2024/03/30 更新

写真a

ワキタ ジュンイチ
脇田 順一
WAKITA Junichi
所属
理工学部 教授
その他担当機関
理工学研究科物理学専攻博士課程前期課程
理工学研究科物理学専攻博士課程後期課程
連絡先
メールによる問い合わせは《こちら》から
外部リンク

学位

  • 博士(理学) ( 中央大学 )

  • 修士(理学) ( 中央大学 )

学歴

  • 1997年3月
     

    中央大学   理工学研究科   物理学専攻   博士   修了

  • 1994年3月
     

    中央大学   理工学研究科   物理学専攻   修士   修了

  • 1992年3月
     

    中央大学   理工学部   物理学科   卒業

経歴

  • 2017年4月 -  

    中央大学理工学部教授

  • 2011年4月 - 2017年3月

    中央大学理工学部准教授

  • 2010年4月 - 2011年3月

    中央大学理工学部兼任講師

  • 2006年4月 - 2010年3月

    中央大学理工学部教育技術員

  • 2005年4月 - 2006年3月

    株式会社シーエステクノロジー

  • 2003年5月 - 2005年3月

    株式会社シーエスネット

  • 2001年4月 - 2003年4月

    株式会社アドバンストアルゴリズム&システムズ

  • 1997年4月 - 2001年3月

    中央大学理工学部教育技術員

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所属学協会

  • 日本物理学会

研究キーワード

  • アクティブ・マター,フラクタル物理,統計物理

研究分野

  • 自然科学一般 / 数理物理、物性基礎  / 数理物理・物性基礎

論文

  • Cell population migration cycle and response to environmental pH in Bacillus subtilis

    Sohei Tasaki, Madoka Nakayama, Izumi Takagi, Jun-ichi Wakita, Wataru Shoji

    2020年9月

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    出版者・発行元:Cold Spring Harbor Laboratory  

    <title>Abstract</title>Microbial populations are ubiquitous and some form a robust, multicellular structure called biofilm that protects the cells from environmental damage. The dispersion cycle is critical for controlling the population of important target microbes (both pathogenic and beneficial). Here, we show that the hysteresis of <italic>Bacillus subtilis</italic> cell-type regulation with respect to auto-inducing signal strength triggers the migration cycle of the cell population. We investigate migration cycle and its dependence on environmental conditions by quantitative analysis of cyclically expanding, concentric circular colonies. Next, we construct an input/output model that controls cell types in response to environmental conditions and signal density. On the basis of this model, we propose a migration cycle model for cell populations. The proposed model will widely predict biofilm-related phenomena and provide the basis for the description of highly self-regulating multicellular systems.

    DOI: 10.1101/2020.09.11.292474

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  • Cell-cell and Cell-noise Interactions of Bacterial Cells in a Shallow Circular Pool and Transitions of Collective Motions 査読

    R. Honda, S. Umeda, J. Wakita

    J. Phys. Soc. Jpn.   88   054005   2019年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:日本物理学会  

    DOI: 10.7566/JPSJ.88.054005

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  • Analysis of a Stochastic Model for Bacterial Growth and the Lognormality of the Cell-Size Distribution 査読

    Ken Yamamoto, Jun-ichi Wakita

    JOURNAL OF THE PHYSICAL SOCIETY OF JAPAN   85 ( 7 )   074004   2016年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PHYSICAL SOC JAPAN  

    This paper theoretically analyzes a phenomenological stochastic model for bacterial growth. This model comprises cell division and the linear growth of cells, where growth rates and cell cycles are drawn from lognormal distributions. We find that the cell size is expressed as a sum of independent lognormal variables. We show numerically that the quality of the lognormal approximation greatly depends on the distributions of the growth rate and cell cycle. Furthermore, we show that actual parameters of the growth rate and cell cycle take values that give a good lognormal approximation; thus, the experimental cell-size distribution is in good agreement with a lognormal distribution.

    DOI: 10.7566/JPSJ.85.074004

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  • Phase Diagram of Collective Motion of Bacterial Cells in a Shallow Circular Pool 査読

    Jun-ichi Wakita, Shota Tsukamoto, Ken Yamamoto, Makoto Katori, Yasuyuki Yamada

    JOURNAL OF THE PHYSICAL SOCIETY OF JAPAN   84 ( 12 )   124001   2015年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PHYSICAL SOC JAPAN  

    The collective motion of bacterial cells in a shallow circular pool is systematically studied using the bacterial species Bacillus subtilis. The ratio of cell length to pool diameter (i.e., the reduced cell length) ranges from 0.06 to 0.43 in our experiments. Bacterial cells in a circular pool show various types of collective motion depending on the cell density in the pool and the reduced cell length. The motion is classified into six types, which we call random motion, turbulent motion, one-way rotational motion, two-way rotational motion, random oscillatory motion, and ordered oscillatory motion. Two critical values of reduced cell lengths are evaluated, at which drastic changes in collective motion are induced. A phase diagram is proposed in which the six phases are arranged.

    DOI: 10.7566/JPSJ.84.124001

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  • Self-Elongation with Sequential Folding of a Filament of Bacterial Cells 査読

    Ryojiro Honda, Jun-Ichi Wakita, Makoto Katori

    JOURNAL OF THE PHYSICAL SOCIETY OF JAPAN   84 ( 11 )   114002   2015年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PHYSICAL SOC JAPAN  

    Under hard-agar and nutrient-rich conditions, a cell of Bacillus subtilis grows as a single filament owing to the failure of cell separation after each growth and division cycle. The self-elongating filament of cells shows sequential folding processes, and multifold structures extend over an agar plate. We report that the growth process from the exponential phase to the stationary phase is well described by the time evolution of fractal dimensions of the filament configuration. We propose a method of characterizing filament configurations using a set of lengths of multifold parts of a filament. Systems of differential equations are introduced to describe the folding processes that create multifold structures in the early stage of the growth process. We show that the fitting of experimental data to the solutions of equations is excellent, and the parameters involved in our model systems are determined.

    DOI: 10.7566/JPSJ.84.114002

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  • Dynamical Properties in Uniform and Periodic Growth Modes of Ascorbic Acid Crystal Domain from Thin Solution Film 査読

    Yoshihiro Yamazaki, Mitsunobu Kikuchi, Akihiko Toda, Jun-ichi Wakita, Mitsugu Matsushita

    JOURNAL OF THE PHYSICAL SOCIETY OF JAPAN   83 ( 6 )   064002   2014年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PHYSICAL SOC JAPAN  

    There exists a threshold-sensitive dynamical transition between uniform and periodic growth modes in the domain growth of ascorbic acid crystals from its aqueous supersaturated solution film. The crystal growth induces solution flow. Humidity controls the fluidity of the solution. The solution flow varies the film thickness. The threshold exists in the thickness of the solution film. If the thickness becomes lower than the threshold, the solution flow and the crystal growth almost stop.

    DOI: 10.7566/JPSJ.83.064002

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  • “Average-Value Paradox” of the Lognormal Distribution 査読

    K. Yamamoto, J. Wakita

    J. Phys. Soc. Jpn.   82 ( 11 )   113001   2013年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:日本物理学会  

    DOI: 10.7566/JPSJ.82.113001

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  • Effects of urea on length distribution and morphology of Escherichia coli and Salmonella enterica subsp. enterica cells 査読

    M. Fujihara, J. Wakita, D. Kondoh, M. Matsushita, R. Harasawa

    African journal of microbiology research   7 ( 18 )   1780 - 1786   2013年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:academic journals  

    DOI: 10.5897/AJMR12.1102

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  • 尿素ブロスで増殖したEscherichia coliフィラメント細胞の形態学的・遺伝学的解析(Morphological and genetic analyses of filamentous Escherichia coli grown in urea broth)

    藤原 正俊, 脇田 順一, 松下 貢, 原澤 亮

    日本細菌学雑誌   67 ( 1 )   140 - 140   2012年2月

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    記述言語:英語   出版者・発行元:日本細菌学会  

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  • Statistical Features of Complex Systems –Toward Establishing Sociological Physics– 査読

    Naoki Kobayashi, Hiroto Kuninaka, Jun-ichi Wakita, Mitsugu Matsushita

    J. Phys. Soc. Jpn.   80 ( 7 )   072001   2011年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:日本物理学会  

    DOI: 10.1143/JPSJ.80.072001

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  • Size Distribution of Bacterial Cells in Homogeneously Spreading Disk-like Colonies by Bacillus subtilis 査読

    Jun-ichi Wakita, Hiroto Kuninaka, Tohey Matsuyama, Mitsugu Matsushita

    JOURNAL OF THE PHYSICAL SOCIETY OF JAPAN   79 ( 9 )   094002   2010年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PHYSICAL SOC JAPAN  

    We have experimentally investigated size distribution of bacterial cells at the circumference of homogeneously spreading disk-like colonies formed by Bacillus subtilis, and found that the size distribution of bacterial cells shows lognormal. We have developed a phenomenological model based on the experimental results for the growth process of bacterial cells and confirmed that the model reproduces a lognormal distribution of bacterial cell size which is very close to our experimental result. Our results indicate that both the lognormal distributions of cell cycle and cell growth rate are essential for the lognormal distribution of bacterial cell size.

    DOI: 10.1143/JPSJ.79.094002

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  • Concentric-ring-like Colony of P. mirabilis

    S. Tonomura, S. Ebara, T. Yoshino, J. Wakita, T. Matsuyama, M. Matsushita

    Proceedings of the 9th Asia-Pacific Complex Systems Conference, (2009).   412 - 412   2009年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)  

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  • Size Distribution of Bacterial Cells in Homogeneously Spreading Disk-like Colonies by B. subtilis

    J. Wakita, T. Matsuyama, M. Matsushita

    Proceedings of the 9th Asia-Pacific Complex Systems Conference, (2009).   419 - 419   2009年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)  

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  • Concentric-ring pattern formation of bacterial colonies of Escherichia coli

    T. Yoshino, S. Ebara, S. Tonomura, R. Tokita, T. Katoh, Y. Maeda, J. Wakita, M. Sano, T. Matsuyama, M. Matsushita

    Proceedings of the 9th Asia-Pacific Complex Systems Conference, (2009).   414 - 414   2009年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)  

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  • Pattern Formation of Bacterial Colonies by Escherichia coli

    S. Ebara, T. Yoshino, S. Tonomura, R. Tokita, T. Kato, Y. Maeda, J. Wakita, M. Sano, T. Matsuyama, M. Matsushita

    Proceedings of the 9th Asia-Pacific Complex Systems Conference, (2009).   416 - 416   2009年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)  

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  • Pattern Formation of Bacterial Colonies by Escherichia coli 査読

    Rie Tokita, Takaki Katoh, Yusuke Maeda, Jun-ichi Wakita, Masaki Sano, Tohey Matsuyama, Mitsugu Matsushita

    JOURNAL OF THE PHYSICAL SOCIETY OF JAPAN   78 ( 7 )   704005   2009年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PHYSICAL SOC JAPAN  

    We have studied the morphological diversity and change in bacterial colonies, using the bacterial species Escherichia coli, as a function of both agar concentration C-a and nutrient concentration C-n. We observed various colony patterns, classified them into four types by pattern characteristics and established a morphological diagram by dividing it into four regions. They are regions A [diffusion-limited aggregation (DLA)-like], B (Eden-like), C (concentric-ring), and D (fluid-spreading). In particular, we have observed a concentric-ring colony growth for E. coli. We focused on the periodic growth in region C and obtained the following results: (i) A colony grows cyclically with the growing front repeating an advance (migration phase) and a momentary rest (consolidation phase) alternately. (ii) The growth width L and the bulge width W in one cycle decrease asymptotically to certain values, when C-a is increased. (iii) L does not depend on C-n, while W is an increasing function of C-n. Plausible mechanisms are proposed to explain the experimental results, by comparing them with those obtained for other bacterial species such as Proteus mirabilis and Bacillus subtilis.

    DOI: 10.1143/JPSJ.78.074005

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  • Swarming of Pseudomonas aeruginosa PAO1 without differentiation into elongated hyperflagellates on hard agar minimal medium 査読

    Chihiro Takahashi, Takashi Nozawa, Taichiro Tanikawa, Yoji Nakagawa, Junichi Wakita, Mitsugu Matsushita, Tohey Matsuyama

    FEMS MICROBIOLOGY LETTERS   280 ( 2 )   169 - 175   2008年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:BLACKWELL PUBLISHING  

    Polar flagellated Pseudomonas aeruginosa PAO1 demonstrated extensive spreading growth in 2 days on 1.5% agar medium. Such spreading growth of P. aeruginosa PAO1 strains was absent on Luria-Bertani 1.5% agar medium, but remarkable on Davis minimal synthetic agar medium (especially that containing 0.8% sodium citrate and 1.5% Eiken agar) under aerobic 37 degrees C conditions. Analyses using isogenic mutants and complementation transformants showed that bacterial flagella and rhamnolipid contributed to the surface-spreading behavior. On the other hand, a type IV pilus-deficient pilA mutant did not lose the spreading growth activity. Flagella staining of PAO1 T cells from the frontal edge of a spreading colony showed unipolar and normal-sized rods with one or two flagella. Thus, the polar flagellate P. aeruginosa PAO1 T appears to swarm on high-agar medium by producing biosurfactant rhamnolipid and without differentiation into an elongated peritrichous hyperflagellate.

    DOI: 10.1111/j.1574-6968.2007.01057.x

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  • Periodic growth of bacterial colonies 査読

    Y Yamazaki, T Ikeda, H Shimada, F Hiramatsu, N Kobayashi, J Wakita, H Itoh, S Kurosu, M Nakatsuchi, T Matsuyama, M Matsushita

    PHYSICA D-NONLINEAR PHENOMENA   205 ( 1-4 )   136 - 153   2005年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:ELSEVIER SCIENCE BV  

    The formation of concentric ring colonies by bacterial species Bacillus subtilis and Proteus mirabilis has been investigated experimentally, focusing our attention on the dependence of local cell density upon the bacterial motility. It has been confirmed that these concentric ring colonies reflect the periodic change of the bacterial motility between motile cell state and immotile cell state. We conclude that this periodic change is macroscopically determined neither by biological factors (i.e., biological clock) nor by chemical factors (chemotaxis as inhibitor). And our experimental results strongly suggest that the essential factor for the change of the bacterial motility during concentric ring formation is the local cell density. (c) 2005 Elsevier B.V. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/j.physd.2004.12.013

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  • Patterns of Expansion produced by a Structured Cell Population of Serratia marcescens in Response to Different Media 査読

    Fumiko Hiramatsu, Jun-Ichi Wakita, Naoki Kobayashi, Yoshihiro Yamazaki, Mitsugu Matsushita, Tohey Matsuyama

    Microbes and Environments   20 ( 2 )   120 - 125   2005年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Japanese Society of Microbial Ecology  

    Characteristic patterns of expansion were generated by bacterial cell populations of Serratia marcescens on media with different concentrations of nutrient and agar. These patterns were classified as Eden-like, dense-branching-morphology-like, flower-like, concentric ring-like and diffusion-limited aggregation-like. Although flower-like was specific to Serratia marcescens, the other patterns were exhibited by Bacillus subtilis. Through macro- and microscopic tracing of the processes generating these patterns, physico-chemical principles of bacterial growth, collaborative and independent properties of bacteria, structural organization for population expansion, and the division of labor among bacterial cells (i.e., wall composer, pressure generator, and logistic supporter) were brought to light. © 2005, Japanese Society of Microbial Ecology &amp
    The Japanese Society of Soil Microbiology. All rights reserved.

    DOI: 10.1264/jsme2.20.120

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  • Dependence of local cell density on concentric ring colony formation by bacterial species Bacillus subtilis 査読

    H Shimada, T Ikeda, J Wakita, H Itoh, S Kurosu, F Hiramatsu, M Nakatsuchi, Y Yamazaki, T Matsuyama, M Matsushita

    JOURNAL OF THE PHYSICAL SOCIETY OF JAPAN   73 ( 4 )   1082 - 1089   2004年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PHYSICAL SOC JAPAN  

    The formation of concentric ring-like colonies by bacterial species Bacillus subtilis has been investigated, focusing our attention on the effect of local cell density upon the bacterial motility: (i) Neither any chemicals nor a pacemaker at the center of the ring takes part in the concentric ring formation. (ii) Phase entrainment between two colonies having different phase of concentric ring does not occur. (iii) From the measurement of lag-phase time when varying the initial cell density, the start of the first migration phase is found to depend on the cell density. (iv) When cutting the part of a colony which is behind a migration phase just after the start of migration, the migration phase becomes shorter. On the other hand, the following consolidation phase becomes longer. (v) By the replica-printing method, active bacteria move collectively from inside to outside of the outermost consolidation terrace. Our present experimental results are qualitatively consistent with the results of the other bacterial species P. mirabilis, although the individual cell motility is quite different from each other. The present results suggest that the essential factor of the change of the bacterial motility of B. subtilis during concetric ring formation is the local cell density.

    DOI: 10.1143/JPSJ.73.1082

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  • Dynamical properties of transient spatio-temporal patterns in bacterial colony of Proteus mirabilis 査読

    K Watanabe, J Wakita, H Itoh, H Shimada, S Kurosu, T Ikeda, Y Yamazaki, T Matsuyama, M Matsushita

    JOURNAL OF THE PHYSICAL SOCIETY OF JAPAN   71 ( 2 )   650 - 656   2002年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PHYSICAL SOC JAPAN  

    Spatio-temporal patterns emerged inside a colony of bacterial species Proteus mirabilis on the surface of nutrient-rich semisolid agar medium have been investigated. We observed various patterns composed of the following basic types: propagating stripe, propagating stripe with fixed dislocation, expanding and shrinking target, and rotating spiral. The remarkable point is that the pattern changes immediately when we alter the position for observation, but it returns to the original if we restore the observing position within a few minutes. We further investigated mesoscopic and microscopic properties of the spatiotemporal patterns. It turned out that whenever the spatio-temporal patterns are observed in a colony, the areas are composed of two superimposed monolayers of elongated bacterial cells. In each area they are aligned almost parallel with each other like a two-dimensional nematic liquid crystal, and move collectively and independently of another layer. It has been found that the observed spatio-temporal patterns are explained as the moire effect.

    DOI: 10.1143/JPSJ.71.650

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  • Periodic colony formation by bacterial species Bacillus subtilis 査読

    J Wakita, H Shimada, H Itoh, T Matsuyama, M Matsushita

    JOURNAL OF THE PHYSICAL SOCIETY OF JAPAN   70 ( 3 )   911 - 919   2001年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PHYSICAL SOC JAPAN  

    We have investigated the periodic colony growth of bacterial species Bacillus subtilis. A colony grows cyclically with the interface repeating an advance (migration phase) and a rest (consolidation phase) alternately on a surface of semi-solid agar plate under appropriate environmental conditions, resulting in a concentric ring-like colony. It was found from macroscopic observations that the characteristic quantities for the periodic growth such as the migration time, the consolidation time and the terrace spacing do not depend so much on nutrient concentration C-n, but do on agar concentration C-a. The consolidation time was a weakly increasing function of C-a, while the migration time and the terrace spacing were, respectively, weakly and strongly decreasing function of C-a. Overall, the cycle (migration-plus-consolidation) time seems to be constant, and does not depend so much on both C-n and C-a. Microscopically, bacterial cells inside the growing front of a colony keep increasing their population during both migration and consolidation phases. It was also confirmed that their secreting surfactant called surfactin does not affect their periodic growth qualitatively, i.e., mutant cells which cannot secrete surfactin produce a concentric ring-like colony. All these results suggest that the diffusion of the nutrient and the surfactin are irrelevant to their periodic growth.

    DOI: 10.1143/JPSJ.70.911

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  • Dynamic aspects of the structured cell population in a swarming colony of Proteus mirabilis 査読

    T Matsuyama, Y Takagi, Y Nakagawa, H Itoh, J Wakita, M Matsushita

    JOURNAL OF BACTERIOLOGY   182 ( 2 )   385 - 393   2000年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:AMER SOC MICROBIOLOGY  

    Proteus mirabilis forms a concentric-ring colony by undergoing periodic swarming. A colony in the process of such synchronized expansion was examined for its internal population structure. In alternating phases, i.e., swarming (active migration) and consolidation (growth without colony perimeter expansion), phase-specific distribution of cells differing in length, in situ mobility, and migration ability on an agar medium were recognized. In the consolidation phase, the distribution of mobile cells was restricted to the inner part of a new ring and a previous terrace. Cells composing the outer part of the ring were immobile in spite of their ordinary swimming ability in a viscous solution. A sectorial cell population having such an internal structure was replica printed on fresh agar medium. After printing, a transplant which was in the swarming phase continued its ongoing swarming while a transplanted consolidation front continued its scheduled consolidation. This shows that cessation of migration during the consolidation phase was not due to substances present in the underlying agar medium. The ongoing swarming schedule was modifiable by separative cutting of the swarming front or disruption of the ring pattern by random mixing of the pattern-forming cell population. The structured cell population seemed to play a role in characteristic colony growth. However, separation of a narrow consolidation front from a backward area did not induce disturbance in the ongoing swarming schedule. Thus, cells at the frontal part of consolidation area were independent of the internal cell population and destined to exert consolidation and swarming with the ongoing ordinary schedule.

    DOI: 10.1128/JB.182.2.385-393.2000

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  • Periodic colony formation of bacteria due to their cell reproduction and movement 査読

    H Itoh, J Wakita, K Watanabe, T Matsuyama, M Matsushita

    PROGRESS OF THEORETICAL PHYSICS SUPPLEMENT   139 ( 139 )   139 - 151   2000年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PROGRESS THEORETICAL PHYSICS PUBLICATION OFFICE  

    We have experimentally investigated periodic pattern formation produced by bacterial species Proteus mirabilis, which forms concentric-ring-like colonies by repeating migration and rest alternately on the surface of a solid agar medium. We distinguish three phases (initial lag phase, the following migration and consolidation phases that appear alternately) for the colony growth. Here we mainly used physical approaches in order to try to understand the formation of concentric-ring-like colonies, such as cutting the part of a colony during its growth. Global chemical signals governing the colony formation from the center were not found. We also checked phase entrainment quantitatively by letting two colonies collide with each other and confirmed that it does not take place in macroscopic scales. When ive cut a colony just behind the migrating front shortly after the migration started, the migration ended earlier and the following consolidation lasted longer. However, the following cycles were not influenced by the cut, i.e., the following migration and consolidation phases were both found to return normal. The cut results in the stop of supply of cell population to the migrating front by internal waves. In fact the cell population on the new terrace during the first migration after the cut was less than that without cut. Furthermore, the cell population density was found to be recovered to the ordinary value by the end of the consolidation. All these experimental results suggest that the most important factor for the repetition of migration and consolidation phases is the cell population density.

    DOI: 10.1143/PTPS.139.139

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  • Formation of colony patterns by a bacterial cell population 査読

    M Matsushita, J Wakita, H Itoh, K Watanabe, T Arai, T Matsuyama, H Sakaguchi, M Mimura

    PHYSICA A   274 ( 1-2 )   190 - 199   1999年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:ELSEVIER SCIENCE BV  

    Bacterial species Bacillus subtilis is known to exhibit various colony patterns, such as diffusion-limited aggregation (DLA)-like, compact Eden-like, dense branching morphology (DBM)-like, concentric ring-like and disk-like, depending on the substrate softness and nutrient concentration. We have established the morphological diagram of colony patterns, and examined and characterized both macroscopically and microscopically how they grow. For instance, we have found that there seem to be two kinds of bacterial cells; active and inactive cells, the former of which drive colony interfaces outward, The active cells are particularly distinguished from the inactive ones at the tips of growing branches of a DBM-like colony as the characteristic fingernail structure, We have also found that the concentric ring-like colony is formed as a consequence of alternate repetition of advancing and resting of the growing interface which consists of active cells. Based on our observations, we have constructed a phenomenological but unified model which produces characteristic colony patterns. It is a reaction-diffusion type model for the population density of bacterial cells and the concentration of nutrient. The essential assumption is that there exist: two types of bacterial cells; active cells that move actively, grow and perform cell division, and inactive ones that do nothing at all. Our model is found to be able to reproduce globally all the colony patterns seen in the experimentally obtained morphological diagram, and is phenomenologically quite satisfactory, (C) 1999 Elsevier Science B.V. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/S0378-4371(99)00328-3

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  • Periodic pattern formation of bacterial colonies 査読

    H Itoh, J Wakita, T Matsuyama, M Matsushita

    JOURNAL OF THE PHYSICAL SOCIETY OF JAPAN   68 ( 4 )   1436 - 1443   1999年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PHYSICAL SOC JAPAN  

    We have experimentally investigated pattern formation of colonies of bacterial species Proteus mirabilis, which is famous for forming concentric-ring-like colonies. The colony grows cyclically with the interface repeating an advance and a stop, alternately on a surface of a solid agar medium. We distinguish three phases (initial lag phase, the following migration and consolidation phases that appear alternately) for the colon!: growth. When we cut a colony just behind a migrating front shortly after the migration started, the migration ended earlier and the following consolidation lasted longer. However, the following cycles were not influenced by the cut, i.e., the phases of the migration and consolidation were not affected. Global chemical signals governing the colony formation from the center were not found to exist. We also quantitatively checked phase entertainment Ly letting two colonies collide with each other and found trial it does not take place in macroscopic scales. All these experimental results suggest that the most important factor for the migration is the cell population density.

    DOI: 10.1143/JPSJ.68.1436

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  • Experimental investigation on the formation of dense-branching-morphology-like colonies in bacteria 査読

    J Wakita, Rafols, I, H Itoh, T Matsuyama, M Matsushita

    JOURNAL OF THE PHYSICAL SOCIETY OF JAPAN   67 ( 10 )   3630 - 3636   1998年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PHYSICAL SOC JAPAN  

    We have investigated experimentally the pattern formation of bacterial colonies. We have especially examined DBM (dense-branching-morphology)-like colonies of bacterial species Bacillus subtilis. It was found from microscopic observations that many active bacterial cells collect and make a group on the tip of each growing branch. Branches repel each other and split sometimes as they sow outward. It was confirmed macroscopically that both averaged branch width [width] and averaged branch gap [gap] decrease systematically when increasing the nutrient concentration C-n, while their ratio remains unchanged with the approximate value of one. It was also found that the distribution of branch lengths is very close to exponential, suggesting that the tip-splitting of branches takes place at random.

    DOI: 10.1143/jpsj.67.3630

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  • Formation of Dense-Branching-Morphology-like Colonies in Bacteria

    J. Wakita, I. Rafols, H. Itoh, T. Matsuyama, M. Matsushita

    STATPHYS20 Book of Abstracts, A. GERVOIS, M. GINGOLD and D. IAGOLNITZER eds. (1998)   21 - 21   1998年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)  

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  • Interface growth and pattern formation in bacterial colonies 査読

    M Matsushita, J Wakita, H Itoh, Rafols, I, T Matsuyama, H Sakaguchi, M Mimura

    PHYSICA A   249 ( 1-4 )   517 - 524   1998年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:ELSEVIER SCIENCE BV  

    Bacterial species Bacillus subtilis is known to exhibit various colony patterns, depending on the substrate softness and nutrient concentration. We have examined the self-affinity and roughness exponent a for growing interfaces of colonies which belong to regions B (Eden-like) and D (disk-like) in the morphological phase diagram of this species. We have obtained alpha similar or equal to 0.78 and 0.50 in the regions B and D, respectively, and found that the difference of alpha values can be attributed to that of microscopic growth mechanisms of colony interfaces. We have also proposed a unified model which produces characteristic colony patterns observed in our experiments. It is a diffusion-reaction-type model for the population density of bacterial cells and the concentration of nutrient. The essential assumption is that there exist two types of bacterial cells; active and inactive. Our model is found to be able to globally reproduce all the colony patterns in the phase diagram. (C) 1998 Elsevier Science B.V. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/S0378-4371(97)00511-6

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  • Pattern Formation in Bacterial Colonies and Its Modelling

    M. Matsushita, J. Wakita, H. Itoh, I. Rafols, T. Matsuyamah, H. Sakaguchi, M. Mimura

    STATISTICAL PHYSICS Experiments, Theories, and Computer Simulations, M. Tokuyama and I. Oppenheim eds.   135 - 138   1998年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)   出版者・発行元:World Scientific, Singapore  

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  • Experimental Study of Concentric Ring Patterns in Bacterial Colonies

    I. Rafols, J. Wakita, H. Itoh, T. Matsuyama, M. Matsushita

    STATISTICAL PHYSICS Experiments, Theories, and Computer Simulations, M. Tokuyama and I. Oppenheim eds.   146 - 146   1998年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)   出版者・発行元:World Scientific, Singapore  

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  • Self-affinity for the growing interface of bacterial colonies 査読

    J Wakita, H Itoh, T Matsuyama, M Matsushita

    JOURNAL OF THE PHYSICAL SOCIETY OF JAPAN   66 ( 1 )   67 - 72   1997年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PHYSICAL SOC JAPAN  

    We have investigated experimentally the self-affinity of bacterial colonies. We examined roughness exponent alpha for one-dimensional growing interfaces of colonies which belong to regions B and D in the morphological phase diagram of bacterial species Bacillus subtilis. Although macroscopically compact colony patterns are obtained in both B and D regions, microscopic growth mechanisms of their colony interfaces are quite different from each other. In the region B where the colony interface consists of many chains of bacterial cells that lie almost side by side and advances with clear long-range lateral correlations, we obtained alpha similar or equal to 0.78 +/- 0.02. In the region D, however, where the interface is made of individual cells and advances rather locally through random pushes due to active movement of individual cells inside the colony, the value of alpha similar or equal to 0.50 +/- 0.01 was obtained. The difference of values of the exponent alpha was thus found to be clearly attributed to that of microscopic growth mechanisms of colony interfaces.

    DOI: 10.1143/JPSJ.66.67

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  • Morphological diversity of the colony produced by bacteria Proteus mirabilis 査読

    A Nakahara, Y Shimada, J Wakita, M Matsushita, T Matsuyama

    JOURNAL OF THE PHYSICAL SOCIETY OF JAPAN   65 ( 8 )   2700 - 2706   1996年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PHYSICAL SOC JAPAN  

    Morphological changes of colonies have been investigated for a bacterial strain of Proteus mirabilis, which is a famous species for producing concentric-ring-like colonies. It was found that colony patterns can be classified into three types, i.e., cyclic spreading, diffusion-limited growth (DLA-like) and three-dimensional growth (inside the agar medium) patterns. Cyclic spreading patterns can further be classified into three subgroups, i.e., concentric-ring, homogeneous and spatiotemporal patterns. These subgroups were classified by examining the development of colony structure after colonies spread all over petri-dishes. Comparison of the results with those of another bacterial species Bacillus subtilis is also discussed.

    DOI: 10.1143/JPSJ.65.2700

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  • Growth and morphological changes of bacteria colonies

    M Matsushita, J Wakita, T Matsuyama

    SPATIO-TEMPORAL PATTERNS IN NONEQUILIBRIUM COMPLEX SYSTEMS   21   609 - 618   1995年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)   出版者・発行元:ADDISON-WESLEY PUBL CO  

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  • Growth Dynamics of Bacterial Colonies and Their Morphological Change

    M. Matsushita, J. Wakita, K. Komatsu, A. Nakahara, T. Matsuyama

    Dynamical Systems and Chaos, vol.2(Physics), Y. Aizawa, S. Saito and K. Shiraiwa eds.   151 - 160   1995年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)   出版者・発行元:World Scientific, Singapore  

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  • PATTERN-FORMATION BY REPRODUCIBLE RANDOM WALKERS IN IRREVERSIBLY EXPANDABLE ENCLOSURE 査読

    K KOMATSU, J WAKITA, A NAKAHARA, M MATSUSHITA

    JOURNAL OF THE PHYSICAL SOCIETY OF JAPAN   63 ( 9 )   3230 - 3233   1994年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PHYSICAL SOCIETY JAPAN  

    Based on microscopic observations, a reproducible random-walker model is presented to simulate the growth of a bacterial colony. Random walkers expand their territory by pushing the wall surrounding their colony. Numerical studies revealed that the model can explain our experimental results obtained using the bacteria species Bacillus subtilis.

    DOI: 10.1143/JPSJ.63.3230

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  • EXPERIMENTAL INVESTIGATION ON THE VALIDITY OF POPULATION-DYNAMICS APPROACH TO BACTERIAL COLONY FORMATION 査読

    J WAKITA, K KOMATSU, A NAKAHARA, T MATSUYAMA, M MATSUSHITA

    JOURNAL OF THE PHYSICAL SOCIETY OF JAPAN   63 ( 3 )   1205 - 1211   1994年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PHYSICAL SOC JAPAN  

    We have investigated the dynamics of a two-dimensional spreading of a bacterial population in a surface environment. After point inoculation of flagellated bacteria (Bacillus subtilis) on nutrient-rich semi-solid medium, the bacterial population grew up by multiplication and translocation of cells, and developed a homogeneous round colony. By comparing experimental results with those of numerical simulations of the model equation, we found that this homogeneous population growth of bacteria is an actual manifestation of growth dynamics described by the Fisher's equation.

    DOI: 10.1143/JPSJ.63.1205

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MISC

  • 18aM1-7 円形プール内の枯草菌集団運動における菌の相互作用

    加瀬兆久, 脇田順一

    日本物理学会講演概要集   2024年3月

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  • 19pCW-8 円形プール内におけるバクテリア集団運動の相図(19pCW 反応拡散系,その他の系,領域11(物性基礎論・統計力学・流体物理・応用数学・社会経済物理))

    脇田 順一, 塚本 翔太, 山本 健, 香取 眞理

    日本物理学会講演概要集   70   2867 - 2867   2015年8月

  • 19pCW-7 非線形微分方程式によるバクテリアの初期成長過程の解析(19pCW 反応拡散系,その他の系,領域11(物性基礎論・統計力学・流体物理・応用数学・社会経済物理))

    本田 良二郎, 脇田 順一, 香取 眞理

    日本物理学会講演概要集   70   2866 - 2866   2015年8月

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    記述言語:日本語  

    DOI: 10.11316/jpsgaiyo.70.2.0_2866

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  • 22aAJ-8 バクテリアのひも状成長にみられるパターン(22aAJ アクティブマター,その他の系,領域11(物性基礎論・統計力学・流体物理・応用数学・社会経済物理))

    本田 良二郎, 脇田 順一, 香取 眞理

    日本物理学会講演概要集   70   2956 - 2956   2015年3月

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    記述言語:日本語  

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  • 10aAR-4 2次元円形プール内におけるバクテリア集団運動(10aAR 領域12,領域11合同 生物合同II,領域12(ソフトマター物理・化学物理・生物物理))

    塚本 翔太, 山本 健, 香取 眞理, 脇田 順一

    日本物理学会講演概要集   69 ( 2 )   226 - 226   2014年8月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

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  • 26pKG-6 枯草菌のひも状成長によるコロニー形成(26pKG 反応拡散系・振動子系2・その他の系,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))

    脇田 順一, 山本 健, 松下 貢

    日本物理学会講演概要集   68 ( 2 )   243 - 243   2013年8月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

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  • 26aXR-8 円周上のTASEPとバクテリアの円運動観察(26aXR 確率過程・確率モデル1,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))

    山田 泰之, 香取 眞理, 脇田 順一

    日本物理学会講演概要集   68 ( 1 )   322 - 322   2013年3月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

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  • 29aXM-10 B.subtilisの同心円状パターン成長機構(29aXM 摩擦・地震・その他の系,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))

    熊田 龍人, 有馬 美奈, 脇田 順一, 松山 東平, 松下 貢

    日本物理学会講演概要集   68 ( 1 )   400 - 400   2013年3月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

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  • 28pXZD-11 バクテリアの時空パターンとモアレ錯視(28pXZD 領域12,領域11合同 生物合同セッション(モデル系など),領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

    小林 奈央樹, 脇田 順一, 森山 修, 山崎 義弘, 杉原 厚吉, 松下 貢

    日本物理学会講演概要集   68 ( 1 )   443 - 443   2013年3月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

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  • 29aXM-9 枯草菌DBMコロニーの枝幅・枝間隔分布(29aXM 摩擦・地震・その他の系,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))

    脇田 順一, 山本 健, 小林 奈央樹, 松山 東平, 松下 貢

    日本物理学会講演概要集   68 ( 1 )   400 - 400   2013年3月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

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  • 29aXM-11 緑膿菌コロニーの周期的成長パターン(29aXM 摩擦・地震・その他の系,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))

    有馬 美奈, 熊田 龍人, 脇田 順一, 松山 東平, 松下 貢

    日本物理学会講演概要集   68 ( 1 )   400 - 400   2013年3月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

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  • 26pAC-8 B. subtilisの同心円状リングパターン(26pAC その他の系(パターン形成など)・その他の数理モデル・生体分子機械(小さい非平衡系を含む),領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))

    熊田 龍人, 有馬 美奈, 脇田 順一, 松山 東平, 松下 貢

    日本物理学会講演概要集   67 ( 1 )   344 - 344   2012年3月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

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  • 26pAC-6 身長と体重に見られる統計分布の特性(26pAC その他の系(パターン形成など)・その他の数理モデル・生体分子機械(小さい非平衡系を含む),領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))

    佐藤 勇太, 脇田 順一, 松下 貢

    日本物理学会講演概要集   67 ( 1 )   344 - 344   2012年3月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

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  • 26pAC-10 枯草菌DBMコロニーの枝幅分布(3)(26pAC その他の系(パターン形成など)・その他の数理モデル・生体分子機械(小さい非平衡系を含む),領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))

    脇田 順一, 有馬 美奈, 熊田 龍人, 小林 奈央樹, 松山 東平, 松下 貢

    日本物理学会講演概要集   67 ( 1 )   345 - 345   2012年3月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

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  • 26pAC-5 宇宙マイクロ波背景放射のパーコレーション解析(26pAC その他の系(パターン形成など)・その他の数理モデル・生体分子機械(小さい非平衡系を含む),領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))

    樋口 真哉, 小林 奈央樹, 脇田 順一, 山崎 義弘, 國中 寛人, 香取 眞理, 松下 貢, 松下 聡樹, Chiang Lung-Yih

    日本物理学会講演概要集   67 ( 1 )   344 - 344   2012年3月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

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  • 26pAC-9 緑膿菌コロニーのパターン形成(26pAC その他の系(パターン形成など)・その他の数理モデル・生体分子機械(小さい非平衡系を含む),領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))

    有馬 美奈, 熊田 龍人, 脇田 順一, 松山 東平, 松下 貢

    日本物理学会講演概要集   67 ( 1 )   345 - 345   2012年3月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

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  • 20pED-10 枯草菌のサイズ分布(3)(20pED 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

    脇田 順一, 國仲 寛人, 松山 東平, 松下 貢

    日本物理学会講演概要集   65 ( 1 )   373 - 373   2010年3月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

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  • 26pQE-3 枯草菌のサイズ分布(2)(26pQE 生物物理,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)

    脇田 順一, 松山 東平, 松下 貢

    日本物理学会講演概要集   64 ( 2 )   260 - 260   2009年8月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

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  • 30pVC-4 緑膿菌コロニーのパターン形成(30pVC 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

    小谷野 真利子, 脇田 順一, 松山 東平, 松下 貢

    日本物理学会講演概要集   64 ( 1 )   398 - 398   2009年3月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

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  • 21pTP-7 B.subtilisディスク状コロニーの微視的観察(21pTP 生物・生態系(社会・言語・ゲーム等含む)2,領域11,統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理)

    脇田 順一, 松山 東平, 松下 貢

    日本物理学会講演概要集   62 ( 2 )   267 - 267   2007年8月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

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  • 30aYF-1 バクテリアProteus mirabilisによる時空パターン

    渡辺 一彦, 脇田 順一, 伊藤 裕人, 松山 東平, 松下 貢

    日本物理学会講演概要集   56 ( 1 )   271 - 271   2001年3月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

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  • Spatiotemporal Patterns Produced by Bacterial Species Proteus mirabilis〔和文〕 (複雑流体の数理2)

    渡辺 一彦, 脇田 順一, 伊藤 裕人, 松山 東平, 松下 貢

    数理解析研究所講究録   1184   89 - 105   2001年1月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:京都大学  

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    その他リンク: http://hdl.handle.net/2433/64611

  • Replica Printing for Concentric Ring-like Colonies of Bacillus subtilis〔和文〕 (複雑流体の数理2)

    島田 宏俊, 脇田 順一, 伊藤 裕人, 渡辺 一彦, 松山 東平, 松下 貢

    数理解析研究所講究録   1184   106 - 122   2001年1月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:京都大学  

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    その他リンク: http://hdl.handle.net/2433/64610

  • 26p-G-9 バクテリア増殖による同心円状コロニーの形成II

    伊藤 裕人, 脇田 順一, 松山 東平, 松下 貢

    日本物理学会講演概要集   53 ( 2 )   760 - 760   1998年9月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

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  • 1p-YS-4 バクテリア・コロニーのDBM的パターン形成機構

    脇田 順一, ISMAEL Rafols, 伊藤 裕人, 松山 東平, 松下 貢

    日本物理学会講演概要集   53 ( 1 )   683 - 683   1998年3月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

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  • 1p-YS-3 バクテリア増殖による同心円状コロニーの形成

    伊藤 裕人, ISMAEL Rafols, 脇田 順一, 松下 貢, 松山 東平

    日本物理学会講演概要集   53 ( 1 )   683 - 683   1998年3月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

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  • 30p-WE-14 細菌コロニー(B.subtilis)のDBMパターンとリングパターン形成機構

    脇田 順一, Rafols Ismael, 伊藤 裕人, 松山 東平, 松下 貢

    日本物理学会講演概要集   52 ( 1 )   728 - 728   1997年3月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

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  • 27a-YE-2 バクテリア(P.mirabilis)によるリングパターンと時空パターンの形成

    中原 明生, 島田 祐二, 森山 修, 脇田 順一, 松下 貢, 松山 東平

    日本物理学会講演概要集. 秋の分科会   1995 ( 4 )   71 - 71   1995年9月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

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  • 28p-C-8 バクテリア増殖によるパターン形成(サーファクタントの影響)

    脇田 順一, 伊藤 裕人, 中原 明生, 松下 貢, 松山 東平

    日本物理学会講演概要集. 年会   50 ( 3 )   573 - 573   1995年3月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

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  • 28a-C-4 バクテリア増殖によるパターン形成

    小松 賢治, 脇田 順一, 中原 明生, 松下 貢, 松山 東平

    日本物理学会講演概要集. 年会   49 ( 3 )   494 - 494   1994年3月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

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  • バクテリア増殖によるパターン形成(「非平衡系の統計物理」研究会(その1),研究会報告)

    松下 貢, 脇田 順一, 松山 東平

    物性研究   59 ( 1 )   76 - 79   1992年

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:物性研究刊行会  

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    その他リンク: http://hdl.handle.net/2433/94965

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講演・口頭発表等

  • 円形プール内の枯草菌集団運動における菌の相互作用

    加瀬兆久, 脇田順一

    日本物理学会 2024年春季大会  ( オンライン )   2024年3月  日本物理学会

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    開催年月日: 2024年3月    

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    本研究では換算菌体長0 λ <0.2 の範囲でのプール内に菌が2匹存在する系に着目した。2 匹の系では菌間にはたらく相互作用を明らかにできる可能性が期待される。実際に観察してみたところ、接近した2匹の菌は軸の方向を揃えて一緒に運動する傾向があることが確認された。さらに、2匹の菌の重心間距離ℓと速度v の関係を調べた結果、ℓ≦10 µm においてv はℓの減少関数となっていて、ℓ≧10 µm ではv はほぼ一定の値をとった。

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  • 円形プール内における枯草菌集団運動にみられる同期現象

    阿久津遼, 脇田順一

    日本物理学会 2023年春季大会  ( オンライン )   2023年3月  日本物理学会

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    開催年月日: 2023年3月    

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    寒天培地の表面に人工的につくられた小さな窪みである円形プールにトラップされた枯草菌の集団運動を、様々な菌数および菌サイズの系について観察する。円形プール内の菌の速度分布、秩序パラメータ、さらには、任意の菌のペアに対する位相の時間変化の相互相関関数などを調べることにより、円形プール内における枯草菌集団運動の振る舞いにみられる、同期現象を定量的に理解することを目的とする。

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  • NaCl結晶成長における周期的先端分岐パターン形成機構

    浅井郁弥, 脇田順一

    日本物理学会 2023年春季大会  ( オンライン )   2023年3月  日本物理学会

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    開催年月日: 2023年3月    

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    塩化ナトリウム結晶を寒天平板上で2次元的に成長させると、寒天濃度と塩化ナトリウム濃度の初期濃度によって4つのパターンが観察される。本研究ではその中の1つである周期的先端分岐パターンに着目し、分岐状況の観察や成長速度、高さの測定からパターン形成機構を解明するための研究を行っている。また、周期的先端分岐パターン以外の3つのパターンについても成長速度や高さを測定し比較を行った。

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  • バクテリア・コロニーのメタステート的振る舞いの起源

    脇田順一

    日本物理学会 2022年秋季大会  ( 東京工業大学大岡山キャンパス )   2022年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    寒天平板上で成長するB. subtilisコロニーは、寒天濃度と栄養濃度を環境パラメータとして、5種類のコロニー・パターンに分類できる。これらパターンの形成機構とパターン間の遷移の仕組みについて、菌単体レベルにおける相互作用との関係から議論する。

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  • サーファクタント添加培地上における枯草菌コロニーの DBM 成長

    小林駿, 脇田順一

    日本物理学会 第77回年次大会  ( オンライン )   2022年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    枯草菌がコロニー形成時に分泌するサーファクタントをあらかじめ培地表面に添加したときにコロニーが時計回りの螺旋成長を示すことを確認した。コロニー先端部の光学顕微鏡観察を行った結果、サーファクタントを塗り拡げていない培地上ではコロニー成長界面に対して棒状の菌が平行に並ぶ傾向がみられたのに対して、サーファクタントを塗り拡げた培地上ではコロニー成長界面に対して棒状の菌が斜めに配列する傾向がみられた。コロニー成長界面におけるこれらの菌の配列の違いがコロニーの成長の違いを引き起こしていることが分かった。

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  • COVID19 感染者数の統計的性質

    瀧澤 健太, 脇田 順一

    日本物理学会 2021年秋季大会  ( オンライン )   2021年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    本研究では、世界各国のCOVID19感染者数データに着目し,統計物理学的な立場より解析を行った。その結果、累積感染者数分布は概ね対数正規分布に従うが、2020年11月頃より分布の裾野がべき分布的に振る舞うことが確認された。その原因として、分布の裾野の国の感染率分布において、これ以上大きくならない閾値(最大値)が存在することが示唆された。

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  • 日本の首都圏における街区面積分布

    千明宥登, 脇田順一

    日本物理学会 2021年秋季大会  ( オンライン )   2021年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    道路に囲まれた土地の面積分布はドイツの主要20都市についてべき乗分布に従うことが報告されている。一方、日本では東京23区について江戸時代と明治時代について、対数正規分布に従うことが報告されている。本研究では、東京浅草を起点とし、周辺にかけて面積分布がどのように変化していくかを調べた。その結果、東京浅草の分布は面積の小さい領域では対数正規的に、面積の大きい裾野の領域ではべき的に振る舞いうことを確認した。そして、周辺にいくにしたがって、分布は全体的に対数正規分布に従うようになっていることを確認した。

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  • 細長いガラス棒の破壊メカニズム

    白尾陸, 成塚拓真, 脇田順一

    日本物理学会 第75回年次大会  ( 名古屋大学東山キャンパス )   2020年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    ガラス棒の破壊における破片質量分布は落下高さにより変化することが知られている。今回は落下を繰り返すことによる分布の変化について調べた。

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  • 枯草菌集団運動にみられる動的転移のメカニズム

    脇田順一, 本田良二郎, 梅田大, 成塚拓真

    日本物理学会 2019年秋季大会  ( 岐阜大学柳戸キャンパス )   2019年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Cell-cell and Cell-noise Interactions of Bacterial Cells in a Shallow Circular Pool and Transitions of Collective Motions 国際会議

    Jun-ichi Wakita

    International Conference on Statistical Physics "StatPhys27"  ( Buenos Aires, Argentina )   2019年7月  Local Organizing Committee, IUPAP C3 Commission

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 2次元円形プール内における枯草菌集団運動の動的転移

    梅田大, 本田良二郎, 成塚拓真, 脇田順一

    日本物理学会 第74回年次大会  ( 九州大学伊都キャンパス )   2019年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    棒状の菌B. subtilisは寒天培地上に作成した円形プール内において様々な振る舞いを示す。その振る舞いはプールの直径に対する菌体長の比λとプール内の菌密度ρに依存するとされており、特にλについては二つの閾値の存在が定性的に確認されている。今回その内の大きい方の閾値について、トラッキングとPIVを用い、菌単体と集団における周方向秩序パラメータを定義した。その結果秩序パラメータの急激な変化が確認された。

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  • ガラス棒破壊における破片のアスペクト比分布

    白尾陸, 成塚拓真, 脇田順一

    日本物理学会 第74回年次大会  ( 九州大学伊都キャンパス )   2019年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

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  • Ordering Mechanism of Collective Motion of Bacterial cells in a Shallow Circular Pool 国際会議

    本田良二郎, 脇田順一

    International Conference on APEF2018  ( 於:伊藤国際学術研究センター・東京大学 )   2018年11月  APEF2018 Conference Organizing Committee

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • Dynamical Phase Transitions of Collective Motion of Bacterial Cells in a Shallow Circular Pool 国際会議

    脇田順一, 本田良二郎

    International Conference on APEF2018  ( 伊藤国際学術研究センター・東京大学 )   2018年11月  APEF2018 Conference Organizing Committee

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • 枯草菌DBMコロニーの螺旋成長

    西岡瑞穂, 成塚拓真, 脇田順一

    日本物理学会 2018年秋季大会  ( 同志社大学京田辺キャンパス )   2018年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

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  • 円形プール内における低密度での細菌集団の速度場の解析

    本田良二郎, 脇田順一

    日本物理学会 第73回年次大会  ( 東京理科大学野田キャンパス )   2018年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 円形プール内におけるバクテリア細胞の運動の解析

    本田良二郎, 脇田順一

    日本物理学会 2017年秋季大会  ( 岩手大学上田キャンパス )   2017年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 円形プール内におけるバクテリア集団運動の時系列解析

    脇田順一, 本田良二郎, 成塚拓真

    日本物理学会 2017年秋季大会  ( 岩手大学上田キャンパス )   2017年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 円形プール内における換算菌体長の異なるバクテリア細胞の運動の解析

    本田良二郎, 脇田順一

    日本物理学会 第71回年次大会  ( 大阪大学豊中キャンパス )   2017年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 円形プール内で集団運動するバクテリアの速度場解析

    原田翔平, 本田良二郎, 山本健, 脇田順一

    日本物理学会 第72回年次大会  ( 大阪大学豊中キャンパス )   2017年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • ガラス棒破片質量分布の直径依存性

    小野慎介, 山本健, 脇田順一

    日本物理学会 第72回年会  ( 大阪大学豊中キャンパス )   2017年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • バクテリア成長の現象論モデルの解析と菌体長の対数正規性の検証

    山本健, 脇田順一

    日本物理学会 2016年秋季大会  ( 金沢大学角間キャンパス )   2016年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 寒天平板上におけるNaCl結晶の周期的先端分岐パターン

    脇田順一, 今井景佑, 山本健, 山崎義弘

    日本物理学会 2016年秋季大会  ( 金沢大学角間キャンパス )   2016年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Self-Elongation with Sequential Folding of a Filament of Bacterial Cells 国際会議

    本田良二郎, 脇田順一, 香取眞理

    STATPHYS26  ( 18-22 Jul, Centre de Congrès de Lyon, France )   2016年7月 

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • Phase Diagram of Collective Motion of Bacterial Cells 国際会議

    脇田順一, 山本健, 本田良二郎, 香取眞理

    STATPHYS26  ( 18-22 Jul, Centre de Congrès de Lyon, France )   2016年7月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 大腸菌の同心円状コロニーにおける菌体長分布

    竹内光, 山本健, 脇田順一

    日本物理学会 第71回年次大会  ( 東北学院大学泉キャンパス )   2016年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • バクテリアの紐状成長における複雑な折り畳み過程の定量化 招待

    脇田順一, 本田良二郎, 香取眞理

    日本物理学会 第71回年次大会 フレンドシップ・ミーティング  ( 東北学院大学泉キャンパス )   2016年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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  • 寒天平板上におけるNaCl結晶成長のモルフォロジー・ダイアグラム

    今井景佑, 山本健, 脇田順一

    日本物理学会 2015年秋季大会  ( 関西大学千里山キャンパス )   2015年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 非線形微分方程式によるバクテリアの初期成長過程の解析

    本田良二郎, 脇田順一, 香取眞理

    日本物理学会 2015年秋季大会  ( 関西大学千里山キャンパス )   2015年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 円形プール内におけるバクテリア集団運動の相図

    脇田順一, 塚本翔太, 山本健, 香取眞理

    日本物理学会 2015年秋季大会  ( 関西大学千里山キャンパス )   2015年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 寒天平板上におけるNaCl結晶成長

    今井景佑, 山本健, 脇田順一

    日本物理学会 第70回年次大会  ( 早稲田大学早稲田キャンパス )   2015年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • バクテリアのひも状成長にみられるパターン

    本田良二郎, 脇田順一, 香取眞理

    日本物理学会 第70回年次大会  ( 早稲田大学早稲田キャンパス )   2015年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 2次元円形プール内のバクテリア集団運動 国際会議

    脇田順一, 塚本翔太, 山本健, 香取眞理

    International Conference on Mathematical Modeling and Applications - Crowd Dynamics  ( 明治大学中野キャンパス )   2015年1月 

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • 表面環境におけるバクテリア集団運動 招待

    脇田順一

    Workshop 'Fluctuation and Correlation in Stochastic Systems'  ( 中央大学後楽園キャンパス )   2014年10月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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  • 2次元円形プール内におけるバクテリア集団運動

    塚本翔太, 山本健, 香取眞理, 脇田順一

    日本物理学会 2014年秋季大会  ( 中部大学春日井キャンパス )   2014年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • セラチア菌コロニーの周期的成長機構

    石塚裕輝, 山本健, 脇田順一

    日本物理学会 第69回年次大会  ( 東海大学湘南キャンパス )   2014年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 大腸菌コロニーの周期的成長パターンに潜むサイズ分布

    杉山真也, 山本健, 脇田順一

    日本物理学会 第69回年次大会  ( 東海大学湘南キャンパス )   2014年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • NaCl結晶のモルフォロジーダイアグラム及び先端振動成長

    長谷井裕樹, 山本健, 脇田順一

    日本物理学会 第69回年次大会  ( 東海大学湘南キャンパス )   2014年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 枯草菌のひも状成長によるコロニー形成

    脇田順一, 山本健, 松下貢

    日本物理学会 2013年秋季大会  ( 徳島大学常三島キャンパス )   2013年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 円周上のTASEPとバクテリアの円運動観察

    山田泰之, 香取眞理, 脇田順一

    日本物理学会 第68回年次大会  ( 広島大学東広島キャンパス )   2013年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • バクテリアの時空パターンとモアレ錯視

    小林奈央樹, 脇田順一, 森山修, 山崎義弘, 杉原厚吉, 松下貢

    日本物理学会 第68回年次大会  ( 広島大学東広島キャンパス )   2013年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 枯草菌DBMコロニーの枝幅・枝間隔分布

    脇田順一, 山本健, 小林奈央樹, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 第68回年次大会  ( 広島大学東広島キャンパス )   2013年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • B. subtilisコロニーの同心円状リングパターン成長機構

    熊田龍人, 有馬美奈, 脇田順一, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 第68回年次大会  ( 広島大学東広島キャンパス )   2013年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 緑膿菌コロニーの周期的成長パターン

    有馬美奈, 熊田龍人, 脇田順一, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 第68回年次大会  ( 広島大学東広島キャンパス )   2013年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 薄膜状になったアスコルビン酸溶液の流動性と周期的結晶成長

    山崎義弘, 戸田昭彦, 脇田順一, 菊池光修, 石井秀弥, 松下貢

    日本物理学会 第68回年次大会  ( 広島大学東広島キャンパス )   2013年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 宇宙マイクロ波背景放射のパーコレーション解析

    樋口真哉, 小林奈央樹, 脇田順一, 山崎義弘, 國仲寛人, 香取眞理, 松下貢, 松下聡樹, Lung-Yih Chiang

    日本物理学会 第67回年次大会  ( 関西学院大学西宮上ヶ原キャンパス )   2012年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 身長と体重に見られる統計分布の特性

    佐藤勇太, 脇田順一, 松下貢

    日本物理学会 第67回年次大会  ( 関西学院大学西宮上ヶ原キャンパス )   2012年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • B. subtilisの同心円状リングパターン

    熊田龍人, 有馬美奈, 脇田順一, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 第67回年次大会  ( 関西学院大学西宮上ヶ原キャンパス )   2012年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 緑膿菌コロニーのパターン形成

    有馬美奈, 熊田龍人, 脇田順一, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 第67回年次大会  ( 関西学院大学西宮上ヶ原キャンパス )   2012年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 枯草菌DBMコロニーの枝幅分布(3)

    脇田順一, 有馬美奈, 熊田龍人, 小林奈央樹, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 第67回年次大会  ( 関西学院大学西宮上ヶ原キャンパス )   2012年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 枯草菌DBMコロニーの枝幅分布(2)

    脇田順一, 小林奈央樹, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 2011年秋季大会  ( 富山大学五福キャンパス )   2011年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 緑膿菌コロニーの周期的成長パターン

    柳川愉恵, 脇田順一, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 第66回年次大会  ( 新潟大学五十嵐キャンパス )   2011年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 枯草菌DBMコロニーの枝幅分布

    脇田順一, 柳川愉恵, 小林奈央樹, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 第66回年次大会  ( 新潟大学五十嵐キャンパス )   2011年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Bacillus subtilisコロニーにみられるサイズ分布

    脇田順一, 柳川愉恵, 松山東平, 松下貢

    基研研究会2010 非平衡系の物理-非平衡ゆらぎと集団挙動(11/18-20)  ( 湯川記念館パナソニックホール )   2010年11月 

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    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

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  • Pattern Formation of Bacterial Colonies 招待

    脇田順一

    日本生物物理学会 第48回年会  ( 東北大学仙台キャンパス )   2010年9月  日本生物物理学会

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    記述言語:英語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(指名)  

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  • 大腸菌コロニーの形態形成における走化性の影響

    江原幸枝, 吉野哲雄, 殿村幸彦, 時田理恵, 加藤高基, 前多裕介, 脇田順一, 松山東平, 佐野雅巳, 松下貢

    日本物理学会 第65回年次大会  ( 岡山大学津島キャンパス )   2010年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • P. mirabilisの同心円状パターン(2)

    殿村幸彦, 江原幸枝, 吉野哲雄, 脇田順一, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 第65回年次大会  ( 岡山大学津島キャンパス )   2010年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 大腸菌コロニーの周期的成長パターン(2)

    吉野哲雄, 江原幸枝, 殿村幸彦, 時田理恵, 加藤高基, 脇田順一, 前多裕介, 佐野雅巳, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 第65回年次大会  ( 岡山大学津島キャンパス )   2010年3月  日本物理学会

     詳細を見る

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 枯草菌のサイズ分布(3)

    脇田順一, 國仲寛人, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 第65回年次大会  ( 岡山大学津島キャンパス )   2010年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Size Distribution of Bacterial Cells in Homogeneously Spreading Disk-like Colonies by B. subtilis 国際会議

    J. Wakita, T. Matsuyama, M. Matsushita

    the 9th Asia-Pacific Complex Systems Conference (4-7 Nov)  ( Tokyo, Japan )   2009年11月 

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • Concentric-ring-like Colony of P. mirabilis 国際会議

    S. Tonomura, S. Ebara, T. Yoshino, J. Wakita, T. Matsuyama, M. Matsushita

    the 9th Asia-Pacific Complex Systems Conference (4-7 Nov)  ( Tokyo, Japan )   2009年11月 

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • Concentric-ring pattern formation of bacterial colonies of Escherichia coli 国際会議

    T. Yoshino, S. Ebara, S. Tonomura, R. Tokita, T. Katoh, Y. Maeda, J. Wakita, M. Sano, T. Matsuyama, M. Matsushita

    the 9th Asia-Pacific Complex Systems Conference (4-7 Nov)  ( Tokyo, Japan )   2009年11月 

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • Pattern Formation of Bacterial Colonies by Escherichia coli 国際会議

    S. Ebara, T. Yoshino, S. Tonomura, R. Tokita, T. Kato, Y. Maeda, J. Wakita, M. Sano, T. Matsuyama, M. Matsushita

    the 9th Asia-Pacific Complex Systems Conference (4-7 Nov)  ( Tokyo, Japan )   2009年11月 

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • 大腸菌コロニーの形態形成

    江原幸枝, 吉野哲雄, 殿村幸彦, 時田理恵, 加藤高基, 前多裕介, 脇田順一, 松山東平, 佐野雅巳, 松下貢

    日本物理学会 2009年秋季大会  ( 熊本大学黒髪キャンパス )   2009年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 大腸菌コロニーの周期的成長パターン

    吉野哲雄, 江原幸枝, 殿村幸彦, 時田理恵, 加藤高基, 脇田順一, 前多裕介, 佐野雅巳, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 2009年秋季大会  ( 熊本大学黒髪キャンパス )   2009年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 枯草菌のサイズ分布(2)

    脇田順一, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 2009年秋季大会  ( 熊本大学黒髪キャンパス )   2009年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • P. mirabilisの同心円状パターン

    殿村幸彦, 江原幸枝, 吉野哲雄, 脇田順一, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 2009年秋季大会  ( 熊本大学黒髪キャンパス )   2009年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 枯草菌のサイズ分布

    脇田順一, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 第64回年次大会  ( 立教大学、立教池袋中学・高校 )   2009年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 緑膿菌コロニーのパターン形成

    小谷野真利子, 脇田順一, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 第64回年次大会  ( 立教大学、立教池袋中学・高校 )   2009年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • B. subtilisディスク状コロニーの微視的観察(3)

    脇田順一, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 2008年秋季大会  ( 岩手大学上田キャンパス )   2008年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • B. subtilisディスク状コロニーの微視的観察(2)

    脇田順一, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 第63回年次大会  ( 近畿大学本部キャンパス )   2008年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 大腸菌コロニーのパターン形成(2)

    時田理恵, 加藤高基, 前多裕介, 脇田順一, 佐野雅巳, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 第63回年次大会  ( 近畿大学本部キャンパス )   2008年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • B. subtilisディスク状コロニーの微視的観察

    脇田順一, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 第62回年次大会  ( 北海道大学札幌キャンパス )   2007年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 大腸菌コロニーのパターン形成

    時田理恵, 加藤高基, 前多裕介, 脇田順一, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 第62回年次大会  ( 北海道大学札幌キャンパス )   2007年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • バクテリア・コロニー(B. subtilis)の周期的パターン

    脇田順一, Ismael Rafols, 富樫千尋, 荒井大知, 伊藤裕人, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 1999年秋季大会  ( 岩手大学 )   1999年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • バクテリア増殖における同心円状コロニーの形成Ⅲ

    伊藤裕人, 脇田順一, 渡辺一彦, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 1999年秋季大会  ( 岩手大学 )   1999年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Periodic Growth of Bacillus subtilis Colonies 国際会議

    J. Wakita, I. Rafols, H. Itoh, T. Matsuyama, M. Matsushita

    Ixth INTERNATIONAL CONGRESS OF BACTERIOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY (16-20 Aug)  ( Sydney, Australia )   1999年8月 

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • Formation of Periodic Ring Pattern by Bacteria Proteus mirabilis 国際会議

    H. Itoh, J. Wakita, T. Matsuyama, M. Matsushita

    Ixth INTERNATIONAL CONGRESS OF BACTERIOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY (16-20 Aug)  ( Sydney, Australia )   1999年8月 

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • バクテリア増殖による同心円状コロニーの形成Ⅱ

    伊藤裕人, 脇田順一, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 1998年秋季大会  ( 琉球大学、沖縄国際大学 )   1998年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Formation of Dense-Branching-Morphology-like Colonies in Bacteria 国際会議

    J. Wakita, I. Rafols, H. Itoh, T. Matsuyama, M. Matsushita

    STATPHYS 20 (20-25 Jul)  ( The UNESCO Center, Paris )   1998年7月 

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • Characterization of Concentric Ring Patterns in Bacterial Colonies 国際会議

    I. Rafols, J. Wakita, T. Matsuyama, M. Matsushita

    XV Sitges Conference on Statistical Mechanics (8-12 Jun)  ( Sitges, Barcelona, Spain )   1998年6月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • バクテリアコロニーのDBM的パターン形成機構

    脇田順一, Ismael Rafols, 伊藤裕人, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 第53回年次大会  ( 東邦大学、日本大学 )   1998年4月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • バクテリア増殖による同心円状コロニーの形成

    伊藤裕人, Ismael Rafols, 脇田順一, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 第53回年次大会  ( 東邦大学、日本大学 )   1998年4月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Pattern Formation in Bacterial Colonies and Its Modelling 招待 国際会議

    M. Matsushita, J. Wakita, H. Itoh, I. Rafols, T. Matsuyamah, H. Sakaguchi, M. Mimura

    2nd Tohwa International Meeting on Statistical Physics (4-7 Nov, 1997)  ( Fukuoka, Japan )   1997年11月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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  • Experimental Study of Concentric Ring Patterns in Bacterial Colonies 国際会議

    I. Rafols, J. Wakita, H. Itoh, T. Matsuyama, M. Matsushita

    2nd Tohwa International Meeting on Statistical Physics (4-7 Nov, 1997)  ( Fukuoka, Japan )   1997年11月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Characterization of Ring Patterns in Bacterial Colonies

    Ismael Rafols, 脇田順一, 伊藤裕人, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会1997年秋季大会  ( 神戸大学 )   1997年10月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • バクテリア・コロニーの形態形成 招待

    脇田順一

    第2回WAKOつくばフォーラム  ( 筑波和光ホール )   1997年5月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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  • 細菌コロニー(B. subtilis)のDBMパターンとリングパターン形成機構

    脇田順一, Ismael Rafols, 伊藤裕人, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 第52回年次大会  ( 名城大学 )   1997年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 細菌コロニーの成長界面における自己アフィン性Ⅱ

    伊藤裕人, 脇田順一, 松山東平, 松下貢

    日本物理学会 第52回年次大会  ( 名城大学 )   1997年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Interface Growth and Pattern Formation in Bacterial Colonies 招待 国際会議

    M. Matsushita, J. Wakita, H. Itoh, I. Rafols, T. Matsuyama, H. Sakaguchi, M. Mimura

    5th Bar-Ilan Conference on Frontiers Condensed Matter Physics (31 March-3 April, 1997)  ( Ramat- Gan, Israel )   1997年3月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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  • バクテリアコロニー成長におけるサーファクタントの影響

    脇田順一, 伊藤裕人, 中原明生, 松下貢, 松山東平

    日本物理学会 1995年秋季大会  ( 大阪府立大学 )   1995年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • バクテリア(P.mirabilis)によるリングパターンと時空パターンの形成

    中原明生, 島田祐二, 森山修, 脇田順一, 松下貢, 松山東平

    日本物理学会 1995年秋季大会  ( 大阪府立大学 )   1995年9月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • バクテリア増殖によるパターン形成(サーファクタントの影響)

    脇田順一, 中原明生, 松下貢, 松山東平

    日本物理学会 第50回年次大会  ( 神奈川大学横浜キャンパス )   1995年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 細菌コロニーの成長界面における自己アフィン性

    伊藤裕人, 中藤徳和, 脇田順一, 中原明生, 松下貢, 松山東平

    日本物理学会 第50回年次大会  ( 神奈川大学横浜キャンパス )   1995年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Growth Dynamics of Bacterial Colonies and Their Morphological Change 招待 国際会議

    M. Matsushita, J. Wakita, K. Komatsu, A. Nakahara, T. Matsuyama

    International Conference on Dynamical Systems and Chaos (23-27 May, 1994)  ( Tokyo, Japan )   1994年5月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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  • バクテリア増殖によるパターン形成

    小松賢治, 脇田順一, 中原明生, 松下貢, 松山東平

    日本物理学会 第49回年次大会  ( 福岡工業大学 )   1994年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Growth and Morphological Changes of Bacteria Colonies 招待 国際会議

    M. Matsushita, J. Wakita, T. Matsuyama

    NATO Advanced Research Workshop, Santa Fe Institute Studies in the Sciences of Complexity (13-17 Apr, 1993).  ( Santa Fe, NM )   1993年4月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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  • バクテリア増殖によるパターン形成

    脇田順一, 小松賢治, 松下貢, 川崎廣吉, 重定南奈子

    日本物理学会 第48回年次大会  ( 東北大学仙台キャンパス )   1993年3月  日本物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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受賞

  • JPSJ Papers of Editors's Choice

    2015年10月   日本物理学会   Self-Elongation with Sequential Folding of Filament of Bacterial Cells

    本田良二郎, 脇田順一, 香取眞理

共同研究・競争的資金等の研究課題

  • 2次元円形プール内における細菌集団運動

    2015年4月 - 2018年3月

    文部科学省  科学研究費補助金(日本学術振興会・文部科学省)-挑戦的萌芽研究 

    脇田 順一

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    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

    配分額:2730000円

    生物集団が示す様々なタイプの時空間的振る舞いは、生物科学に限らず物理学や数学の分野の研究者の注目を集めている。本研究では、円形プール内における細菌の集団運動に着目し、その振る舞いを統計物理学の立場から明らかにすることを目的とする。

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担当経験のある科目(授業)

  • 環境・生命科学概論

    機関名:中央大学

  • パターン形成物理学特論第二

    機関名:中央大学

  • パターン形成物理学特論第一

    機関名:中央大学

  • 電磁気学及演習1

    機関名:中央大学

  • 統計力学及演習1

    機関名:中央大学

  • 物理数学及演習2

    機関名:中央大学

  • 複雑系物理学

    機関名:中央大学

  • 現代物理学序論

    機関名:中央大学

  • エレクトロニクス

    機関名:中央大学

  • 物理情報計測

    機関名:中央大学

  • 物理2

    機関名:中央大学

  • 物理1(既修)

    機関名:中央大学

  • 物理実験

    機関名:中央大学

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