014年10月 

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    開催年月日： 2014年10月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • nxrBを標的としたin situ RCA-FISH法による亜硝酸酸化細菌の探索

    牛木章友, 藤谷拓嗣, 星野辰彦, 常田 聡

    環境微生物系合同大会2014  2014年10月 

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    開催年月日： 2014年10月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • Selective enrichment of uncultured ammonia-oxidizing bacteria and archaea and nitrite oxidizing bacteria from freshwater

    Kengo Momiuchi, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda

    15th International society for microbial ecology  2014年8月 

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    開催年月日： 2014年8月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Detection of nxrB genes by in situ RCA-FISH to identify unrecognized nitrite-oxidizing microorganisms in environments

    Norisuke Ushiki, Hirotsugu Fujitani, Tatsuhiko Hoshino, Satoshi Tsuneda

    15th International society for microbial ecology  2014年8月 

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    開催年月日： 2014年8月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Selective enrichment of ammonia-oxidizing archaea and bacteria from freshwater

    Kengo Momiuchi, Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda

    Water and Environment Technology Conference 2014  2014年6月 

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    開催年月日： 2014年6月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • 排水処理槽内から単離された2種類のNitrospiraの比較解析

    牛木章友, 藤谷拓嗣, 常田 聡

    第48回日本水環境学会年会  2014年3月 

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    開催年月日： 2014年3月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • 機能遺伝子nxrBに基づく新規な亜硝酸酸化細菌の探索

    牛木章友, 藤谷拓嗣, 常田 聡

    日本微生物生態学会第29回大会  2013年11月 

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    開催年月日： 2013年11月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 低濃度アンモニアの連続供給による難培養性硝化微生物の選択的集積培養

    籾内研吾,藤谷拓嗣,常田 聡

    日本微生物生態学会第29回大会  2013年11月 

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    開催年月日： 2013年11月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 亜硝酸酸化細菌Nitrospiraを標的とした新規分離培養手法と他の難培養性微生物への適用

    藤谷拓嗣, 籾内研吾, 牛木章友, 入江香菜, 熊谷麻美, 安部拓磨, 神野 大, 青井議輝, 常田 聡

    日本微生物生態学会第29回大会  2013年11月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • 難培養性亜硝酸酸化細菌Nitrospiraを標的とした革新的分離培養戦略

    藤谷拓嗣, 牛木章友, 籾内研吾, 青井議輝, 常田 聡

    第16回日本水環境学会シンポジウム  2013年11月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • Selective inoculation of microcolonies materializes cultivation and isolation of previously uncultured nitrifying bacteria 国際会議

    Hirotsugu Fujitani, Norisuke Ushiki, Kengo momiuchi, Asami Kumagai, Takuma Abe, Satoshi Tsuneda

    The 5th Taiwan-Korea-Japan International Symposium on Microbial Ecology  2013年10月 

    　詳細を見る

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Comparative physiological analysis of previously uncultured Nitrospira strains isolated from wastewater treatment plants

    Norisuke Ushiki, Hirotsugu Fujitani, Yoshiteru Aoi, Satoshi Tsuneda

    3rd International conference on nitrification  2013年9月 

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    開催年月日： 2013年9月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • An innovative cultivation and isolation strategy for uncultured nitrifying bacteria 国際会議

    Hirotsugu Fujitani, Norisuke Ushiki, Kengo Momiuchi, Yoshiteru Aoi, Satoshi Tsuneda

    3rd International conference on nitrification  2013年9月 

    　詳細を見る

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • An innovative cultivation and isolation strategy for uncultured nitrifying bacteria 国際会議

    Hirotsugu Fujitani, Norisuke Ushiki, Kengo Momiuchi, Yoshiteru Aoi, Satoshi Tsuneda

    Early career scientist workshop ICoN3  2013年9月 

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    記述言語：英語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • An innovative cultivation and isolation strategy for uncultured nitrite-oxidizing bacteria of the genus Nitrospira 国際会議

    Hirotsugu Fujitani, Norisuke Ushiki, Kengo Momiuchi, Yoshiteru Aoi, Satoshi Tsuneda

    5th International Conference Microbial Ecology and Water Engineering  2013年7月 

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    開催年月日： 2013年7月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • An innovative cultivation and isolation strategy for uncultured nitrifying bacteria 国際会議

    Hirotsugu Fujitani, Norisuke Ushiki, Kengo momiuchi, Yoshiteru Aoi, Satoshi Tsuneda

    CER International workshop on Biogeochemical cycling and Microbial Ecology for Young Scientists  2013年3月 

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    記述言語：英語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（公募）  

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  • 淡水環境に生息する難培養性硝化細菌の新規分離培養手法の開発

    籾内研吾, 藤谷拓嗣, 青井議輝, 常田 聡

    第47回日本水環境学会  2013年3月 

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    開催年月日： 2013年3月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • 出芽酵母と共凝集する乳酸菌の細胞表面特性に関する研究

    平山 悟, 臼井有美, 土屋典子, 阿部 侑, 籾内研吾, 藤谷拓嗣, 常田 聡, 古川壮一, 荻原博和, 森永 康

    第64回生物工学会大会  2012年10月 

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    開催年月日： 2012年10月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • 培養できない微生物を培養するための新規技術開発 招待

    青井議輝, 藤谷拓嗣, 常田 聡

    日本微生物生態学会第28回大会，第4回日韓微生物生態シンポジウム  2012年9月 

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    開催年月日： 2012年9月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（招待・特別）  

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  • 難培養性Nitrospiraの単離が排水処理プロセスでの亜硝酸酸化細菌の生理学的性質を明らかにする

    藤谷拓嗣, 牛木章友, 常田 聡, 青井議輝

    日本微生物生態学会第28回大会，第4回日韓微生物生態シンポジウム  2012年9月 

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    開催年月日： 2012年9月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • Selective cultivation of nitrifying bacteria present in drinking water treatment plants

    Kengo Momiuchi, Hirotsugu Fujitani, Norisuke Ushiki, Yoshiteru Aoi, Satoshi Tsuneda

    14th International society for microbial ecology  2012年8月 

    　詳細を見る

    開催年月日： 2012年8月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Comparative physiological analysis of previously uncultured Nitrospira strains isolated from wastewater treatment plants

    Norisuke Ushiki, Hirotsugu Fujitani, Yoshiteru Aoi, Satoshi Tsuneda

    14th International society for microbial ecology  2012年8月 

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    開催年月日： 2012年8月 　 　

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Novel method for uncultured nitrifying bacteria 招待 国際会議

    Hirotsugu Fujitani, Norisuke Ushiki, Satoshi Tsuneda, Yoshiteru Aoi

    14th International society for microbial ecology  2012年8月 

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    記述言語：英語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • 排水処理槽内に生息する難培養性亜硝酸酸化細菌Nitrospiraの分離培養

    牛木章友, 藤谷拓嗣, 常田 聡, 青井議輝

    第14回化学工学会学生発表会  2012年3月 

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    開催年月日： 2012年3月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • 浄水処理プロセス由来の新規硝化細菌の分離培養

    籾内研吾, 藤谷拓嗣, 常田 聡

    日本微生物生態学会第27回大会  2011年10月 

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    開催年月日： 2011年10月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 亜硝酸酸化細菌Nitrospiraの新規分離培養手法とその実証

    藤谷拓嗣, 牛木章友, 常田 聡, 青井議輝

    日本微生物生態学会第27回大会  2011年10月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • Selective and highly enrichment of nitrite-oxidizing bacteria Nitrospira 国際会議

    Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda, Yoshiteru Aoi

    2nd International conference on nitrification  2011年7月 

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    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Selective and highly enrichment of nitrite-oxidizing bacteria Nitrospira 招待 国際会議

    Hirotsugu Fujitani, Satoshi Tsuneda, Yoshiteru Aoi

    Early career scientist workshop ICoN2  2011年7月 

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    記述言語：英語   会議種別：口頭発表（招待・特別）  

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  • 難培養性亜硝酸酸化細菌Nitrospiraの増殖特性

    藤谷拓嗣, 青井議輝, 常田 聡

    日本微生物生態学会第26回大会  2010年11月 

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    開催年月日： 2010年11月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • Selective and highly efficient enrichment of uncultured Nitrospira 国際会議

    Hirotsugu Fujitani, Yoshiteru Aoi, Satoshi Tsuneda

    13th International society for microbial ecology  2010年8月 

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    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • 難培養性亜硝酸酸化細菌Nitrospiraの分離培養

    藤谷拓嗣, 青井議輝, 常田 聡

    日本微生物生態学会第25回大会  2009年11月 

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    開催年月日： 2009年11月 　 　

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • Cultivation of uncultured nitrite-oxidizing bacteria 国際会議

    Hirotsugu Fujitani, Yoshiteru Aoi, Satoshi Tsuneda

    1st International Conference on Nitrification  2009年7月 

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    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • 難培養性亜硝酸酸化細菌Nitrospiraの新規分離培養法

    藤谷拓嗣, 青井議輝, 常田 聡

    第43回日本水環境学会年会  2009年3月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • Cultivation of uncultured nitrite oxidizing bacteria 国際会議

    Hirotsugu Fujitani, Yoshiteru Aoi, Satoshi Tsuneda

    12th International society for microbial ecology  2008年8月 

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    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • 多摩川河口干潟の窒素循環に寄与する微生物群の解析

    藤谷拓嗣, 石川大祐, 田嶋良行, 小関祥子, 陶 景倫, 小島茂明, 浦川秀敏, 常田 聡

    第41回日本水環境学会年会  2007年3月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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受賞

  • ポスター賞（金賞）

    2023年3月   第11回日本生物工学会東日本支部コロキウム   シングルセル観察で解き明かすアンモニア酸化細菌の分裂速度不均一性

    池田秀斗

  • 2020年度環境バイオテクノロジー学会奨励賞

    2020年6月   環境バイオテクノロジー学会  

    藤谷拓嗣

  • 最優秀発表賞（ポスター）

    2019年10月   第6回国際硝化会議   A flexible survival strategy of ammonia-oxidizing bacteria by growth heterogeneity at a single cell level

    一色理乃

  • 優秀発表賞（ポスター）

    2019年10月   第6回国際硝化会議   Enrichment of comammox and canonical Nitrospira from acidic soil: Insights into niche differentia-tion and adaptation to low pH

    髙橋 悠

  • 優秀発表賞（ポスター）

    2019年9月   第33回日本微生物生態学会   細胞ごとに増殖速度のばらつきが大きいアンモニア酸化細菌のしなやかな生存戦略

    一色理乃

  • 優秀発表賞（ポスター）

    2017年8月   環境微生物系学会合同大会2017   ゲノムから推定する遅増殖性Nitrotogaの活性促進因子

    石井拳人

  • 最優秀発表賞（ポスター）

    2015年7月   第4回国際硝化会議   Isolation and successful subculture of Nitrosomonas mobilis lineage: Recovery of nature's lost treasure since 1970's

    藤谷 拓嗣

  • 博士研究奨励賞（オルガノ賞）

    2013年11月   第16回日本水環境学会シンポジウム   難培養性亜硝酸酸化細菌Nitrospiraを標的とした革新的分離培養戦略

    藤谷 拓嗣

  • 最優秀発表賞（ポスター）

    2013年7月   第5回国際水協会微生物生態学と水工学に関する特別会議   An innovative cultivation and isolation strategy for uncultured nitrite-oxidizing bacteria of the genus Nitrospira

    藤谷 拓嗣

  • 優秀発表賞（ポスター）

    2012年9月   第28回日本微生物生態学会，第4回日韓微生物生態シンポジウム   難培養性Nitrospiraの単離が排水処理プロセスでの亜硝酸酸化細菌の生理学的性質を明らかにする

    藤谷 拓嗣

  • 最優秀発表賞（ポスター）

    2009年11月   第25回日本微生物生態学会   難培養性亜硝酸酸化細菌Nitrospiraの分離培養

    藤谷 拓嗣

  • 優秀発表賞（クリタ賞）

    2009年3月   第43回日本水環境学会   難培養性亜硝酸酸化細菌Nitrospiraの新規分離培養法

    藤谷 拓嗣

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共同研究・競争的資金等の研究課題

  • 好酸性comammox菌の生理学・ゲノム科学に基づく酸性硝化プロセスの実態解明

    研究課題/領域番号：23H03570  2023年4月 - 2027年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)  中央大学

    藤谷 拓嗣, 諏訪 裕一

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    配分額：18850000円 （ 直接経費：14500000円 、 間接経費：4350000円 ）

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  • 好酸性亜硝酸酸化細菌Nitrobacter sp. A67株で解き明かす酸性環境での硝化菌のすがた

    研究課題/領域番号：23K05923  2023年4月 - 2026年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)  中央大学

    諏訪 裕一, 藤谷 拓嗣

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    配分額：4680000円 （ 直接経費：3600000円 、 間接経費：1080000円 ）

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  • 陸域窒素循環のミッシングリンクを解く―酸性土壌の硝化の正体

    研究課題/領域番号：19H01156  2019年4月 - 2023年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(A)  国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構

    多胡 香奈子, 早津 雅仁, 諏訪 裕一, 藤谷 拓嗣

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    資金種別：競争的資金

    配分額：44980000円 （ 直接経費：34600000円 、 間接経費：10380000円 ）

    昨年度、申請者らが分離した「新規耐酸性アンモニア酸化細菌－亜硝酸酸化細菌コミュニティー」における鍵となる新規な酸性適応型アンモニア酸化菌（GAO100株）を分離し、ドラフトゲノム解析を実施した。本年度は、このGAO100株のゲノム配列を決定しコードされる遺伝情報を解析した。さらに、申請者らが国内土壌から分離したγ-プロテオバクテリアに属す耐酸性アンモニア酸化細菌（Nitrosoglobus terrae）と既知の塩湖や海洋に生息する特にアンモニア酸化細菌（Nitrosococcus）とGAO100株の比較ゲノム解析を行い、機能の推定や進化的な類縁性を調査した。その結果、GAO100はNitrosococcusが保持している浸透圧耐性関係の遺伝子を維持していた。しかしNitrosoglobus terraeはこれらの遺伝子を失っていることからGAO100株はNitrosococcusが陸域に進出してNitrosoglobusと分岐する前の種である可能性が推察された。またNitrosoglobus terraeが失っている脱窒系の遺伝子を一部保持していた。この他、系統分類遺伝子の比較からGAO100株は、Nitrosoglobus terraeと好塩性アンモニア酸化細菌（Nitrosococcus）の中間に位置付けられた。一方、GAO100株は亜硝酸化菌を含む複数の細菌と安定的な凝集体を形成しており、純化過程で不安定になることから当初計画で予定したPVA（ポリビニルアルコール polyvinyl alcohol）多孔質体を用いた微生物コミュニティーとしての単離を試みた。しかしPVA多孔質体に微生物コミュニティーを形成させることは困難であった。GAO100株が生産する細胞外多糖と推定される物質がコミュニティーの安定化に寄与していると推定された。

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  • 培養技術とゲノム解析で紐解く硝化界のダークマター「完全アンモニア酸化細菌」

    2019年4月 - 2022年3月

    日本学術振興会科学研究費助成事業  令和元年度若手研究 

    藤谷 拓嗣

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    担当区分：研究代表者  資金種別：競争的資金

    配分額：4160000円 （ 直接経費：3200000円 、 間接経費：960000円 ）

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  • 新学術領域研究令和2年度「先進ゲノム支援」

    2020年4月 - 2021年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 

    藤谷拓嗣

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    資金種別：競争的資金

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  • 2020年度国際学術誌投稿助成

    2021年2月 　 　

    中央大学 

    藤谷拓嗣

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    資金種別：競争的資金

    配分額：200000円

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  • 選択培地と集積培養に依存しない硝化菌の純粋分離

    2018年6月 - 2020年3月

    日本学術振興会科学研究費助成事業  平成30年度挑戦的研究（萌芽） 

    諏訪 裕一 藤谷 拓嗣

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    資金種別：競争的資金

    配分額：6370000円 （ 直接経費：4900000円 、 間接経費：1470000円 ）

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  • 革新的分離培養技術で解明する硝化細菌の生理生態と多様性

    2016年4月 - 2019年3月

    日本学術振興会科学研究費助成事業  平成28年度若手研究B 

    藤谷 拓嗣

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    担当区分：研究代表者  資金種別：競争的資金

    配分額：4030000円 （ 直接経費：3100000円 、 間接経費：930000円 ）

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  • 高緯度北極氷河後退域における硝化特性の遷移とその気候変動応答の解明

    研究課題/領域番号：26304018  2014年4月 - 2019年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B) 

    林 健太郎, 内田 雅己, 早津 雅仁, 田邊 優貴子, 小野 圭介, 藤嶽 暢英, 浅野 眞希, 藤谷 拓嗣, 服部 祥平, 白水 貴

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    配分額：17160000円 （ 直接経費：13200000円 、 間接経費：3960000円 ）

    高緯度北極に位置するスバールバル諸島ニーオルスン近郊において，氷河後退域土壌の硝化特性（アンモニア酸化ポテンシャルおよび硝化微生物フロラ）の実態解明および環境操作応答について調査を行った．高緯度北極の未熟な土壌でも硝化が起きていることを明らかにしつつ，融雪・融水のかく乱やデブリの影響を受けやすい氷河後退域におけるクロノシーケンス法の適用の困難さ，オープントップチャンバーにより0.5℃前後の加温効果が得られることなどの今後の調査に資する情報が得られた．また，海鳥営巣崖下の崖錐土壌がきわめて高く正の温度応答を示す硝化能と脱窒能を有し，現場において一酸化二窒素の放出が起こりうることを明らかにした．

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  • メタゲノム解析から発見された新規なComammox細菌の分離培養と性状解析

    2017年12月 - 2018年11月

    公益財団法人発酵研究所  平成29年度（2017年度）研究者招聘・留学助成 

    藤谷 拓嗣

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    担当区分：研究代表者  資金種別：競争的資金

    配分額：3000000円

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  • 部分硝化の制御・安定化を志向した多様な硝化細菌の生理学的解析

    2017年10月 - 2018年9月

    公益財団法人クリタ水・環境科学振興財団  2017年度国内研究助成 

    藤谷 拓嗣

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    担当区分：研究代表者  資金種別：競争的資金

    配分額：1000000円

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  • 新学術領域研究平成29年度「先進ゲノム支援」

    2017年9月 - 2018年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 

    藤谷 拓嗣

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    資金種別：競争的資金

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  • 土壌微生物の細胞形態変化による低濃度基質利用機構の解明

    研究課題/領域番号：16K14874  2016年4月 - 2018年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  挑戦的萌芽研究  国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構

    早津 雅仁, 藤谷 拓嗣

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    配分額：3770000円 （ 直接経費：2900000円 、 間接経費：870000円 ）

    本課題では、硝化菌細胞凝集体は生育に不利な環境で生存能力が優れていることを示すことを目的とし、次の結果を得た。安定的に増殖するNitrosoglobus属のアンモニア酸化細菌凝集体には10％程度の従属栄養細菌が共存していた。Nitrosoglobus属新種の存在を明らかにし、それらが亜硝酸酸化菌・従属栄養細菌と細胞凝集体を形成し共存することを示した。酸性環境に適応したCOMAMMOX菌の存在を明らかにし、この菌は複数種の従属栄養菌と凝集体を形成していることを示した。これらの結果から硝化菌とある種の従属栄養菌は凝集体中で共存し劣悪な環境に適応していると考えられた。

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  • 窒素循環の制御とN2O生成の抑制を志向した硝化・脱窒菌の網羅的獲得

    2017年1月 - 2017年12月

    公益財団法人前川報恩会  平成28年度学術研究助成 

    藤谷 拓嗣

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    担当区分：研究代表者  資金種別：競争的資金

    配分額：1555500円

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  • 部分硝化の制御・安定化を志向した多様な硝化細菌の生理学的解析

    2016年10月 - 2017年9月

    公益財団法人クリタ水・環境科学振興財団  2016年度国内研究助成 

    藤谷 拓嗣

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    担当区分：研究代表者  資金種別：競争的資金

    配分額：930000円

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  • 新学術領域研究平成28年度「先進ゲノム支援」

    2016年9月 - 2017年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 

    藤谷 拓嗣

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    資金種別：競争的資金

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  • N2O生成に関与する硝化・脱窒細菌の網羅的遺伝子解析と分離培養

    2016年2月 - 2016年12月

    一般財団法人前川報恩会  平成27年度学術研究助成 

    藤谷 拓嗣

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    担当区分：研究代表者  資金種別：競争的資金

    配分額：1500000円

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  • 環境中に潜在する硝化細菌の網羅的・高速ハンティング

    2015年7月 - 2016年3月

    早稲田大学  2015年度特定課題研究助成費（特定課題B） 

    藤谷 拓嗣

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    担当区分：研究代表者  資金種別：競争的資金

    配分額：360000円

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  • 硝化細菌のマイクロコロニー形成機構の解明

    2015年4月 - 2016年3月

    早稲田大学  2015年度特定課題研究助成費（基礎助成） 

    藤谷 拓嗣

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    担当区分：研究代表者  資金種別：競争的資金

    配分額：240000円

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  • 窒素循環に寄与する新規なアンモニア酸化細菌・古細菌の分離培養と機能解明

    2014年7月 - 2015年3月

    早稲田大学  2014年度特定課題研究助成費（特定課題B） 

    藤谷 拓嗣

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    担当区分：研究代表者  資金種別：競争的資金

    配分額：384000円

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  • nxrB遺伝子に基づく新規な亜硝酸酸化細菌の探索

    2014年4月 - 2015年3月

    早稲田大学  2014年度特定課題研究助成費（基礎助成） 

    藤谷 拓嗣

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    担当区分：研究代表者  資金種別：競争的資金

    配分額：270000円

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  • NxrB遺伝子に基づく新規な亜硝酸酸化細菌の探索・分離培養

    2014年4月 - 2015年2月

    公益財団法人日本科学協会  平成26年度笹川科学研究助成（学術研究部門，生物系） 

    藤谷 拓嗣

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    担当区分：研究代表者  資金種別：競争的資金

    配分額：700000円

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  • 未培養性アンモニア酸化細菌・古細菌を標的としたハイスループット新規分離培養手法の開発

    2013年6月 - 2014年3月

    早稲田大学  2013年度特定課題研究助成費（新任の教員等） 

    藤谷 拓嗣

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    担当区分：研究代表者  資金種別：競争的資金

    配分額：180000円

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  • 窒素循環に寄与する難培養性亜硝酸酸化細菌Nitrospiraの分離培養

    2011年4月 - 2012年2月

    公益財団法人日本科学協会  平成23年度笹川科学研究助成（学術研究部門，生物系） 

    藤谷 拓嗣

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    担当区分：研究代表者  資金種別：競争的資金

    配分額：490000円

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その他

  • 中学校・高等学校教諭専修免許状（理科）

    2009年3月 　 　

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  • 中学校・高等学校教諭1種免許状（理科）

    2007年3月 　 　

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担当経験のある科目（授業）

  • 理工学基礎実験IB

    機関名：早稲田大学基幹理工学部・創造理工学部・先進理工学部

  • 理工学基礎実験IA

    機関名：早稲田大学基幹理工学部・創造理工学部・先進理工学部

  • 生命医科学実験I

    機関名：早稲田大学先進理工学部生命医科学科

  • 環境生物学実験

    機関名：中央大学理工学部生命科学科

  • 環境応用微生物学

    機関名：中央大学理工学部生命科学科

社会貢献活動

  • 私たちの生活に身近な微生物の世界

    役割：講師

    公益財団法人文京アカデミー  文京アカデミア講座  2022年6月 - 2022年7月

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    対象： 社会人・一般

    種別：セミナー・ワークショップ

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  • Local organizing committee members

    役割：運営参加・支援

    国際水協会（IWA）  Microbial Ecology and Water Engineering 2019  2019年11月 　 　

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    種別：セミナー・ワークショップ

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  • かくれているものは，なぁに？

    役割：運営参加・支援,　実演

    国立研究開発法人産業技術総合研究所  2019年産総研一般公開  2019年7月 　 　

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    種別：施設一般公開

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  • 身のまわりの光を見てみよう！

    役割：講師,　実演

    国立研究開発法人科学技術振興機構（JST）  新宿SPP（Science Partnership Project）新宿区立西早稲田中学校2年生対象  2017年11月 　 　

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    種別：出前授業

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  • Local organizing committee members

    役割：運営参加・支援

    公益社団法人日本生物工学会  第69回日本生物工学会大会  2017年9月 　 　

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    種別：セミナー・ワークショップ

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  • 光る生物の解明をしよう！

    役割：講師,　実演

    国立研究開発法人科学技術振興機構（JST）  新宿SPP（Science Partnership Project）新宿区立牛込第一中学校2年生対象  2014年11月 　 　

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    種別：出前授業

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  • Local organizing committee members

    役割：運営参加・支援

    公益社団法人日本水環境学会  Water and Environment Technology Conference 2014  2014年6月 　 　

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    種別：セミナー・ワークショップ

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  • 夢を叶えるために，今必要なこと

    役割：講師

    東京都青梅市立第二中学校  平成25年度第3学年進路講演会  2014年3月 　 　

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    種別：講演会

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  • Local organizing committee members

    役割：運営参加・支援

    Nitrification Network  3rd International conference on nitrification  2013年9月 　 　

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    種別：セミナー・ワークショップ

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  • 目には見えないミクロの世界をのぞいてみよう！―未知なる世界への挑戦―

    役割：司会,　講師,　運営参加・支援,　実演

    早稲田大学理工学術院  第23回ユニラブ（小中学生のための科学実験教室）  2010年8月 　 　

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    種別：出前授業

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